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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
05/02/2015 |
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Data da última atualização: |
18/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA JUNIOR, G.; REY, F. S. B.; GIACHETTO, P. F.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; FERRAZ, J. B. S. |
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Afiliação: |
MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; RUI DA SILVA VERNEQUE, CNPGL. |
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Título: |
Descriptive analysis of copy number variation regions in a population of dairy Gyr cattle. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: American Society of Animal Science, 2014. |
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Páginas: |
3 p. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this work was to investigate, based on a high density BovineHD SNP array, the abundance and distributions of CNVs and CNVR in a Gyr cattle population from Brazil. Genotype data of representative bulls were recorded, totaling 476 Gyr animals. For CNV identification was used the PennCNV software and the CNVRs were determined by the CNVRuler software. A total of 26,672 CNVs were found, beingon average 62 CNV per animal. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes with 96% of these between 1.1 Kb to 100 Kb. The Ensembl's VEP tool, using the CNVRs information as input, found 913 coding regions, suggesting that exon regions were duplicated. In summary, the results help to better understand the Gyr genome and suggest that CNVRs might have some relationship with production traits. |
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Palavras-Chave: |
Polimorfismo de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Bovino; Gado de corte; Gado Zebu. |
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Thesaurus Nal: |
Cattle; Dairy cattle; Genomics; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/120107/1/SP-6581.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117316/1/WCGALPMV.pdf
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Marc: |
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520 $aThe aim of this work was to investigate, based on a high density BovineHD SNP array, the abundance and distributions of CNVs and CNVR in a Gyr cattle population from Brazil. Genotype data of representative bulls were recorded, totaling 476 Gyr animals. For CNV identification was used the PennCNV software and the CNVRs were determined by the CNVRuler software. A total of 26,672 CNVs were found, beingon average 62 CNV per animal. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes with 96% of these between 1.1 Kb to 100 Kb. The Ensembl's VEP tool, using the CNVRs information as input, found 913 coding regions, suggesting that exon regions were duplicated. In summary, the results help to better understand the Gyr genome and suggest that CNVRs might have some relationship with production traits.
650 $aCattle
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650 $aGenomics
650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aBos Indicus
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653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único
700 1 $aOLIVEIRA JUNIOR, G.
700 1 $aREY, F. S. B.
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aVERNEQUE, R. da S.
700 1 $aFERRAZ, J. B. S.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agrobiologia. Para informações adicionais entre em contato com cnpab.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
27/06/1995 |
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Data da última atualização: |
27/06/1995 |
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Autoria: |
DIAS, L. E.; FRANCO, A. A.; CAMPELLO, E. F. C. |
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Título: |
Dinâmica de matéria orgânica e de nutrientes em solo degradado pela extração de bauxita e cultivado com Eucalyptus pellita e Acacia mangium. |
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Ano de publicação: |
1994 |
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Fonte/Imprenta: |
In: M. Balensiefer, A.J. de Araujo & N.C. Rosot, eds. In: I Simposio Sul-Americano e II Simposio Nacional Recuperacao de Areas Degradadas, Foz do Iguacu, Parana.. FUPEF, 1994. |
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Páginas: |
p.515-525. |
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Idioma: |
Português |
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Palavras-Chave: |
UAPNPBS. |
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Thesagro: |
Árvore; Leguminosa; Mineralização; Recuperação do Solo. |
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Thesaurus NAL: |
Acacia mangium; Eucalyptus pellita. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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653 $aUAPNPBS
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773 $tIn: M. Balensiefer, A.J. de Araujo & N.C. Rosot, eds. In: I Simposio Sul-Americano e II Simposio Nacional Recuperacao de Areas Degradadas, Foz do Iguacu, Parana.. FUPEF, 1994.
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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