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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
20/01/2017 |
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Data da última atualização: |
25/01/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VASCONCELOS, L. M.; BRITO, A. C.; CARMO, C. D.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
L. M. VASCONCELOS, UFRB; A. C. BRITO; C. D. CARMO, UFRB; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Polymorphism of starch pathway genes in cassava. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n.4,[2016?]. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The distribution and frequency of single nucleotide polymorphisms (SNPs) can help to understand changes associated with characteristics of interest. We aimed to evaluate nucleotide diversity in six genes involved in starch biosynthesis in cassava using a panel of 96 unrelated accessions. The genes were sequenced, aligned, and used to obtain values for nucleotide diversity (?), segregating sites (?), Tajima?s D test, and neighbor-joining (NJ) clustering. On average, one SNP per 147 and 171 bp was identified in exon and intron regions, respectively. Thirteen heterozygous loci were found. Three of seven SNPs in the exon region resulted in non-synonymous replacement or four synonymous substitutions. However, no associations were noted between SNPs and root dry-matter content. The parameter ? ranged from 0.0001 (granule bound starch synthase I) to 0.0033 (?-amylase), averaging 0.0011, while ? ranged from 0.00014 (starch branching enzyme) to 0.00584 (starch synthase I), averaging 0.002353. The diversity value was typically double that of the ?. Results of the D test did not suggest any evidence of deviance of neutrality in these genes. Among the evaluated accession, 82/96 were clustered using the NJ method but without a clear separation of the root dry-matter content, root pulp coloration, and classification of the cyanogenic compound content. High variation in genes of the starch biosynthetic pathway can be used to identify associations with the functional properties of starch for the use of polymorphisms for selection purposes. MenosThe distribution and frequency of single nucleotide polymorphisms (SNPs) can help to understand changes associated with characteristics of interest. We aimed to evaluate nucleotide diversity in six genes involved in starch biosynthesis in cassava using a panel of 96 unrelated accessions. The genes were sequenced, aligned, and used to obtain values for nucleotide diversity (?), segregating sites (?), Tajima?s D test, and neighbor-joining (NJ) clustering. On average, one SNP per 147 and 171 bp was identified in exon and intron regions, respectively. Thirteen heterozygous loci were found. Three of seven SNPs in the exon region resulted in non-synonymous replacement or four synonymous substitutions. However, no associations were noted between SNPs and root dry-matter content. The parameter ? ranged from 0.0001 (granule bound starch synthase I) to 0.0033 (?-amylase), averaging 0.0011, while ? ranged from 0.00014 (starch branching enzyme) to 0.00584 (starch synthase I), averaging 0.002353. The diversity value was typically double that of the ?. Results of the D test did not suggest any evidence of deviance of neutrality in these genes. Among the evaluated accession, 82/96 were clustered using the NJ method but without a clear separation of the root dry-matter content, root pulp coloration, and classification of the cyanogenic compound content. High variation in genes of the starch biosynthetic pathway can be used to identify associations with the functional properties of starch fo... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
10/01/2018 |
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Data da última atualização: |
22/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
OLIVEIRA, B. C. S. de; ARAUJO, A. C. de; PINTO, C. A. D.; SOUZA, C. M. de A.; SANTIAGO, A. V.; TRINDADE, I. A. |
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Afiliação: |
Bárbara Cristina Santos de Oliveira, UFRA; ALESSANDRO CARIOCA DE ARAUJO, CPATU; Carlos Alberto Dias Pinto, Bolsista DTI/CNPq/CPATU; CLEO MARCELO DE ARAUJO SOUZA, CPATU; ALAILSON VENCESLAU SANTIAGO, CPATU; IVANILDO ALVES TRINDADE, CPATU. |
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Título: |
Caracterização da variação sazonal do CO2 atmosférico em sistema ILPF no Leste da Amazônia. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORKSHOP BRASILEIRO DE MICROMETEOROLOGIA, 10., 2017, Santa Maria, RS. [Anais]. [Santa Maria: UFSM, 2017]. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Diante dos impactos antrópicos causados principalmente após a Revolução Industrial, como a queima de combustíveis fósseis, desmatamento e o preparo intensivo do solo, tem ocorrido o aumento da emissão de gases de efeito estufa (GEE). Dentre as formas de mitigação de GEE, há aquelas realizadas através da agropecuária, como o manejo adequado do solo e a remoção de CO2 pelas plantas por meio dos sistemas de consórcio. Estudos apontam que uma alternativa viável é o sistema de integração lavoura-pecuária floresta (iLPF), que é composto por espécies arbóreas e forrageiras. A medição da concentração do CO2 atmosférico ([CO2]) em iLPF pode indicar respostas que servirão como base ao monitoramento deste ecossistema na região amazônica. Medidas do perfil vertical da [CO2] foram obtidas em campanhas intensivas durante os períodos menos chuvoso de 2016, e mais chuvoso e menos chuvoso de 2017, no município de Terra Alta, PA. Houve maior amplitude nas [CO2] medidas no período menos chuvoso de 2017 e maiores concentrações diurnas em relação aos outros períodos. A sazonalidade é um fator que influencia na [CO2] no sistema iLPF. A [CO2] só começa a aumentar e acumular abaixo do dossel a partir de 20:00 horas, quando a atmosfera está mais estável. |
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Palavras-Chave: |
Perfil vertical. |
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Thesagro: |
Mogno; Teca. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170785/1/Resumo-Barbara-Oliveira-workshop-micro-2017.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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