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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
15/03/2021 |
Data da última atualização: |
10/08/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
BOARI, A. de J.; QUADROS, A. F. F.; KAUFFMANN, C. M.; PANTOJA, K. F. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R.; OLIVEIRA, R. P. de; CORDOVIL, G. A.; GAVINHO, B. E. S.; KITAJIMA, E. W.; BLAWID, R.; NAGATA, T. |
Afiliação: |
ALESSANDRA DE JESUS BOARI, CPATU; AYANE F. F. QUADROS, UFRA; CATERYNNE M. KAUFFMANN, UFRA; KÉSSIA F. C. PANTOJA, Univesidade Estadual de São Paulo; RUI ALBERTO GOMES JUNIOR, CPATU; FRANCISCO RODRIGUES FREIRE FILHO, CPATU; RAIMUNDO PARENTE DE OLIVEIRA, CPATU; GABRIELE A. CORDOVIL, UFRA; BRENDA E. S. GAVINHO, UFRA; ELLIOT W. KITAJIMA, ESALQ/USP; ROSANA BLAWID, Universidade Federal Rural de Pernambuco; TATSUYA NAGATA, UNB. |
Título: |
Near-complete genome sequence of cowpea severe mosaic virusin South America and reduced yardlong bean production dueto the viral infection. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v. 46, n. 4, p. 487-491, Aug. 2021. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s40858-021-00420-w |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The sequence of a near-complete genome (two RNA segments) of cowpea severe mosaic virus (CpSMV) in the Comovirus genus is revealed in South America. High-throughput sequencing (HTS) was performed using total RNA extracted from partially purified virus preparations obtained from infected yardlong bean leaves (Vigna unguiculata subsp. sesquipedalis), collected in Santa Izabel, state of Pará, Brazil. The YLB (yardlong bean) isolate has an RNA-1 with 5896 nucleotides (nt) and an RNA-2 with 3515 nt, showing 74.2% and 67.9% identity, respectively, with the CpSMV-DG isolate sequences from the USA, the only complete genome available so far. Despite the low percentage in nt identity, the amino acid (aa) sequence of the viral protease together with the RNA-dependent RNA polymerase (Pro/RdRp) and the large and small coat proteins (CP-L/CP-S), used as species demarcation criteria of the Secoviridae family, showed 92.2% (Pro-RdRp) and 85.6% (CP-L/CL-S) identities between DG and YLB isolates sequences. The nucleotide identity of partial RNA-1 sequences of 2199 nt (part of the helicase, VPg, Pro, and 2/3 of the RdRP) varied from 95.1 to 95.3% among YLB and eleven isolates from Brazil available on GenBank. Phylogenetic analysis based on this 2199 nt sequence revealed that the YLB isolate was positioned in a different clade compared to other CpSMV isolates. An estimate of damage caused by CpSMV under experimental conditions revealed a reduction of 39.4% in the total number of pods and 54.3% in the total number of grains, regardless of the yardlong bean cultivar evaluated. The reduction of total weight of the grains by CpSMV infection was dependent on the cultivar and was higher in cv. De metro (66.2%) than in cv. Slin (38.9%). MenosThe sequence of a near-complete genome (two RNA segments) of cowpea severe mosaic virus (CpSMV) in the Comovirus genus is revealed in South America. High-throughput sequencing (HTS) was performed using total RNA extracted from partially purified virus preparations obtained from infected yardlong bean leaves (Vigna unguiculata subsp. sesquipedalis), collected in Santa Izabel, state of Pará, Brazil. The YLB (yardlong bean) isolate has an RNA-1 with 5896 nucleotides (nt) and an RNA-2 with 3515 nt, showing 74.2% and 67.9% identity, respectively, with the CpSMV-DG isolate sequences from the USA, the only complete genome available so far. Despite the low percentage in nt identity, the amino acid (aa) sequence of the viral protease together with the RNA-dependent RNA polymerase (Pro/RdRp) and the large and small coat proteins (CP-L/CP-S), used as species demarcation criteria of the Secoviridae family, showed 92.2% (Pro-RdRp) and 85.6% (CP-L/CL-S) identities between DG and YLB isolates sequences. The nucleotide identity of partial RNA-1 sequences of 2199 nt (part of the helicase, VPg, Pro, and 2/3 of the RdRP) varied from 95.1 to 95.3% among YLB and eleven isolates from Brazil available on GenBank. Phylogenetic analysis based on this 2199 nt sequence revealed that the YLB isolate was positioned in a different clade compared to other CpSMV isolates. An estimate of damage caused by CpSMV under experimental conditions revealed a reduction of 39.4% in the total number of pods and 54.3% ... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Feijão; Genoma; Vigna Unguiculata; Vírus. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Registros recuperados : 40 | |
