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| Registros recuperados : 24 | |
| 2. |  | KUBOTA, T. M. K.; MILORI, D. M. B. P.; BOAS, P. R. V.; RANULFI, A. C. Utilização do equipamento Photon-citrus para a montagem de classificadores capazes de realizar o diagnóstico de HLB (greening). In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 5., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação , 2013. p. 31 Editado por Ana Rita de Araújo Nogueira, Simone Cristina Méo Niciura. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 110).| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 3. | | KUBOTA, T. M. K.; RANULFI, A. C.; MAGALHÃES, A. B.; VILLAS-BOAS, P. R.; MILORI, D. M. B. P. Acompanhamento de árvores de citros no campo utilizando o photon-citrus para avaliação de precocidade de diagnóstico de HLB (greening). In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 49. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 57).| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 4. | | SILVA, D. C. da; RANULFI, A. C.; RABELLO, G. C.; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P. Caracterização de folhas de citros utilizando imagens de fluorescência visando o diagnóstico de HLB (Greening). In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 5., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação , 2013. p. 22 Editado por Ana Rita de Araújo Nogueira, Simone Cristina Méo Niciura. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 110).| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 6. | | KUBOTA, T. M. K.; MAGALHÃES, A. B.; RANULFI, A. C.; BOAS, P. R. V.; PEREIRA, D. M. B. Estudo de imagens de fluorescência e espectroscopia de fluorescência induzida por laser (LIFS) para o diagnóstico de doença na lavoura de soja In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p.30. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 7. | | RANULFI, A. C.; SENESI, G. S.; CAETANO, J. B.; MEYER, M. C.; MAGALHÃES, A. B.; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P. Nutritional characterization of healthy and Aphelenchoides besseyi infected soybean leaves by laser-induced breakdown spectroscopy (LIBS). Microchemical Journal, v. 141, p. 118-126, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 9. | | RANULFI, A. C.; ROMANO, R. A.; MAGALHÃES, A. B.; FERREIRA, E. J.; VILLAS-BOAS, P. R.; MILORI, D. M. B. P. Nutritional evaluation of healthy and hlb infected citrus leaves through laser induced breakdown spectroscopy: a statistical aprroach. In: WORKSHOP SOBRE LASER EM QUÍMICA ANALÍTICA, 2., 2015, São Carlos. Livro de resumos... São Carlos: UFSCar; Embrapa Instrumentação, 2015. p. 28.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 10. | | RANULFI, A. C.; KUBOTTA, T. M. K.; SILVA, D. C. da; RABELLO, G. C.; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P. Avaliação da utilização da técnica de espectroscopia de fluorescência induzida por laser na detecção de doenças em citros. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 5., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação , 2013. p. 19 Editado por Ana Rita de Araújo Nogueira, Simone Cristina Méo Niciura. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 110).| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 11. | | CAETANO, J. B.; KUBOTA, T. M. K.; RANULFI, A. C.; MAGALHÃES, A. B.; BOAS, P. R. V.; PEREIRA, D. M. B. Avaliação da variação do perfil nutricional da soja em estresse biótico (Soja louca II) utilizando a espectroscopia LIBS In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p.23. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 12. | | RANULFI, A. C. MAGALHAES, A. B. ROMANO, R. A.; FERREIRA, E. J.; VILLAS-BOAS, P. R.; MILORI, D. M. B. P. Avaliação da técnica de espectroscopia de emissão óptica com plasma induzido por laser (LIBS) no estudo de doenças em citros: HLB (greening) e cancro cítrico. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 273-276. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 13. | | RABELLO, G. C.; RANULFI, A. C.; SILVA, J. T. B. da; SILVA, D. C. da; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P. Avaliação do potencial da técnica LIBS no diagnóstico de HLB. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 5., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação , 2013. p. 21 Editado por Ana Rita de Araújo Nogueira, Simone Cristina Méo Niciura.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 14. | | RANULFI, A. C.; ROMANO, R. A.; MAGALHÃES, A. B.; FERREIRA, E. J.; VILLAS-BOAS, P. R.; MILORI, D. M. B. P. Evaluation of the nutritional changes caused by huanglongbing (HLB) to citrus plants using laser-induced breakdown spectroscopy. Applied Spectroscopy, v. 71, n. 7, p. 1471-1480, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 16. | | RANULFI, A. C.; FERREIRA, E. J.; KUBOTA, T. M. K.; SILVA, J. T. B. da; SAUCE, R. S.; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P. Utilização de técnicas fotônicas no estudo e caracterização de doenças em citros. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 120. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56)| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 17. | | MAGALHÃES, A. B.; KUBOTA, T. M. K.; SILVA, M. N. da; SEILER, R. M. B.; SANTOS, J. Z. dos; RANULFI, A. C.; NOVELLI, V. M.; BASTIANEL, M.; VILLAS-BOAS, P. R.; CRISTOFANI-YALY, M.; MILORI, D. M. B. P. Application on the laser-induced breakdown spectroscopy in identification among pear sweet citrus varieties very close genetically. In: WORKSHOP SOBRE LASER EM QUÍMICA ANALÍTICA, 2., 2015, São Carlos. Livro de resumos... São Carlos: UFSCar; Embrapa Instrumentação, 2015. p. 30.