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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
11/10/2016 |
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Data da última atualização: |
03/03/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PANTALIÃO, G. F.; NARCISO, M.; GUIMARÃES, C.; CASTRO, A.; COLOMBARI, J. M.; BRESEGHELLO, F.; RODRIGUES, L.; VIANELLO, R. P.; BORBA, T. O.; BRONDANI, C. |
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Afiliação: |
GABRIEL FERESIN PANTALIÃO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; MARCELO GONCALVES NARCISO, CNPAF; CLEBER MORAIS GUIMARAES, CNPAF; ADRIANO PEREIRA DE CASTRO, CNPAF; JOSE MANOEL COLOMBARI FILHO, CNPAF; FLAVIO BRESEGHELLO, CNPAF; LUANA ALVES RODRIGUES, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; TEREZA CRISTINA DE OLIVEIRA BORBA, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF. |
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Título: |
Genome wide association study (GWAS) for grain yield in rice cultivated under water deficit. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetica, v. 144, n. 6, p. 651-664, Dez. 2016. |
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DOI: |
10.1007/s10709-016-9932-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The identification of rice drought tolerant materials is crucial for the development of best performing cultivars for the upland cultivation system. This study aimed to identify markers and candidate genes associated with drought tolerance by Genome Wide Association Study analysis, in order to develop tools for use in rice breeding programs. This analysis was made with 175 upland rice accessions (Oryza sativa), evaluated in experiments with and without water restriction, and 150,325 SNPs. Thirteen SNP markers associated with yield under drought conditions were identified. Through stepwise regression analysis, eight SNP markers were selected and validated in silico, and when tested by PCR, two out of the eight SNP markers were able to identify a group of rice genotypes with higher productivity under drought. These results are encouraging for deriving markers for the routine analysis of marker assisted selection. From the drought experiment, including the genes inherited in linkage blocks, 50 genes were identified, from which 30 were annotated, and 10 were previously related to drought and/or abiotic stress tolerance, such as the transcription factors WRKY and Apeta-la2, and protein kinases. |
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Palavras-Chave: |
Genotyping by sequencing; Rice core collection. |
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Thesagro: |
Arroz; Deficiência hídrica; Oryza sativa; Relação água-planta. |
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Thesaurus Nal: |
Plant-water relations; Rice; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 15 | |
| 3. |  | ADORNO, D. R.; PANTALIÃO, G. F.; NASCIMENTO JUNIOR, I. R. do; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, C. Análise de QTLs para produtividade baseada em linhas puras recombinantes de arroz. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 109. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 4. | | SILVA, D. R. A.; BORBA, T. C. de O.; GARCIA, A. L. B.; PANTALIÃO, G. F.; BRONDANI, C. Análise dos dados moleculares genotipados via GBS da populaçao RIL de arroz para uma posterior análise de QTL. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 5. | | PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Análise de associação genômica ampla (GWAS) da produtividade em arroz sob déficit hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 6. | | PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Identificação de loci relacionados à produtividade sob deficit hídrico utilizando uma abordagem GBS - GWAS. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 110. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 7. | | PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Identificação de SNPs associados à produtividade em arroz sob déficit hídrico. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 7., 2013, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2013. p. 27. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 292). Apresentação oral - Pós-graduação.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 8. | | PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Mapeamento associativo para produtividade em arroz sob déficit hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 108-111.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 9. | | PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; GUIMARÃES, C. M.; BRONDANI, C. Mapeamento associativo para tolerância à seca em arroz por marcadores SNPs em alta densidade. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 6., 2012, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2012. p. 84. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 275).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 10. | | PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Estudo de associação genômica ampla para produtividade em arroz sob déficit hídrico. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 8., 2014, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2014. p. 28. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 306).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 11. | | RAMOS, M. R. F.; MENDONÇA, J. A.; PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C. Cruzamentos em dialelo de genótipos de arroz. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 112. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 12. | | MENDES, C. dos A.; BORBA, T. C. de O.; BUENO, L. G.; CRUZEIRO, G. A. V.; MENDONÇA, J. A.; PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Análise de associação quanto à produtividade e seus caracteres componentes em linhagens e cultivares de arroz de terras altas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 49, n. 10, p. 771-782, out. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | PANTALIÃO, G. F.; NARCISO, M.; GUIMARÃES, C.; CASTRO, A.; COLOMBARI, J. M.; BRESEGHELLO, F.; RODRIGUES, L.; VIANELLO, R. P.; BORBA, T. O.; BRONDANI, C. Genome wide association study (GWAS) for grain yield in rice cultivated under water deficit. Genetica, v. 144, n. 6, p. 651-664, Dez. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 14. | | VIEIRA, A. F.; PANTALIÃO, G. F.; ABREU, F. M.; SILVEIRA, R. D.; GARCIA, A. L. B.; NEVES, L. G.; VIANELLO, R. P.; CASTRO, A. P. de; BRONDANI, C. Marker-assisted elimination of drought-susceptible accessions in upland rice breeding. Genetics and Molecular Research, v. 17, n. 1, gmr16039886, Feb. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 15. | | PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BUENO, L. G.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; CORDEIRO, A. C. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIEIRA, A. F.; BRONDANI, C. Development of SNP markers for grain yield screening of Brazilian rice cultivars. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e01643, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Roraima; Embrapa Unidades Centrais. |
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