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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
04/02/2016 |
Data da última atualização: |
05/02/2016 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
VIEIRA, F. D.; OLIVEIRA, S. R. de M.; PAIVA, S. R. |
Afiliação: |
FÁBIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI. |
Título: |
Metodologia baseada em técnicas de mineração de dados para suporte à certificação de raças de ovinos. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Engenharia Agrícola, Jaboticabal, v. 35, n. 6, p. 1172-1186, nov./dez. 2015. |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.1590/1809-4430-Eng.Agric.v35n6p1172-1186/2015 |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Journal of the Brazilian Association of Agricultural Engineering. |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia baseada em técnicas de mineração de dados para selecionar os principais marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) para as raças de ovinos: Crioula, Morada Nova e Santa Inês. Os dados utilizados foram obtidos do Consórcio Internacional de Ovinos e são compostos por 72 animais das raças citadas, e cada animal possui 49.034 marcadores SNP. Considerando que o número de atributos (marcadores) é muito maior que o de observações (animais), foram aplicadas as técnicas de predição LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selection Operator), Random Forest e Boosting para a geração de modelos preditivos que incorporam métodos de seleção de atributos. Os resultados revelaram que os modelos preditivos selecionaram os principais marcadores SNP para identificação das raças estudadas. O modelo LASSO selecionou um total de 29 marcadores relevantes. A partir dos modelos Random Forest e Boosting, foram obtidos 27 e 20 marcadores importantes, respectivamente. Por meio da intersecção dos modelos gerados, identificou-se um subconjunto de 18 marcadores com maior potencial de identificação das raças. |
Palavras-Chave: |
Feature selection; Modelos preditivos; Penalized regression; Polimorfismo de nucleotídeo único; Predictive modeling; Regressão penalizada; Seleção de atributos. |
Thesaurus Nal: |
Models; Single nucleotide polymorphism. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/138468/1/AP-Metodologia-Vieira.pdf
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Marc: |
LEADER 02191naa a2200277 a 4500 001 2036157 005 2016-02-05 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.1590/1809-4430-Eng.Agric.v35n6p1172-1186/2015$2DOI 100 1 $aVIEIRA, F. D. 245 $aMetodologia baseada em técnicas de mineração de dados para suporte à certificação de raças de ovinos.$h[electronic resource] 260 $c2015 500 $aJournal of the Brazilian Association of Agricultural Engineering. 520 $aO objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia baseada em técnicas de mineração de dados para selecionar os principais marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) para as raças de ovinos: Crioula, Morada Nova e Santa Inês. Os dados utilizados foram obtidos do Consórcio Internacional de Ovinos e são compostos por 72 animais das raças citadas, e cada animal possui 49.034 marcadores SNP. Considerando que o número de atributos (marcadores) é muito maior que o de observações (animais), foram aplicadas as técnicas de predição LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selection Operator), Random Forest e Boosting para a geração de modelos preditivos que incorporam métodos de seleção de atributos. Os resultados revelaram que os modelos preditivos selecionaram os principais marcadores SNP para identificação das raças estudadas. O modelo LASSO selecionou um total de 29 marcadores relevantes. A partir dos modelos Random Forest e Boosting, foram obtidos 27 e 20 marcadores importantes, respectivamente. Por meio da intersecção dos modelos gerados, identificou-se um subconjunto de 18 marcadores com maior potencial de identificação das raças. 650 $aModels 650 $aSingle nucleotide polymorphism 653 $aFeature selection 653 $aModelos preditivos 653 $aPenalized regression 653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único 653 $aPredictive modeling 653 $aRegressão penalizada 653 $aSeleção de atributos 700 1 $aOLIVEIRA, S. R. de M. 700 1 $aPAIVA, S. R. 773 $tEngenharia Agrícola, Jaboticabal$gv. 35, n. 6, p. 1172-1186, nov./dez. 2015.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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71. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | CAJUEIRO, E. V. de M.; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. da S. Sistema de informação de recursos genéticos animais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. CD-ROMTipo: Resumo em Anais de Congresso |
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73. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BCHARA, M.; MCMANUS, C.; BLACKBURN, H.; AZEVEDO, H. C.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Validação de um painel reduzido de marcadores moleculares associados com susceptibilidade ao vírus da pneumonia ovina. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 83, 2018. Edição especial dos Anais do 5 Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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74. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BCHARA, M.; MCMANUS, C.; BLACKBURN, H.; AZEVEDO, H. C.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Validação de um painel reduzido de marcadores moleculares associados com susceptibilidade ao vírus da pneumonia ovina. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 83, 2018. Edição especial dos Anais do 5 Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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76. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | FARIA, D. A.; BCHARA, M.; MCMANUS, C.; BLACKBURN, H.; AZEVEDO, H. C.; PAIVA, S. R. Validação de um painel reduzido de marcadores moleculares relacionados à susceptibilidade ao scrapie em ovinos. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 83, 2018. Edição especial dos Anais do 5 Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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79. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SOLLERO, B. P.; YAMAKI, M.; GUIMARÃES, S. E. F.; CARNEIRO, P. L. S.; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. da S. Análise de componentes principais como ferramenta na avaliação da diversidade genética de suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: SBMA: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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