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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
06/01/2017 |
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Data da última atualização: |
09/02/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BUSS, C. E.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; MUDADU, M. de A.; CESAR, A. S. M.; VENTURA, R. V.; AFONSO, J.; LIMA, A. O. D.; COUTINHO, L. L.; TULLIO, R. R.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
C. E. BUSS, UFSCar; P. C. TIZIOTO, CPPSE; P. S. N. OLIVEIRA, CPPSE; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; A. S. M. CESAR, Esalq/USP; R. V. VENTURA, Beef Improvement Opportunities, Guelph; J. AFONSO, UFSCar; A. O. D. LIMA, UFSCar; L. L. COUTINHO, Esalq/USP; RYMER RAMIZ TULLIO, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Genome-wide efficient mixed-model study for meat quality in Nellore cattle. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Science, v. 94, p. 428-429, 2016. |
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DOI: |
10.2527/jam2016-0891 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Supplement 5. Na publicação: M. A. Mudadu. |
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Conteúdo: |
The quality of meat, which includes several traits such as tenderness, juiciness, and fat thickness, is essential for the beef industry. Previous genome-wide association studies (GWAS) using Bayesian methods have shown that Brazilian Nellore cattle have enough genetic variation for improvement of these traits. Thus, the aim of this study was to further identify quantitative trait loci (QTL) associated with meat-quality-related traits in Nellore beef cattle by using the univariate linear mixed model (LMM) approach implemented in the GEMMA software and compare it with our previous GWA studies performed using Bayesian approaches. A total of 387 Nelore steers comprising 34 half-sib families were genotyped using the IlluminaBovineHDBeadChip. We analyzed the association between markers and Warner-Bratzler shear force, backfat thickness, ribeye muscle area, scanning parameters lightness (L*), redness (a*), and yellowness (b*) to ascertain color characteristics of the meat, water-holding capacity, cooking loss, muscle pH, myofibrillar fragmentation index, saturated fat sum, omega-6 fatty acids sum, omega-3 fatty acids sum, and ethereal extract. These phenotypes were measured in the Longissimus dorsi muscle between the 11th and 13th ribs collected at slaughter. We identified fifty-three genomic regions that each contained at least one single nucleotide polymorphism (SNP) that showed a significant association with meat quality traits (1-Mb SNP windows). Highlighted, we found regions associated with three genes?neuronal growth regulator 1 (NEGR1, chr03: 70884613?71949611), dynamin 3, and phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class C (DNM3/PIGC, chr16: 37340706?38007593)?related to lipid metabolism and obesity. Our results provide a better understanding of QTL regions associated with meat quality unexplored in our previous Bayesian approach. MenosThe quality of meat, which includes several traits such as tenderness, juiciness, and fat thickness, is essential for the beef industry. Previous genome-wide association studies (GWAS) using Bayesian methods have shown that Brazilian Nellore cattle have enough genetic variation for improvement of these traits. Thus, the aim of this study was to further identify quantitative trait loci (QTL) associated with meat-quality-related traits in Nellore beef cattle by using the univariate linear mixed model (LMM) approach implemented in the GEMMA software and compare it with our previous GWA studies performed using Bayesian approaches. A total of 387 Nelore steers comprising 34 half-sib families were genotyped using the IlluminaBovineHDBeadChip. We analyzed the association between markers and Warner-Bratzler shear force, backfat thickness, ribeye muscle area, scanning parameters lightness (L*), redness (a*), and yellowness (b*) to ascertain color characteristics of the meat, water-holding capacity, cooking loss, muscle pH, myofibrillar fragmentation index, saturated fat sum, omega-6 fatty acids sum, omega-3 fatty acids sum, and ethereal extract. These phenotypes were measured in the Longissimus dorsi muscle between the 11th and 13th ribs collected at slaughter. We identified fifty-three genomic regions that each contained at least one single nucleotide polymorphism (SNP) that showed a significant association with meat quality traits (1-Mb SNP windows). Highlighted, we found regions a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genome-wide association studies. |
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Thesagro: |
Gado de corte. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Meat quality; Nellore; quantitative trait loci. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02864naa a2200337 a 4500
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005 2017-02-09
