Data/hora: 21/06/2024 13:13:47

Biblioteca(s): | Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente: | 04/02/2016
Data da última atualização: | 05/02/2016
Autoria: | VIEIRA, F. D.; OLIVEIRA, S. R. de M.; PAIVA, S. R.
Afiliação: | FÁBIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI.
Título: | Metodologia baseada em técnicas de mineração de dados para suporte à certificação de raças de ovinos.
Ano de publicação: | 2015
Fonte/Imprenta: | Engenharia Agrícola, Jaboticabal, v. 35, n. 6, p. 1172-1186, nov./dez. 2015.
DOI: | http://dx.doi.org/10.1590/1809-4430-Eng.Agric.v35n6p1172-1186/2015
Idioma: | Português
Notas: | Journal of the Brazilian Association of Agricultural Engineering.
Conteúdo: | O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia baseada em técnicas de mineração de dados para selecionar os principais marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) para as raças de ovinos: Crioula, Morada Nova e Santa Inês. Os dados utilizados foram obtidos do Consórcio Internacional de Ovinos e são compostos por 72 animais das raças citadas, e cada animal possui 49.034 marcadores SNP. Considerando que o número de atributos (marcadores) é muito maior que o de observações (animais), foram aplicadas as técnicas de predição LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selection Operator), Random Forest e Boosting para a geração de modelos preditivos que incorporam métodos de seleção de atributos. Os resultados revelaram que os modelos preditivos selecionaram os principais marcadores SNP para identificação das raças estudadas. O modelo LASSO selecionou um total de 29 marcadores relevantes. A partir dos modelos Random Forest e Boosting, foram obtidos 27 e 20 marcadores importantes, respectivamente. Por meio da intersecção dos modelos gerados, identificou-se um subconjunto de 18 marcadores com maior potencial de identificação das raças.
Palavras-Chave: | Feature selection; Modelos preditivos; Penalized regression; Polimorfismo de nucleotídeo único; Predictive modeling; Regressão penalizada; Seleção de atributos.
Thesaurus Nal: | Models; Single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto: | X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/138468/1/AP-Metodologia-Vieira.pdf
Registro original: | Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Exemplares: | CNPTIA - (18751-1) - UPC - AP - DD -  -  -  - DIS