| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Unidades Centrais. |
|
Data corrente: |
10/11/2023 |
|
Data da última atualização: |
26/01/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
OLIVEIRA, L. B. DE; OLIVEIRA, S. A. S. de; MOREIRA, R. F. C.; DIAMANTINO, M. S. A. S.; RAMOS, A. P. de S.; SOARES, T. L.; FERREIRA, C. F. |
|
Afiliação: |
LAÍS BARRETO DE OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RECÔNCAVO DA BAHIA; SAULO ALVES SANTOS DE OLIVEIRA, CNPMF; RICARDO FRANCO CUNHA MOREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RECÔNCAVO DA BAHIA; MARIA SELMA ALVES SILVA DIAMANTINO, CNPMF; ANDRESA PRISCILA DE SOUZA RAMOS, CNPMF; TALIANE LEILA SOARES, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF. |
|
Título: |
Genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis populations using rep-PCR and VNTR molecular markers. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e03299, 2023. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03299 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Título em português: Diversidade genética de populações de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis em mandioca por meio de marcadores rep-PCR e VNTRs. |
|
Conteúdo: |
ABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) from eight populations from
five cassava producing states in Brazil, through the rep-PCR (BOX-PCR and ERIC-PCR) and variable number of tandem repeat (VNTR) markers. Cassava leaves with symptoms of cassava bacterial blight were collected in eight municipalities, and the Xpm isolates were identified by amplification with primers specific for these isolates. The identity of the Xpm isolates was confirmed with the BOX-PCR, ERIC-PCR, and VNTR markers. The observed selection pressure, together with the mode of reproduction and the mechanisms that increase genetic variability, allows of the pathogen populations to adapt according to microclimate variation, contributing to a differentiated reproductive success. ERIC-PCR and VNTRs are the best markers for evaluating the genetic variability in the eight studied Xpm populations. However, ERIC-PCR is the marker that best separated the groups by population and presented a higher similarity between the isolates of the same population. The study of the genetic diversity of Xpm is key to improve disease monitoring and management strategies in cassava crops.
RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) de oito populações de cinco estados produtores de mandioca no Brasil, por meio de marcadores rep-PCR (BOXPCR e ERIC-PCR) e variable number of tandem repeats (VNTRs). Folhas de mandioca com sintomas de crestamento bacteriano foram coletadas em oito municípios, e os isolados Xpm foram identificados por amplificação com iniciadores específicos para esses isolados. A identidade dos isolados Xmp foi confirmada com os marcadores BOX-PCR, ERIC-PCR e VNTRs. A pressão de seleção observada, junto com o modo de reprodução e os mecanismos que aumentam a variabilidade genética, permite que as populações do patógeno se adaptem de acordo com a variação dos microclimas, o que contribui para o sucesso reprodutivo diferenciado. ERIC-PCR e VNTRs são os melhores marcadores para avaliar a variabilidade genética das oito populações Xpm estudadas. No entanto, ERIC-PCR é o marcador que melhor separou os grupos por população e apresentou maior similaridade entre os isolados de uma mesma população. O estudo da diversidade genética de Xpm é fundamental para delinear estratégias de manejo e monitoramento de doenças na cultura da mandioca. MenosABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) from eight populations from
five cassava producing states in Brazil, through the rep-PCR (BOX-PCR and ERIC-PCR) and variable number of tandem repeat (VNTR) markers. Cassava leaves with symptoms of cassava bacterial blight were collected in eight municipalities, and the Xpm isolates were identified by amplification with primers specific for these isolates. The identity of the Xpm isolates was confirmed with the BOX-PCR, ERIC-PCR, and VNTR markers. The observed selection pressure, together with the mode of reproduction and the mechanisms that increase genetic variability, allows of the pathogen populations to adapt according to microclimate variation, contributing to a differentiated reproductive success. ERIC-PCR and VNTRs are the best markers for evaluating the genetic variability in the eight studied Xpm populations. However, ERIC-PCR is the marker that best separated the groups by population and presented a higher similarity between the isolates of the same population. The study of the genetic diversity of Xpm is key to improve disease monitoring and management strategies in cassava crops.
RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) de oito populações de cinco estados produtores de mandioca no Brasil, por meio de marcadores rep-PCR (BOXPCR e ERIC-PCR) e variable number of tandem repeat... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Diversidade genética. |
|
Thesagro: |
Mandioca; Manihot Esculenta; Marcador Molecular; Xanthomonas Phaseoli. |
|
Thesaurus Nal: |
Cassava; Plant genetics. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1158220/1/Genetic-diversity-Xanthomonas-phaseoli-2023.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03593naa a2200301 a 4500
001 2158220
005 2024-01-26
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03299$2DOI
100 1 $aOLIVEIRA, L. B. DE
245 $aGenetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis populations using rep-PCR and VNTR molecular markers.$h[electronic resource]
260 $c2023
500 $aTítulo em português: Diversidade genética de populações de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis em mandioca por meio de marcadores rep-PCR e VNTRs.
520 $aABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) from eight populations from five cassava producing states in Brazil, through the rep-PCR (BOX-PCR and ERIC-PCR) and variable number of tandem repeat (VNTR) markers. Cassava leaves with symptoms of cassava bacterial blight were collected in eight municipalities, and the Xpm isolates were identified by amplification with primers specific for these isolates. The identity of the Xpm isolates was confirmed with the BOX-PCR, ERIC-PCR, and VNTR markers. The observed selection pressure, together with the mode of reproduction and the mechanisms that increase genetic variability, allows of the pathogen populations to adapt according to microclimate variation, contributing to a differentiated reproductive success. ERIC-PCR and VNTRs are the best markers for evaluating the genetic variability in the eight studied Xpm populations. However, ERIC-PCR is the marker that best separated the groups by population and presented a higher similarity between the isolates of the same population. The study of the genetic diversity of Xpm is key to improve disease monitoring and management strategies in cassava crops. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) de oito populações de cinco estados produtores de mandioca no Brasil, por meio de marcadores rep-PCR (BOXPCR e ERIC-PCR) e variable number of tandem repeats (VNTRs). Folhas de mandioca com sintomas de crestamento bacteriano foram coletadas em oito municípios, e os isolados Xpm foram identificados por amplificação com iniciadores específicos para esses isolados. A identidade dos isolados Xmp foi confirmada com os marcadores BOX-PCR, ERIC-PCR e VNTRs. A pressão de seleção observada, junto com o modo de reprodução e os mecanismos que aumentam a variabilidade genética, permite que as populações do patógeno se adaptem de acordo com a variação dos microclimas, o que contribui para o sucesso reprodutivo diferenciado. ERIC-PCR e VNTRs são os melhores marcadores para avaliar a variabilidade genética das oito populações Xpm estudadas. No entanto, ERIC-PCR é o marcador que melhor separou os grupos por população e apresentou maior similaridade entre os isolados de uma mesma população. O estudo da diversidade genética de Xpm é fundamental para delinear estratégias de manejo e monitoramento de doenças na cultura da mandioca.
650 $aCassava
650 $aPlant genetics
650 $aMandioca
650 $aManihot Esculenta
650 $aMarcador Molecular
650 $aXanthomonas Phaseoli
653 $aDiversidade genética
700 1 $aOLIVEIRA, S. A. S. de
700 1 $aMOREIRA, R. F. C.
700 1 $aDIAMANTINO, M. S. A. S.
700 1 $aRAMOS, A. P. de S.
700 1 $aSOARES, T. L.
