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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sudeste. Para informações adicionais entre em contato com cppse.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
05/11/2021 |
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Data da última atualização: |
10/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GIGLIOTI, R.; AZEVEDO, B. T.; OLIVEIRA, H. N. DE; KATIKI, L. M.; VERCESI FILHO, A. E.; OLIVEIRA, M. C. de S.; OKINO, C. H. |
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Afiliação: |
RODRIGO GIGLIOTI, IZ; BIANCA TAINÁ AZEVEDO, IZ; HENRIQUE NUNES DE OLIVEIRA, UNESP; LUCIANA MORITA KATIKI, IZ; ANIBAL EUGÊNIO VERCESI FILHO, IZ; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE. |
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Título: |
How long does the mRNA remains stable in untreated whole bovine blood? |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 49, n. 1, p. 789-795, jan. 2021. |
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DOI: |
10.1007/s11033-021-06808-w |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Conteúdo: |
Background High quality and quantity of messenger RNA (mRNA) are required for accuracy of gene expression studies and other RNA-based downstream applications. Since RNA is considered a labile macromolecular prone to degradation, which may result in falsely altered gene expression patterns, several commercial stabilizing reagents have been developed aiming to keep RNA stable for long period. However, for studies involving large number of experimental samples, the high costs related to these specifc reagents may constitute a barrier. Methods and results In this context the present study was designed aiming to evaluate the stability of mRNA in whole bovine blood collected in EDTA tubes during storage at common fridge (4 °C). Whole blood samples were collected from six Holstein calves and submitted to RNA extraction in each diferent interval: immediately after blood sampling (<2 h), at 1-day post-sampling (dps), 2 dps, 3 dps, 7 dps and 14dps intervals. RNA integrity and purity were evaluated, and RT-qPCR assays were run using seven diferent genes (B2M, ACTB, PPIA, GAPDH, YWHAZ, CD4 and IFN-γ) aiming to evaluate the presence of altered gene transcription during storage. All extracted RNA samples presented high purity, while optimal integrity and unaltered gene expression were observed in whole experimental group up to 3 days of storage. Conclusion Bovine blood RNA remained stable in K3EDTA tubes for 3 days stored at common fridge and can be success-fully and accurately used for gene expression studies. MenosBackground High quality and quantity of messenger RNA (mRNA) are required for accuracy of gene expression studies and other RNA-based downstream applications. Since RNA is considered a labile macromolecular prone to degradation, which may result in falsely altered gene expression patterns, several commercial stabilizing reagents have been developed aiming to keep RNA stable for long period. However, for studies involving large number of experimental samples, the high costs related to these specifc reagents may constitute a barrier. Methods and results In this context the present study was designed aiming to evaluate the stability of mRNA in whole bovine blood collected in EDTA tubes during storage at common fridge (4 °C). Whole blood samples were collected from six Holstein calves and submitted to RNA extraction in each diferent interval: immediately after blood sampling (<2 h), at 1-day post-sampling (dps), 2 dps, 3 dps, 7 dps and 14dps intervals. RNA integrity and purity were evaluated, and RT-qPCR assays were run using seven diferent genes (B2M, ACTB, PPIA, GAPDH, YWHAZ, CD4 and IFN-γ) aiming to evaluate the presence of altered gene transcription during storage. All extracted RNA samples presented high purity, while optimal integrity and unaltered gene expression were observed in whole experimental group up to 3 days of storage. Conclusion Bovine blood RNA remained stable in K3EDTA tubes for 3 days stored at common fridge and can be success-fully and accurately used ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Fridge; RNA integrity; Stability. |
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Thesaurus Nal: |