22. | | KAUFFMANN, C. M.; CORDOVIL, G. D'A.; PANTOJA, K. de F. C.; GAVINHO, B. E. S.; BOARI, A. de J. Detecção de um Fabavirus em matrizeiros de pimenteira-do-reino. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 23., 2019, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2019. p. 263-266.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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23. | | PANTOJA, K. F. R.; LEÃO, N. V. M.; OHASHI, S. T.; ROCHA, S. de F. R.; SILVA, R. A. Biometria, número de sementes por quilo, e grau de umidade para três espécies da familia Sapotaceae. In: SIMPÓSIO SILVICULTURA NA AMAZÔNIA ORIENTAL: contribuições do Projeto Embrapa/DFID, 1999, Belém, PA. Resumos expandidos. Belém, PA: EMBRAPA-CPATU: DFID, 1999. p. 285-288. (EMBRAPA-CPATU. Documentos, 123).Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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24. | | BOARI, A. de J.; OLIVEIRA, A. C. S.; SOUSA, C. M.; PANTOJA, K. F. C.; SOUZA, C. A. Incidência de Piper yellow mottle virus e cumcumber mosaic virus em plantas de pimenteira do reino no Estado do Pará. Tropical Plant Pathology, Lavras, MG, v. 35, p. S134, Aug. 2010. Suplemento. Edição dos resumos do XLIII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Cuiabá, ago. 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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25. | | BOARI, A. de J.; PANTOJA, K. de F. da C.; SOUSA, C. M. de; OLIVEIRA, A. C. S. de. Ocorrência de Piper yellow mottle virus em jardins clonais de pimenta-do-reino no Estado do Pará. In: CONFERÊNCIA NACIONAL DE DEFESA AGROPECUÁRIA, 4., 2013, Belém, PA. Defesa agropecuária e sustentabilidade. Belém, PA: SBDA, 2014. p. 147.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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26. | | BOARI, A. de J.; OLIVEIRA, A. C. S.; PANTOJA, K. F. C.; TREMACOLDI, C. R.; CORREA, P. P. S.; SOUSA, C. M.; SOUZA, C. A. Avaliação do banco de germoplasma de pimenteira-do-reino quanto à presença de Piper yellow motlle virus. Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 35, 2009. Supplement.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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27. | | ALBUQUERQUE, G. R. de; SANTOS, J. A. C. M. dos; BOARI, A. de J.; CUNHA, E. F. M.; PANTOJA, K. F. C.; WINTER, S.; BLAWID, R. First report of cassava virus X infecting cassava plants in Brazil. Journal of Plant Pathology, v. 105, n. 4, p. 1669-1674, Nov. 2023.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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28. | | PANTOJA, K. F. C.; MARCHI, B. R. de; KRAUSE-SAKATE, R.; MITUTI, T.; REZENDE, J. A. M.; GHANIM, M.; GHOSH, S.; BOARI, A. de J. First report of a putative new pepper vein yellows virus species associated with a vein yellows disease of bonnet pepper plants in Brazil. Plant Disease, v. 103, n. 11, p. 2972, Nov. 2019.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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29. | | PANTOJA, K. de F. C.; BOARI, A. de J.; SAKATE, R. K.; MARCHI, B. R. de; ASSIS, G. M. L. de; GONCALVES, R. C.; KITAJIMA, E. W. Genoma completo do Peanut mottle virus infectando amendoim forrageiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2019, Recife. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2019.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Amazônia Oriental. |
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30. | | PANTOJA, K. F. C.; BOARI, A. de J.; KITAJIMA, E. W.; SAKATE, R. K.; MARCHI, B. R. de; ASSIS, G. M. L. de; GONCALVES, R. C. Detecção de um Emaravirus-like em amendoim forrageiro por sequenciamento de alto desempenho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2109, Recife. Os avanços da Fitopatologia na Era Genômica: anais. Recife: SBF: UFPRE/PPGF, 2019. p. 835.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Amazônia Oriental. |