700 1 $aFERREIRA, C. F.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira$gv. 58, e03299, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 162 | |
| 141. |  | ANDRADE, W. B. de; VILARINHOS, A. D.; FERREIRA, C. F.; OLIVEIRA, S. A. S. de; HADDAD, F.; AMORIM, E. P.; SANTANA, L. R. de; ANDRADE, J. N. B. Sensibilidade a fungicidas de isolados de Mycosphaerella musicola no Estado da Bahia. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 7., 2013, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2013. Publicação online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|    |
| 142. | | OLIVEIRA, R. V. dos S.; MELLO, I. K. S.; HOHENFELD, C. S.; DIAMANTINO, M. S. A. S.; OLIVEIRA, S. A. S. de. Uso de Bacillus sp. e Trichoderma sp. como agentes de biocontrole das podridões seca e negra da mandioca. In: CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 15., 2021. Mulheres na ciência desafios, oportunidades e conquistas. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2021. 109 f. il. PDF.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 143. | | RIBEIRO, L. R.; SILVA, S. de O. e; OLIVEIRA, S. A. S. de; AMORIM, E. P.; SEREJO, J. A. dos S.; HADDAD, F. Sources of resistance to Fusarium oxysporum f. sp. cubense in banana germplasm. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 40, n. 1, e-202, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 145. | | LIMA, A. DE S.; SILVA, P. O. S. DA; SOUZA, C. P. F.; HOHENFELD, C. S.; DIAMANTINO, M. S. A. S.; SOUZA, F. V. D.; OLIVEIRA, S. A. S. de. Avaliação de bactérias associadas ao microbioma de Ananas na promoção de crescimento de abacaxizeiro cv. 'BRS Imperial'. In: CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 15., 2021. Mulheres na ciência desafios, oportunidades e conquistas. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2021. 109 f. il. PDF.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 146. | | CARVALHO, M. de J. da S. de; SOUZA, A. da S.; OLIVEIRA, E. J. de; OLIVEIRA, S. A. S. de; GOMES, V. B.; PINTO, C. R.; NEVES, P. T. das. Adequação de ferramentas biotecnológicas para limpeza de doenças e duplicação cromossômica em mandioca. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro :[anais]. Cruz das Almas, Ba, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 147. | | ROCHA, H. S.; ARAUJO, J. C. de; SILVA, A. C. M. da; OLIVEIRA, S. A. S. de; BORGES, A. L.; FERREIRA FILHO, J. R.; MEISSNER FILHO, P. E.; SILVEIRA, H. F. da; RINGENBERG, R.; CARDOSO, C. E. L. Recomendações técnicas para a produção de manivas-semente de mandioca a partir de mudas micropropagadas. O papel do "maniveiro" - Projeto RENIVA. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 148. | | OLIVEIRA, E. J. de; OLIVEIRA, S. A. S. de; OTTO, C.; ALICAI, T.; FREITAS, J. P. X. de; CORTES, D. F. M.; PARIYO, A.; LIRI, C.; ADIGA, G.; BALMER, A.; ROBINSON, M. A novel seed treatment-based multiplication approach for cassava planting material. Plos One, v.15, n.3, e0229943, March, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 149. | | OLIVEIRA, E. J. de; FUKUDA, W. M. G.; OLIVEIRA, S. A. S. de; RINGENBERG, R.; SILVA, M. R.; SOUZA, A. da S.; SILVA, A. L. L.; OLIVEIRA FILHO, M. dos S.; FARIA, M. L.; SILVA, R. de J. S. BRS Novo Horizonte - a new cassava variety for industrial use. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v.20, n.2. e28882028, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|  |
| 150. | | SILVA, A. dos S.; OLIVEIRA, E. J. de; HADDAD, F.; BARBOSA, F. F. L.; JESUS, O. N. de; OLIVEIRA, S. A. S. de; COSTA, M. A. P. de C.; FREITAS, J. P. X. de. Identification of passion fruit genotypes resistant to Fusarium oxysporum f. sp. Passiflorae. Tropical Plant Pathology, 3 Brasília, v.38 n.3, May/June 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 151. | | OLIVEIRA, L. B. DE; OLIVEIRA, S. A. S. de; MOREIRA, R. F. C.; DIAMANTINO, M. S. A. S.; RAMOS, A. P. de S.; SOARES, T. L.; FERREIRA, C. F. Genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis populations using rep-PCR and VNTR molecular markers. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e03299, 2023. Título em português: Diversidade genética de populações de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis em mandioca por meio de marcadores rep-PCR e VNTRs.