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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
07/11/2022 |
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Data da última atualização: |
07/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MATOS, M. K. da S.; BENKO-ISEPPON, A. M.; BEZERRA-NETO, J. P.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; WANG, Y.; LIU, H.; PANDOLFI, V.; AMORIM, L. L. B.; WILLADINO, L.; AMORIM, T. C. do V.; KIDO, E. A.; VIANELLO, R. P.; TIMKO, M. P.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C. |
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Afiliação: |
MITALLE KAREN DA SILVA MATOS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ANA MARIA BENKO-ISEPPON, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOAO PACIFICO BEZERRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOSE RIBAMAR COSTA FERREIRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; YU WANG, UNIVERSITY OF VIRGINA; HAI LIU, UNIVERSITY OF VIRGINIA; VALESCA PANDOLFI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LIDIANE LINDINALVA BARBOSA AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LILIA WILLADINO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; THIALISSON CAACI DO VALE AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; EDERSON AKIO KIDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; MICHAEL P. TIMKO, UNIVERSITY OF VIRGINIA; ANA CHRISTINA BRASILEIRO-VIDAL, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO. |
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Título: |
The WRKY transcription factor family in cowpea: Genomic characterization and transcriptomic profiling under root dehydration. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Gene, v. 823, 146377, May 2022. |
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ISSN: |
0378-1119 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146377 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress response, the data provide a foundation for the targeted modification of specific VuWRKY family members to improve drought tolerance in this important climate-resilient legume in the developing world and beyond. MenosCowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
QPCR; RNA-Seq. |
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Thesagro: |
Seca; Vigna Unguiculata. |
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Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Cowpeas; Drought tolerance; Gene expression. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 46 | |
| 5. |  | SCHEEREN, P. L.; ALBUQUERQUE, A. C. S.; FERNANDES, M. I. B. M.; PANDOLFI, V.; MARTINS, L. F. Desenvolvimento de germoplasma, via haplodiploidização, para melhoria da qualidade panificativa do trigo brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 1., 2001, Goiânia. Anais... Goiânia: Embrapa Arroz e Feijão, 2001. 1 CD-ROM. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 113). Editado por Elcio Perpetuo Guimaraes. Autoria: Ana Christina de Albuquerque Zanatta| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 8. | | BRAMMER, S.; FERNANDES, M. I. B. de M.; MINELLA, E.; ARIAS, G.; SÓ e SILVA, M.; IORCZESKI, E. J.; SILVA, A. L. S.; PANDOLFI, V. Haplodiploidização e identificação de genótipos de cevada com capacidade androgenética no programa de melhoramento da Embrapa Trigo. In: REUNIÃO ANUAL DE PESQUISA DE CEVADA, 19., 1999, Passo Fundo. Anais... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 1999. p. 93-97 (Embrapa Trigo. Documentos, 5).| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 9. | | BRAMMER, S. P.; FERNANDES, M. I. B. de M.; MINELLA, E.; ARIAS, G.; SÓ e SILVA, M.; IORCZESKI, E. J.; SILVA, A. L. S. da; PANDOLFI, V. Haplodiploidização e identificação de genótipos de cevada com capacidade androgenética no programa de melhoramento da Embrapa Trigo. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE TRIGO, 18., 1999, Passo Fundo. Anais... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 1999. v. 1 p. 188-193| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 10. | | MORAES FERNANDES, M. I. B.; ZANATTA, A. C. A.; PRESTES, A. M.; CAETANO, V. da R.; BARCELLOS, A. L.; ANGRA, D. C.; PANDOLFI, V. Cytogenetics and immature embryo culture at Embrapa Trigo breeding program: transfer of disease resistance from related species by artificial resynthesis of hexaploid wheat (Triticum aestivum L. em. Thell). Genetics and Molecular Biology, v. 23, n. 4, p. 1051-1062, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 11. | | BRAMMER, S. P.; MORAES FERNANDES, M. I. B. de; MINELLA, E.; ARIAS, G.; SÓ e SILVA, M.; IORCZESKI, E.; PANDOLFI, V.; BOSCARDIN, D. Eficiência do meio FHGA para a haplodiploidização de cevada na Embrapa Trigo. Genetics and Molecular Biology, v. 22, n. 3, p. 675-676, Oct. 1999. Supplement. Programa e Resumos do 45. Congresso Nacional de Genética, Gramado, 1999. Resumo 17-055.