Data/hora: 05/06/2024 09:56:28

Biblioteca(s): 	Embrapa Agricultura Digital.	
Data corrente: 	12/11/2019	
Data da última atualização: 	14/11/2019	
Autoria: 	GUIMARÃES, P. de S.; SCHENK, J. C. M.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; SILVAROLLA, M. B.; MALUF, M. P.	
Afiliação: 	PAULA DE SOUSA GUIMARÃES, Bolsista do Consórcio Pesquisa Café; JULIANA CAMARGO MARTINATI SCHENK, IAC, Bolsista INCT/CNPq; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LILIAN PADILHA, CNPCa; MARIA BERNADETE SILVAROLLA, IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa.	
Título: 	Validação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica.	
Ano de publicação: 	2019	
Fonte/Imprenta: 	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.	
Páginas: 	4 p.	
Idioma: 	Português	
Notas: 	Título em inglês: Validation of active retrotransposons in coffee-effects of abiotic stress and low caffeine content on gene expression.	
Conteúdo: 	RESUMO: A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN.	
Palavras-Chave: 	Assisted-selection; Expressão gênica; Melhoramento molecular; Molecular breeding; Plantas sem cafeína; RNAseq; Seleção-assistida; Sequenciamento de RNA; Sequenciamento de transcriptoma.	
Thesaurus Nal: 	Gene expression.	
Categoria do assunto: 	--	
URL: 	http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/204545/1/Validacao-retrotransposons.pdf	
Registro original: 	Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)	
Exemplares: 	CNPTIA - (20123-1) - UPC - AA - DD -  -  -  - DIS