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 152. | | BRITO, F. S. D.; SANTOS, J. R. P.; AZEVEDO, V. C. R.; PEIXOUTO, Y. S.; OLIVEIRA, S. A. S. de; FERREIRA, C. F.; HADDAD, F.; AMORIM, E. P.; FRAAIJE, B.; MILLER, R. N. G. Genetic Diversity and Azole fungicide sensitivity in pseudocercospora musae field populations in Brazil. Frontiers in Microbiology, v, 11, n.99, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 153. | | COSTA, J. L.; COSTA, S. N.; BRAGANÇA, C. A. D.; HERAI, R. R.; OLIVEIRA, S. A. S. de; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P.; BARBOSA, F. F. L.; FIGUEIRA, A. V. de O.; HADDAD, F. Interacción de Musa spp. x Fusarium oxysporum f. sp. cubense y Ia agresividad de Ias cepas dei patógeno en Brasil. In: CONGRESO INTERNACIONAL SOBRE BANANO. El Desafío de los Mercados Bananeros. Costa Rica: Corbana, 2014. [64 p.].| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 154. | | COSTA, J. L.; COSTA, S. N.; BRAGANÇA, C. A. D.; HERAI, R. R.; OLIVEIRA, S. A. S. de; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P.; BARBOSA, F. F. L.; FIGUEIRA, A. V. de O.; HADDAD, F. Interaction of Musa spp. x Fusarium oxysporum f. sp. cubense and aggressiveness of pathogen strains from Brazil. In: CONGRESO INTERNACIONAL SOBRE BANANO. El Desafío de los Mercados Bananeros. Costa Rica: Corbana, 2014. [64 p.].| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 155. | | SOUZA JUNIOR, L. C. de; PENA, L. de C.; RAMOS, A. P. de S.; OLIVEIRA, S. A. S. de; GESTEIRA, A. da S.; SOARES FILHO, W. dos S.; FERREIRA, C. F. Diversidade genética e Fingerprint molecular de porta-enxertos de citros via marcadores IRA. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2022. 38 p. il. (Embrapa Mandioca e Fruticultura.Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 142).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 156. | | TEIXEIRA, J. H. dos S.; GUIMARÃES, M. A. S.; CARDOSO, S. C.; BRITO, A. dos S.; PEIXOUTO, Y. S.; RIBEIRO, S. O.; OLIVEIRA, E. J. de; OLIVEIRA, S. A. S. de. Distribution of resistance of cassava genotypes to dry, soft and black root diseases and correlation to yield parameters. Journal of Phytopathology, 1-10, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 157. | | SOUZA, C. R. dos S.; BARBOSA, A. C. de O.; FERREIRA, C. F.; SOUZA, F. V. D.; ROCHA, L. DE S.; SOUZA, E. H. de; OLIVEIRA, S. A. S. de. Diversity of microorganisms associated to Ananas spp. from natural environment, cultivated and ex situ conservation áreas. Scientia Horticulturae, v. 243, p. 544-551, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 158. | | PEIXOUTO, Y. S.; BRAGANÇA, C. A. D.; ANDRADE, W. B.; FERREIRA, C. F.; HADDAD, F.; OLIVEIRA, S. A. S. de; BRITO, F. S. D.; MILLER, R. N. G.; AMORIM, E. P. Estimation of genetic structure of a Mycosphaerella musicola population using inter-simple sequence repeat markers. Genetics and Molecular Research, v.14, n. 3, p. 8046-8057, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 159. | | BARBEDO, J. G. A.; KOENIGKAN, L. V.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; COSTA, R. V. da; NECHET, K. de L.; GODOY, C. V.; LOBO JUNIOR, M.; PATRÍCIO, F. R. A.; TALAMINI, V.; CHITARRA, L. G.; OLIVEIRA, S. A. S. de; ISHIDA, A. K. N.; FERNANDES, J. M. C.; SANTOS, T. T.; CAVALCANTI, F. R.; TERAO, D.; ANGELOTTI, F. Annotated plant pathology databases for image-based detection and recognition of diseases. IEEE Latin America Transactions, v. 16, n. 6, p. 1749-1757, June 2018. Na publicação: B. A. Halfeld-Vieira, R. V. Costa, K. L. Nechet, S. A. S. Oliveira.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Algodão; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Trigo; Embrapa Uva e Vinho. |
| |
| 160. | | BARBEDO, J. G. A.; KOENIGKAN, L. V.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; COSTA, R. V. da; NECHET, K. de L.; GODOY, C. V.; LOBO JUNIOR, M.; PATRÍCIO, F. R. A.; TALAMINI, V.; CHITARRA, L. G.; OLIVEIRA, S. A. S. de; ISHIDA, A. K. N.; FERNANDES, J. M. C.; SANTOS, T. T.; CAVALCANTI, F. R.; TERAO, D.; ANGELOTTI, F. Annotated plant pathology databases for image-based detection and recognition of diseases. Revista IEEE America Latina, v. 16, n. 6, p. 1749-1757, jun. 2018. O título da revista foi grafado no artigo como IEEE LATIN AMERICA TRANSACTIONS, mas registro de título do periódico é REVISTA IEEE AMÉRICA LATINA.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio Ambiente. |
| |
| Registros recuperados : 162 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
