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Biblioteca(s):  Embrapa Florestas.
Data corrente:  18/01/2017
Data da última atualização:  18/01/2017
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  RESENDE, M. D. V. de.
Afiliação:  MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF.
Título:  Software Selegen-REML/BLUP: a useful tool for plant breeding.
Ano de publicação:  2016
Fonte/Imprenta:  Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, MG, v. 16, n. 4, p. 330-339, Oct./Dec. 2016.
DOI:  http://dx.doi.org/10.1590/1984-70332016v16n4a49
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The software Selegen-REML/BLUP uses mixed models, and was developed to optimize the routine of plant breeding programs. It addresses the following plants categories: allogamous, automagous, of mixed mating system, and of clonal propagation. It considers several experimental designs, mating designs, genotype x environment interaction, experiments repeated over sites, repeated measures, progenies belonging to several populations, among other factors. The software adjusts effects, estimates variance components, genetic additive, dominance and genotypic values of individuals, genetic gain with selection, effective population size, and other parameters of interest to plant breeding. It allows testing the significance of the effects by means of likelihood ratio test (LRT) and analysis of deviance. It addresses continuous variables (linear models) and categorical variables (generalized linear models). Selegen-REML/ BLUP is friendly, easy to use and interpret, and allows dealing efficiently with most of the situations in plant breeding. It is free and available at http://www. det.ufv.br/ppestbio/corpo_docente.php under the author?s name.
Palavras-Chave:  BLUP; Linear mixed models; Melhoramento genético; Modelos mixtos lineares; REML; Selection; Variance components.
Thesaurus Nal:  Plant breeding.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/153467/1/2016-M.Deon-CBAB-Software.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Florestas (CNPF)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPF55556 - 1UPCAP - DD
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21.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Modelos computacionais BLUP. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 206-225.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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22.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Modelos computacionais reduzidos e equivalentes para o BLUP/REML individual no melhoramento de plantas perenes. Colombo: Embrapa Florestas, 2001. 33 p. (Embrapa Florestas. Documentos, 61).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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23.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Modelos lineares. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 130-205.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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24.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Modelos multivariados. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 257-311.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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25.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Melhoramento de espécies perenes. In: NASS, L. L.; VALOIS, A. C. C.; MELO, I. S. de; VALADARES-INGLIS, M. C. (Ed.). Recursos genéticos e melhoramento: plantas. Rondonópolis: Fundação MT, 2001. p. 357-421.
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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26.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Melhoramento de essências florestais. In: BORÉM, A. (Ed.). Melhoramento de espécies cultivadas. Viçosa, MG: Ed. da UFV, 1999. p. 589-647
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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27.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Matemática e estatística na análise de experimentos e no melhoramento genético. Colombo: Embrapa Florestas, 2007. 561 p.
Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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28.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Matemática. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 7-55.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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29.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Software SELEGEN - REML/BLUP. Colombo: Embrapa Florestas, 2002. 67 p. (Embrapa Florestas. Documentos, 77).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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30.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de. Software Selegen-REML/BLUP: a useful tool for plant breeding. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, MG, v. 16, n. 4, p. 330-339, Oct./Dec. 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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31.Imagem marcado/desmarcadoSIMIQUELI; RESENDE, M. D. V. de. Entropy and mutual information in genome-wide selection: the splitting of k-fold cross-validation sets and implications for tree breeding. Tree Genetics & Genomes, v. 16, article number 37, 2020. 14 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Florestas.
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32.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; BIELE, J. Estimação e predição em modelos lineares generalizados mistos com variáveis binomiais. Revista de Matemática e Estatística, São Paulo, v. 20, p. 39-65, 2002. Papel
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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33.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; VENCOVSKUY, R. Condução e utilização de bancos de conservação genetica de especies de eucalipto. Silvicultura, São Paulo, v. 12 , n. 42, t. 3, p. 434-439, 1992. Edição dos Anais do Congresso Florestal Brasileiro, 6., 1990, Campos do Jordão.
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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34.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; THOMPSON, R. Factor analytic multiplicative mixed models in the analysis of multi-environment forest field trials. In: EUCALYPTUS IN A CHANGING WORLD: international IUFRO conference of the WP2.08.03 on silviculture and improvement of eucalypts, 2004, Aveiro. Proceedings. Aveiro: RAIZ - Instituto de Investigação da Floresta e Papel, 2004. p. 123-129. Edited by N. Borralho.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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35.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; THOMPSON, R. Factor analytic multiplicative mixed models in the analysis of multiple experiments. Revista de Matemática e Estatística, São Paulo, v. 22, n. 2, p. 31-52, maio/ago. 2004.
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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36.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de. Genomic selection in forest tree breeding. Tree Genetics & Genomes, v. 7, n. 2, p. 241-255, Apr. 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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37.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; THOMPSON, R. Multivariate spatial statistical analysis of multiple experiments and longitudinal data. Colombo: Embrapa Florestas, 2003. 126 p. (Embrapa Florestas. Documentos, 90).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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38.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de. Twenty years of Eucalyptus molecular breeding: from discrete marker-trait associations to whole-genome prediction of complex traits. In: IUFRO CONFERENCE ON IMPROVEMENT AND CULTURE OF EUCALYPTS, 2011, Porto Seguro. Proceedings... Piracicaba: ESALQ, 2011. p. 33-36.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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39.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de. Twenty years of Eucalyptus molecular breeding: from discrete marker-trait associations to whole-genome prediction of complex traits. In: IUFRO CONFERENCE ON IMPROVEMENT AND CULTURE OF EUCALYPTS, 2011, Porto Seguro. Proceedings... Piracicaba: ESALQ, 2011. p. 33-36.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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40.Imagem marcado/desmarcadoSTURION, J. A.; RESENDE, M. D. V. de. Avaliação genética e análise de deviance em um teste desbalanceado de procedência e progênie de Ilex paraguariensis. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 30, n. 62, p. 157-160, maio/jul. 2010. Nota científica.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica
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