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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
23/05/2007 |
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Data da última atualização: |
24/05/2007 |
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Autoria: |
BARBOSA, S. R. C.; GOMES, E.; BRESEGHELO, L.; MOURA, A. L. D.; ALVES, E. B.; KNOB, A.; ALMEIDA, A. M. R.; LOBO JUNIOR, M.; PETROFEZA, S. |
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Título: |
Análise parcial do transcriptoma de Sclerotinia sclerotiorum durante a interação patogênica com feijão comum (Phaseolus vulgaris L.). |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE GENÉTICA, 12., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Área Microorganismos - pdf 898. |
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Conteúdo: |
No Brasil, perdas na produção de diversas culturas causadas por Sclerotinia sclerotiorum vêm chamando a atenção de produtores e pesquisadores, como em lavouras de feijão e soja, irrigadas por pivô central em diversas regiões do país. Dentre as culturas comerciais afetadas, a do feijoeiro é a que mais sofre perdas na produção, sendo o número de sementes por planta e seu peso os componentes de rendimento mais afetados trazendo enorme prejuízo. O interesse em genes de fungos diferencialmente expressos durante a interação com a planta hospedeira é nutrido pela idéia que tais genes podem desempenhar um papel crucial durante o desenvolvimento da patologia. Neste sentido este trabalho objetivou a identificação e a análise de genes de S. sclerotiorum que são expressos preferentemente durante sua interação com a planta de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) o pode permitir a detecção de genes que são potencialmente importantes para o processo de patogênese em cada uma das fases consideradas. Os bancos de cDNA foram construídos no vetor uni-direcional e de expressão ?ZAP a partir de S. sclerotiorum crescido em meio BDA (condição normal) e de S. sclerotiorum durante a infecção em plântulas de feijoeiro Os cDNAs clonados nestes fagos foram isolados e amplificados por PCR, sendo o produto submetido direto ao seqüenciamento da região 5'.Os eletroferogramas foram analisadas pelo programa PHRED e as seqüências correspondentes aos vetores foram mascaradas através do programa CrossMatch. Somente as seqüências que apresentaram um tamanho acima de 200 nucleotídeos, com índice PHRED maior do que 20 foram selecionadas. As ESTs foram agrupadas utilizando o programa CAP3 sendo que as seqüências similares formaram um contig, que era representado por uma única seqüência consenso, e os singlets, seqüências unitárias que não apresentaram similaridade com nenhuma outra seqüência.Um total de 1860 ESTs foram geradas, sendo 940 da condição Normal e 920 seqüências da interação sclerotinia-feijoeiro. Destas foram consideradas apenas seqüências de ESTs que apresentaram um E value < 10-5, correspondendo a 58,51% e 46,74% do total de ESTs seqüenciadas da condição normal e interação, respectivamente. A subtração eletrônica de ESTs foi feita utilizando as seqüências da condição normal e seqüências da interação de S. sclerotiorum-feijoeiro. Os genes diferencialmente expressos foram obtidos considerando-se os contigs formados exclusivamente por normal ou interação. As seqüências consenso dos contigs e os singlets, foram comparadas com seqüências de outros organismos, utilizando o BLASTx e os bancos de dados GenBank nr; COG (Cluster of Orthologous Groups), GO (Gene Ontology) e MIPs (Munich Information Center for Proteins Sequences). As seqüências foram categorizadas e suas possíveis funções inferidas por analogia com outras depositadas nos bancos de dados. MenosNo Brasil, perdas na produção de diversas culturas causadas por Sclerotinia sclerotiorum vêm chamando a atenção de produtores e pesquisadores, como em lavouras de feijão e soja, irrigadas por pivô central em diversas regiões do país. Dentre as culturas comerciais afetadas, a do feijoeiro é a que mais sofre perdas na produção, sendo o número de sementes por planta e seu peso os componentes de rendimento mais afetados trazendo enorme prejuízo. O interesse em genes de fungos diferencialmente expressos durante a interação com a planta hospedeira é nutrido pela idéia que tais genes podem desempenhar um papel crucial durante o desenvolvimento da patologia. Neste sentido este trabalho objetivou a identificação e a análise de genes de S. sclerotiorum que são expressos preferentemente durante sua interação com a planta de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) o pode permitir a detecção de genes que são potencialmente importantes para o processo de patogênese em cada uma das fases consideradas. Os bancos de cDNA foram construídos no vetor uni-direcional e de expressão ?ZAP a partir de S. sclerotiorum crescido em meio BDA (condição normal) e de S. sclerotiorum durante a infecção em plântulas de feijoeiro Os cDNAs clonados nestes fagos foram isolados e amplificados por PCR, sendo o produto submetido direto ao seqüenciamento da região 5'.Os eletroferogramas foram analisadas pelo programa PHRED e as seqüências correspondentes aos vetores foram mascaradas através do programa CrossMatch. Somente... Mostrar Tudo |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 4. |  | OLIVEIRA, C. M.; FREITAS, M. A.; FALEIRO, V. de O.; PETROFEZA, S. Estratégia moleculares para identificação de Meloidogyne incognita, M. javanica, Pratylenchus brachyurus e P. coffese In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 31., 2013, Cuiabá. Anais... Cuiabá, MT: Sociedade Brasileira de Nematologia, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 5. | | MAGALHÃES, L. F.; CUNHA, C. P. R.; LOBO JUNIOR, M.; PETROFEZA, S. Diversidade genética em populações de Sclerotinia sclerotiorum na cultura de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.). Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 36, p. 1124, ago. 2011. Suplemento, ref. 1576. Edição dos Resumos do 44 Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Bento Gonçalves, ago. 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
|  |
| 9. | | BEVITORI, R.; POPIELARSKA-KONIECZNA, M.; SANTOS, E. M. dos; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; PETROFEZA, S. Morpho-anatomical characterization of mature embryo-derived callus of rice (Oryza sativa L.) suitable for transformation. Protoplasma, New York, v. 251, n. 3, p. 545-554, May 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | OLIVEIRA, M. B.; SANTOS, E. M. dos; INOCÊNCIO, A. P. M.; CUNHA, C. P. R.; LOBO JUNIOR, M.; PETROFEZA, S. Análise de enimas hidrolíticas durante a interação do fungo Sclerotinia sclerotiorum e plantas de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.). In: CONGRESSO DE GENÉTICA DO CENTRO-OESTE, 2., 2010, Anais... Goiânia. Goiânia: Universidade Federal de Goiás, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 12. | | BEVITORI, R.; OLIVEIRA, M. B.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; LANNA, A. C.; SILVEIRA, R. D. da; PETROFEZA, S. Selection of optimized candidate reference genes for qRT-PCR normalization in rice (Oryza sativa L.) during Magnaporthe oryzae infection and drought. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 9795-9805, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | BARBOSA, S. R. C.; GOMES, E.; BRESEGHELO, L.; MOURA, A. L. D.; ALVES, E. B.; KNOB, A.; ALMEIDA, A. M. R.; LOBO JUNIOR, M.; PETROFEZA, S. Análise parcial do transcriptoma de Sclerotinia sclerotiorum durante a interação patogênica com feijão comum (Phaseolus vulgaris L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE GENÉTICA, 12., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. 1 CD-ROM. Área Microorganismos - pdf 898.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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