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31. | | OLIVEIRA A. C. S.; BOARI, A. de J.; SOUSA, C. M. de; PANTOJA, K. de F. C.; SOUZA, C. do A. Detecção de Piper yellow mottle virus de pimenteira do reino nos estados de Minas Gerais, Espírito Santo e Amazonas. Horticultura Brasileira, v. 28, n. 2, p. S952-S956, jul. 2010. Suplemento. 1 CD-ROM. Edição dos anais do 50º Congresso Brasileiro de Olericultura, 2010, Guarapari.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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32. | | PANTOJA, K. de F. R.; LEÃO, N. V. M.; OHASHI, S. T.; ROCHA, S. de F. R.; SILVA, R. A. M. da. Biometria, número de sementes por quilo, e percentagem de umidade para três espécies da família sapotaceae. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (AVALIAÇÃO 1997-1998), 8., 1998, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP-Unidade de Apoio à Pesquisa e Pós-Graduação, 1998. p. 215.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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33. | | ROCHA, S. de F. R.; OHASHI, S. T.; LEÃO, N. V. M.; ROSA, L. dos S.; PANTOJA, K. de F. R.; SILVA, R. A. M. Influência do sombreamento e substrato na sobrevivência e crescimento de mudas de tatajuba (Bagassa guianensis Aubl.). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (AVALIAÇÃO 1997-1998), 8., 1998, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP-Unidade de Apoio à Pesquisa e Pós-Graduação, 1998. p. 172.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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34. | | PANTOJA, K. de F. da C.; BOARI, A. de J.; OLIVEIRA, A. C. S. de; SOUSA, C. M. de; SOUZA, C. A. Levantamento de viroses em pimenteira-do-reino no Estado do Pará. In: SEMINÁRIO CIENTÍFICO DA UFRA, 7.; SEMINÁRIO [DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA] DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 13.; SEMINÁRIO DE PESQUISA DA UFRA, 1., 2009, Belém, PA. Pesquisa e desenvolvimento tecnológico na formação do jovem cientista: anais. Belém, PA: UFRA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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35. | | CARVALHO, C. J. R. de; CHU, E. Y.; DAVIDSON, E. A.; SANTOS, M. T. P. dos; FIGUEIREDO, R. de O.; FREIRE, G. S.; PANTOJA, K. de F. R. Mechanisms of conservation and cycling of N and P in a chronosequence of secondary vegetation in Eastern Amazonia. In: CONFERÊNCIA CIENTÍFICA INTERNACIONAL DO LBA, 2., 2002, Manaus. Resumos... Manaus: LBA, 2002. Não paginado.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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36. | | BOARI, A. de J.; CORDOVIL, G. A.; KAUFFMANN, C. M.; GAVINHO, B. E. S.; QUADROS, A. F. F.; PANTOJA, K. F. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R.; OLIVEIRA, R. P. de; KITAJIMA, E. W. Bean common mosaic virus infecting manteiguinha cowpea (Vigna unguiculata): seed transmission, evaluation of yield loss, and genetic resistance. Tropical Plant Pathology, v. 47, n. 3, p. 450-455, June 2022.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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37. | | PANTOJA, K. F. C.; BOARI, A. de J.; MARCHI, B. R. De; REZENDE, J. A. M.; KITAJIMA, E. W.; GONCALVES, R. C.; ASSIS, G. M. L. de; BLAWID, R.; KRAUSE-SAKATE, R. Arachis virus Y, a new potyvirid from Brazilian forage peanut (Arachis pintoi). Archives of Virology, v. 165, n. 10, p. 2349-2353, Oct. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Amazônia Oriental. |
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38. | | ISHIDA, F. Y.; SABÁ, R. T.; DAVIDSON, E. A.; CARVALHO, C. J. R. de; FUGUEIREDO, R. de O.; SANTOS, M. T. P. dos; PANTOJA, K. de F. R.; FREIRE, G. S. Emissions of CO2, CH4, N2O, and NO in a chronosequence of secondary forests in eastern Amazonia. In: CONFERÊNCIA CIENTÍFICA INTERNACIONAL DO LBA, 2., 2002, Manaus. Resumos. Manaus: LBA, 2002. Não paginado.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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39. | | BOARI, A. de J.; QUADROS, A. F. F.; KAUFFMANN, C. M.; PANTOJA, K. F. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R.; OLIVEIRA, R. P. de; CORDOVIL, G. A.; GAVINHO, B. E. S.; KITAJIMA, E. W.; BLAWID, R.; NAGATA, T. Near-complete genome sequence of cowpea severe mosaic virusin South America and reduced yardlong bean production dueto the viral infection. Tropical Plant Pathology, v. 46, n. 4, p. 487-491, Aug. 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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40. | | XAVIER, C. A. D.; NOGUEIRA, A. M.; BELLO, V. H.; WATANABE, L. F. M.; BARBOSA, T. M. C.; ALVES JÚNIOR, M.; BARBOSA, L.; BESERRA-JÚNIOR, J. E. A.; BOARI, A. de J.; CALEGARIO, R.; GORAYEB, E. S.; HONORATO JÚNIOR, J.; KOCH, G.; LIMA, G. S. de A.; LOPES, C.; MELLO, R. N. de; PANTOJA, K.; SILVA, F. N.; RAMOS SOBRINHO, R.; SANTANA, E. N.; SILVA, J. W. P. da; KRAUSE-SAKATE, R.; ZERBINI, F. M. Assessing the diversity of whiteflies infesting cassava in Brazil. PeerJ, v. 9, e11741, July 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão. |
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