Cattle; Gene expression; Storage. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
22/09/2000 |
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Data da última atualização: |
14/03/2008 |
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Autoria: |
NUNES JUNIOR, J.; FARIA, L. C.; KIIHL, R. A. S.; ROLIM, R. B.; ALMEIDA, L. A.; MONTEIRO, P. M. F. O.; VIEIRA, N. E.; SOUZA, P. I. M.; ARANTES, N. E.; SILVA, L. O.; NEIVA, L. C. S.; GUIMARAES, L. B. |
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Título: |
Indicacao da cultivar de soja BRSGO Santa Cruz para o estado de Goias e Distrito Federal. |
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Ano de publicação: |
2000 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIAO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIAO CENTRAL DO BRASIL, 22., 2000, Cuiaba. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2000. |
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Páginas: |
p.107. |
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Série: |
(Embrapa Soja. Documentos, 144). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A cultivar BRSGO Santa Cruz e resultado do Cruzamento FT-14 x[Dourados-2(2) x SS-1], realizado pela Embrapa Soja, em Londrina-PR. A populacao segregante (F4) foi conduzida em 1993, na Estacao Experimental Filostro Machado Carneiro em Goias, pelo metodo genealogico modificado dando origem a linhagem GOBR93-158. Apos ter passado pelos testes preliminares de competicao P1, P2 e P3 participou da rede de Ensaios de Competicao Final nos anos de 1997/1998 a 1999/2000. Entre as principais caracteristicas destacam-se a resistencia ao cancro da haste, a mancha "olho-de-ra", a pustula bacteriana e periodo juvenil longo. Possui flor roxa, pubescencia marrom, hipocotilo roxo, vagem marrom, hilo marrom, habito de crescimento determinado e com ciclo total de 127 dias, altura media de planta de 85 cm, de insercao das primeiras vagens de 19 cm, boa resistencia ao acamamento deiscencia das vagens e peso medio de 100 sementes de 15,97 g. Comparativamente as testemunhas EMGOPA-315 e FT-109, apresentou um rendimento medio relativo de graos superior respectivamente a 1,5% e 5%. O rendimento medio de graos nos 28 experimentos foi de 3.122 kg/ha. Ela destina-se a semeadura em solos ferteis e bem corrigidos, com uma populacao de plantas de 280.000 a 320.000 pl/ha, sendo sua epoca ideal de plantio o mes de novembro. |
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Palavras-Chave: |
Brasil; Cultivar; Soybean. |
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Thesagro: |
Cerrado; Melhoramento; Soja. |
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Thesaurus NAL: |
Brazil; savannas; varieties. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02385naa a2200385 a 4500
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520 $aA cultivar BRSGO Santa Cruz e resultado do Cruzamento FT-14 x[Dourados-2(2) x SS-1], realizado pela Embrapa Soja, em Londrina-PR. A populacao segregante (F4) foi conduzida em 1993, na Estacao Experimental Filostro Machado Carneiro em Goias, pelo metodo genealogico modificado dando origem a linhagem GOBR93-158. Apos ter passado pelos testes preliminares de competicao P1, P2 e P3 participou da rede de Ensaios de Competicao Final nos anos de 1997/1998 a 1999/2000. Entre as principais caracteristicas destacam-se a resistencia ao cancro da haste, a mancha "olho-de-ra", a pustula bacteriana e periodo juvenil longo. Possui flor roxa, pubescencia marrom, hipocotilo roxo, vagem marrom, hilo marrom, habito de crescimento determinado e com ciclo total de 127 dias, altura media de planta de 85 cm, de insercao das primeiras vagens de 19 cm, boa resistencia ao acamamento deiscencia das vagens e peso medio de 100 sementes de 15,97 g. Comparativamente as testemunhas EMGOPA-315 e FT-109, apresentou um rendimento medio relativo de graos superior respectivamente a 1,5% e 5%. O rendimento medio de graos nos 28 experimentos foi de 3.122 kg/ha. Ela destina-se a semeadura em solos ferteis e bem corrigidos, com uma populacao de plantas de 280.000 a 320.000 pl/ha, sendo sua epoca ideal de plantio o mes de novembro.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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