Data/hora: 05/06/2024 01:32:24

Biblioteca(s): | Embrapa Café.
Data corrente: | 23/10/2019
Data da última atualização: | 23/10/2019
Autoria: | GUIMARÃES, P. de S.; SCHENK, J. C. M.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; SILVAROLLA, M. B.; MALUF, M. P.
Afiliação: | Paula de Sousa Guimarães, Bolsista do Consórcio Pesquisa Café; Juliana Camargo Martinati Schenk, Instituto Agronômico de Campinas - IAC. Bolsista INCT/CNPq; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LILIAN PADILHA, CNPCa; Maria Bernadete Silvarolla, Instituto Agronômico de Campinas - IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa.
Título: | Validação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica.
Ano de publicação: | 2019
Fonte/Imprenta: | In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.
Idioma: | Português
Notas: | Título em inglês: Validation of active retrotransposons in coffee-effects of abiotic stress and low caffeine content on gene expression.
Conteúdo: | A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN.
Palavras-Chave: | Assisted-selection; Melhoramento molecular; Molecular breeding; RNAseq; Seleção-assistida.
Categoria do assunto: | --
Registro original: | Embrapa Café (CNPCa)
Exemplares: | CNPCa - (1328-1) - UPC - PC - DD -  -  -  - DIS