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520 $aThe quality of meat, which includes several traits such as tenderness, juiciness, and fat thickness, is essential for the beef industry. Previous genome-wide association studies (GWAS) using Bayesian methods have shown that Brazilian Nellore cattle have enough genetic variation for improvement of these traits. Thus, the aim of this study was to further identify quantitative trait loci (QTL) associated with meat-quality-related traits in Nellore beef cattle by using the univariate linear mixed model (LMM) approach implemented in the GEMMA software and compare it with our previous GWA studies performed using Bayesian approaches. A total of 387 Nelore steers comprising 34 half-sib families were genotyped using the IlluminaBovineHDBeadChip. We analyzed the association between markers and Warner-Bratzler shear force, backfat thickness, ribeye muscle area, scanning parameters lightness (L*), redness (a*), and yellowness (b*) to ascertain color characteristics of the meat, water-holding capacity, cooking loss, muscle pH, myofibrillar fragmentation index, saturated fat sum, omega-6 fatty acids sum, omega-3 fatty acids sum, and ethereal extract. These phenotypes were measured in the Longissimus dorsi muscle between the 11th and 13th ribs collected at slaughter. We identified fifty-three genomic regions that each contained at least one single nucleotide polymorphism (SNP) that showed a significant association with meat quality traits (1-Mb SNP windows). Highlighted, we found regions associated with three genes?neuronal growth regulator 1 (NEGR1, chr03: 70884613?71949611), dynamin 3, and phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class C (DNM3/PIGC, chr16: 37340706?38007593)?related to lipid metabolism and obesity. Our results provide a better understanding of QTL regions associated with meat quality unexplored in our previous Bayesian approach.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 8. | | SILVA, J. L. S. da; THEISEN, G.; BORTOLINI, F. Planejamento de uso das áreas em integração lavourapecuária. In: ENCONTRO DE INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA NO SUL DO BRASIL, 3., 2011, [Pato Branco]. [Anais.]. Synergismus scyentifica UTFPR, v. 6, n. 2, [s.p.], 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 10. | | BORTOLINI, F.; MITTELMANN, A.; LONGARAY, M. B.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Avaliação agronômica de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos no litoral Sul do Rio Grande do Sul, no ano agrícola 2010/2011. Pesquisa Agropecuária Gaúcha, Porto Alegre, v. 17, n. 1. p. 37-44, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | BORTOLINI, F.; MITTELMANN, A.; LONGARAY, M. B.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Avaliação agronômica de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos no Litoral Sul do Rio Grande do Sul no ano agrícola 2010 / 2011. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 56.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 39., 2011, Ijui. Atas e resumos. Porto Alegre: FEPAGRO, 2011. p. 18.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | BORTOLINI, F.; MITTELMANN, A.; LONGARAY, M. B.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Avaliação agronômica de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos no Litoral Sul do Rio Grande do Sul no ano agrícola 2010 / 2011. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 56.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 39., 2011, Ijui. Atas e resumos. Porto Alegre: FEPAGRO, 2011. p. 18.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 13. | | BORTOLINI, F.; MITTELMANN, A.; LONGARAY, M. B.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Avaliação agronômica de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos no litoral sul do Rio Grande do Sul, no ano agrícola 2010/2011. Pesquisa Agropecuária Gaucha, v. 17, n. 1, p. 37-44, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
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| 14. | | BORTOLINI, F.; ROSA, T. C.; SANTOS, H. S.; MITTELMANN, A.; SILVA, J. L. S. da. Avaliação de híbridos de sorgo silageiro no Litoral Sul do RS, no ano agrícola 2012/13 In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 58.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 41., 2013, Pelotas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 17. | | FONTANELI, R. S.; VARELLA, A. C.; SILVA, J. L. S. da; SANTOS, H. P. dos. Desempenho das forrageiras subtropicais em sistema de integração lavoura-pecuária e de integração pecuária-floresta. In: CORDEIRO, L. A. M.; VILELA, L.; KLUTHCOUSKI, J.; MARCHÂO, R. L. (Ed.). Integração lavoura-pecuária-floresta: o produtor pergunta, a Embrapa responde. Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 225-242.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 19. | | AMARAL, F. P. do; AGOUD, L.; SCHAFHAUSER JUNIOR, J.; AZAMBUJA, A.; SILVA, J. L. S. da. Desempenho de novilhas jersey em pastagens anuais de inverno e verão sob sistema de pastejo contínuo. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 22.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 15., 2013, Pelotas. [Anais.]. Pelotas: UFPel, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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