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 12. | | FERREIRA-NETO, J. R. C.; SILVA, M. D. da; BENKO-ISEPPON, A. M.; PANDOLFI, V.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; KIDO, E. A. Inositol phosphates and Raffinose family oligosaccharides pathways: Structural genomics and transcriptomics in soybean under root dehydration Plant Gene, v. 20, 100202, 2019. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 13. | | SOARES-CAVALCANTI, N. M.; BELARMINO, L. C.; KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; RODRIGUES, F. A.; PEREIRA, G. A. G.; BENKO-ISEPPON, A. M. Overall picture of expressed Heat Shock Factors in Glycine max, Lotus japonicus and Medicago truncatula. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 247-259, May 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 14. | | KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; HOULLOU-KIDO, L. M.; ANDRADE, F. C.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; BURNQUIST, W. L.; BENKO-ISEPPON, A. M. Plant antimicrobial peptides: an overview of superSAGE transcriptional profile and a functional review. Current Protein & Peptide Science, v. 11, n. 3, p. 220-230, May 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 15. | | MEDEIROS, C. D.; FERREIRA NETO, M. J.; OLIVEIRA, M. T.; RIVAS, R.; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; BALDANI, J. I.; SANTOS, M. G. Photosynthesis, antioxidant activities and trasncriptional responses in two sugarcane (Saccharum officinarum L.) cultivars under salts stress. Acta Physiologiae Plantarum Online, octubre, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 16. | | ARAÚJO, F. T. de; PANDOLFI, V.; FERREIRA NETO, J. R.; SANTOS, R. F. dos; MORGANTE, C. V.; MELO, N. F. de; ISEPPON, A. M. B. Seleção de candidatos a genes referência para estudos de expressão gênica em Stylosanthes scabra. In: ENCONTRO DE GENÉTICA DO NORDESTE, 21., 2016, Recife. Anais... Ribeirão Preto: SBG; Recife: UFPE: UFRPE: UPE, 2016. p. 89.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. M.; FREIRE FILHO, F. R.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; ISEPPON, A. M. B. Análise de segregantes na identificação de marcadores ligados a genes de resistência a virose em feijão-caupi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para a produção de alimentos e bioenergia: livro de resumos. Fortaleza: SBFV: UFC: Embrapa Agroindústria Tropical, 2009. p. 27-28. Resumo 69.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 18. | | BARBOSA, P. K. A; CALSA JUNIOR, T; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; ROCHA, M. de M.; SITTOLIN, I. M; ANDRADE, G. P; PIO-RIBEIRO, G.; BENKO-ISEPPON, A. M. Análise transcricional de Vigna unguiculata infectada por potyvírus (CABMV) através de LongSAGE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 246| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 19. | | FERREIRA-NETO. J. R. C.; SILVA, M. D. da; BINNECK, E.; MELO, N. F. de; SILVA, R. G. da; MELO, A. L. T. M. de; PANDOLFI, V.; BUSTAMANTE, F. de O.; VIDAL, A. C. B.; BENKO-ISEPPON, A. M. Bridging the gap: combining genomics and transcriptomics approaches to understand Stylosanthes scabra, an orphan legume from the Brazilian Caatinga. Plants, v. 12, 3246, 2023. 23 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Soja. |
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| 20. | | BRASILEIRO-VIDAL, A. C.; BORTOLETI, K. C. A.; BENKO-ISEPPON, A. M.; VASCONCELOS, E. V. V.; FONSÊCA, A.; PEDROSA-HARAND, A.; OLIVEIRA, A. R. S.; BELARMINO, L. C.; AMORIM, L. L. B.; ABDELNOOR, R. V.; PANDOLFI, V.; MELO, N. F. Citogenética comparativa em leguminosas cultivadas. In: CONGRESO ARGENTINO DE GENÉTICA, 40., SIMPÓSIO LATINOAMERICANO DE CITOGENÉTICA Y EVOLUCIÓN, 3., JORNADAS SAG-NEA, 1., 2011, Buenos Aires. Journal of Basic & Apllied Genetics, v. 51, Supp., p. S19-20, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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