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 18. | | NICOLODELLI, G.; SENESI, G. S.; RANULFI, A. C.; MARANGONI, B. S.; WATANABE, A.; BENITES, V. de M.; OLIVEIRA, P. P. A.; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P. Double-pulse laser induced breakdown spectroscopy in orthogonal beam geometry to enhance line emission intensity from agricultural samples. Microchemical Journal, v. 133, p. 272-278, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 19. | | NICOLODELLI, G.; SENESI, G. S.; RANULFI, A. C.; MARANGONI, B. S.; WATANABE, A.; BENITES, V. de M.; OLIVEIRA, P. P. A.; VILLAS BOAS, P. R.; MILORI, D. M. B. P. Double-pulse laser induced breakdown spectroscopy in orthogonal beam geometry to enhance line emission intensity from agricultural samples. Microchemical Journal, v. 133, p. 272-278, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 20. | | NICOLODELLI, G.; SENESI, G. S.; RANULFI, A. C.; MARANGONI, B. S.; WATANABE, A.; BENITES, V. M.; OLIVEIRA, P. P. A.; BOAS, P. R. V.; MILORI, D. M. B. P. Double pulse laser induced breakdowwn spsctroscopy in orthogonal beam geometry to enhance line emission intensity from agricultural samples. In: MICROCHEMICAL JOURNAL, v. 133, p. 272-278, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| Registros recuperados : 24 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
10/11/2017 |
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Data da última atualização: |
17/04/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de M.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA, R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L. |
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Afiliação: |
LEONARDO RIPPEL SALGADO, Embrapa Beef Cattle, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil; RODOLPHO LIMA, Federal University of Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil; BRUNO FERREIRA DOS SANTOS, Federal University of Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil; KARINA TAMIE SHIRAKAWA, Federal University of Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil; MARIANE DE MENDONCA VILELA, CNPGC; NALVO FRANCO ALMEIDA, Federal University of Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil; RODRIGO MATHEUS PEREIRA, Federal University of Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; LUCIMARA CHIARI, CNPGC. |
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Título: |
De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Growth Regulation, v. 83, n. 1, p. 157-170, 2017. |
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DOI: |
10.1007/s10725-017-0291-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Acidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these transcripts, 113,918 were assigned a putative protein function through comparisons with different gene set databases. Additionally, 13,375 simple sequence repeat (SSR) markers were identified. Digital gene expression analyses were conducted to identify 6698 differentially expressed genes between treatments, revealing a great differences in the root transcriptional landscape when exposed to aluminum. An extensive annotation of the differentially expressed genes (DEGs), made possible to identify several transcripts with putative functions correlated to aluminum exposure, most belonging to vesicle transportation, cell wall modifications and metal handling ontologies. In this work, abundant, high-quality transcripts were obtained, providing a reference platform for future biotechnological studies and breeding programs for this species and its close relatives. MenosAcidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these transcripts, 113,918 were assigned a putative protein function through comparisons with different gene set databases. Additionally, 13,375 simple sequence repeat (SSR) markers were identified. Digital gene expression analyses were conducted to identify 6698 differentially expressed genes between treatments, revealing a great differences in the root transcriptional landscape when exposed to aluminum. An extensive annotation of the differentially expressed genes (DEGs), made possible to identify several transcripts with putative functions correlated to aluminum exposure, most belonging to vesicle transportation, cell wall modifications and metal handling ontologies. In this work, abundant, high-quality transcripts were obtained... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Molecular markers; RNA sequencing; Urochloa genus. |
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Thesagro: |
Brachiaria Decumbens. |
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Thesaurus NAL: |
Aluminum. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/166583/1/De-novo-RNA-sequencing-and-analysis.pdf
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Marc: |
LEADER 02506naa a2200289 a 4500
001 2079489
005 2018-04-17
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1007/s10725-017-0291-2$2DOI
100 1 $aSALGADO, L. R.
245 $aDe novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aAcidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these transcripts, 113,918 were assigned a putative protein function through comparisons with different gene set databases. Additionally, 13,375 simple sequence repeat (SSR) markers were identified. Digital gene expression analyses were conducted to identify 6698 differentially expressed genes between treatments, revealing a great differences in the root transcriptional landscape when exposed to aluminum. An extensive annotation of the differentially expressed genes (DEGs), made possible to identify several transcripts with putative functions correlated to aluminum exposure, most belonging to vesicle transportation, cell wall modifications and metal handling ontologies. In this work, abundant, high-quality transcripts were obtained, providing a reference platform for future biotechnological studies and breeding programs for this species and its close relatives.
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700 1 $aNEPOMUCENO, A. L.
700 1 $aCHIARI, L.
773 $tPlant Growth Regulation$gv. 83, n. 1, p. 157-170, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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