Data/hora: 23/09/2024 00:19:27

Biblioteca(s): 	Embrapa Agricultura Digital.	
Data corrente: 	14/03/2012	
Data da última atualização: 	14/03/2012	
Autoria: 	HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. de A. C.	
Afiliação: 	ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MAURíCIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; POLYANA CRISTINE TIZIOTO, UFSCar; LUCIANA DE ALMEIDA CORREIA REGITANO, CPPSE.	
Título: 	RPaternity. Versão 1.0.	
Ano de publicação: 	2011	
Fonte/Imprenta: 	Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011.	
Descrição Física: 	1 CD-ROM.	
Idioma: 	Português	
Conteúdo: 	O RPaternity implementa um método para exclusão de paternidade utilizando como marcadores polimorfismos de base única. Ele é escrito em linguagem R e pressupõe que a genotipagem foi feita por meio da plataforma Illumina Beadchip. O método implementado pode ser encontrado na referência [1] e consiste no cálculo da probabilidade de exclusão, baseado em inconsistências mendelianas entre os genótipos do suposto pai (e mãe) e filho e as frequencias alélicas verificadas na população. Considera-se nos cálculos a particular situação em que o possível pai pode ser um parente próximo do pai verdadeiro, o que constitui uma necessidade no caso de análises de dados de melhoramento animal. Dado uma população genotipada, o software permite que sejam selecionados o conjunto de marcadores mais informativos para a realização de testes de exclusão de paternidade e, a partir deste conjunto de marcadores, realizar testes em batch (lista de supostos pais x lista de filhos, todos x todos).	
Palavras-Chave: 	Exclusão de paternidade; Polimorfismos de base única; Software.	
Thesaurus Nal: 	Paternity; Single nucleotide polymorphism.	
Categoria do assunto: 	X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia	
Registro original: 	Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)	
Exemplares: 	CNPTIA - (16536-1) - UMT - SW - CD - RPATERNITY_1.0 -  - 2012.00053 - DIS