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Biblioteca(s): | Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente: | 24/04/2006
Data da última atualização: | 17/01/2020
Autoria: | SANTOS, M. T.; KNEGT, F. H. P.; FERRAZ, L. F. C.; REIS, F. C.; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G.; OTTOBONI, L. M. M.
Afiliação: | Unicamp; Unicamp; Unicamp; Unicamp; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; GORAN NESIC, CNPTIA; Unicamp.
Título: | Modelagem molecular por homologia da enzima DHBP sintase de Acidithiobacillus ferrooxidans.
Ano de publicação: | 2005
Fonte/Imprenta: | In: CONGRESSO ABERTO AOS ESTUDANTES DE BIOLOGIA, 7., 2005, Campinas. Caderno... Campinas: Unicamp, Instituto de Biologia, 2005. p. 45.
Idioma: | Português
Notas: | Evento conhecido também como: CAEB. Na publicação: Falcão, P. K.
Conteúdo: | Acidithiobacullus ferrooxidans é uma bactéria Gram-negativa de importância econômica, envolvida na biolixiviação de metais. A biolixiviação pode ser afetada por fatores como a privação de fosfato. Curvas de crescimento mostraram que o crescimento é afetado quando a bactéria é cultivada na ausência de fosfato (K2HPO4). A análise da expressão diferencial de genes, através de RAP-PCR, utilizando RNA isolado de células cultivadas na presença (controle) e na ausência de K2HPO4, permitiu o isolamento de um cDNA com expressão mais acentuada na ausência de fosfato. A seqüência desse cDNA apresentou similaridade com o gene ribB que codifica a enzima 3,4-dihidroxi-2-butanona 4-fosfato sintase (DHBP sintase) envolvida na síntese de ribofiavina. Utilizando o programa de modelagem MODELLER foi construído um modelo 3D da enzima DHBP sintase, com base em um molde 60% homólogo. A análise estrutural está sendo feita com o auxílio do programa Gold STING. O modelo é composto por 10 estruturas em alfa-hélice periféricas e contém 8 folhas-beta internas, cujos resíduos são distribuídos da seguinte forma: 49,3% bidrofóbicos, 20,9% polares, 27,5% carregados e 2,3% cisteínas. Vinte e dois aminoácidos previamente descritos como altamente conservados em seqüências de DHBP sintase de diferentes organismos, foram encontrados na mesma posição conservada no modelo da enzima em A. ferrooxidans. Desses, 14 estão envolvidos com ação de catalise e 8 na manutenção da estrutura.
Palavras-Chave: | Modelagem molecular.
Thesagro: | Bactéria.
Thesaurus Nal: | Acidithiobacillus ferrooxidans.
Categoria do assunto: | --
Registro original: | Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)

Exemplares:

CNPTIA - (11135-1) - UPC - RA - -- -  -  - 2006.00021 - DES
CNPTIA - (11135-2) - UPC - RA - DD -  -  -  - DIS