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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
19/02/2019 |
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Data da última atualização: |
17/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUSA, T. V.; CAIXETA, E. T.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; RESENDE, M. D. V. de. |
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Afiliação: |
TIAGO VIEIRA SOUSA, BIOAGRO/BioCafé/Universidade Federal de Viçosa - UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, CNPCa; EMILLY RUAS ALKIMIM, Universidade Federal do Triângulo Mineiro - UFTM; ANTONIO CARLOS BAIAO DE OLIVEIRA, CNPCa; ANTONIO ALVES PEREIRA, Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais – Epamig; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitotecnia; LAÉRCIO ZAMBOLIM, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitopatologia; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF. |
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Título: |
Early Selection Enabled by the Implementation of Genomic Selection in Coffea arabica Breeding. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 9, January 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genomic Selection (GS) has allowed the maximization of genetic gains per unit time in several annual and perennial plant species. However, no GS studies have addressed Coffea arabica, the most economically important species of the genus Coffea. Therefore, this study aimed (i) to evaluate the applicability and accuracy of GS in the prediction of the genomic estimated breeding value (GEBV); (ii) to estimate the genetic parameters; and (iii) to evaluate the time reduction of the selection cycle by GS in Arabica coffee breeding. A total of 195 Arabica coffee individuals, belonging to 13 families in generation of F2, susceptible backcross and resistant backcross, were phenotyped for 18 agronomic traits, and genotyped with 21,211 SNP molecular markers. Phenotypic data, measured in 2014, 2015, and 2016, were analyzed by mixed models. GS analyses were performed by the G-BLUPmethod, using the RKHS (Reproducing Kernel Hilbert Spaces) procedure, with a Bayesian algorithm. Heritabilities and selective accuracies were estimated, revealing moderate to high magnitude for most of the traits evaluated. Results of GS analyses showed the possibility of reducing the cycle time by 50%, maximizing selection gains per unit time. The effect of marker density on GS analyses was evaluated. Genomic selection proved to be promising for C. arabica breeding. The agronomic traits presented high complexity for they are controlled by several QTL and showed low genomic heritabilities, evidencing the need to incorporate genomic selection methodologies to the breeding programs of this species. MenosGenomic Selection (GS) has allowed the maximization of genetic gains per unit time in several annual and perennial plant species. However, no GS studies have addressed Coffea arabica, the most economically important species of the genus Coffea. Therefore, this study aimed (i) to evaluate the applicability and accuracy of GS in the prediction of the genomic estimated breeding value (GEBV); (ii) to estimate the genetic parameters; and (iii) to evaluate the time reduction of the selection cycle by GS in Arabica coffee breeding. A total of 195 Arabica coffee individuals, belonging to 13 families in generation of F2, susceptible backcross and resistant backcross, were phenotyped for 18 agronomic traits, and genotyped with 21,211 SNP molecular markers. Phenotypic data, measured in 2014, 2015, and 2016, were analyzed by mixed models. GS analyses were performed by the G-BLUPmethod, using the RKHS (Reproducing Kernel Hilbert Spaces) procedure, with a Bayesian algorithm. Heritabilities and selective accuracies were estimated, revealing moderate to high magnitude for most of the traits evaluated. Results of GS analyses showed the possibility of reducing the cycle time by 50%, maximizing selection gains per unit time. The effect of marker density on GS analyses was evaluated. Genomic selection proved to be promising for C. arabica breeding. The agronomic traits presented high complexity for they are controlled by several QTL and showed low genomic heritabilities, evidencing the need to ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Accelerating improvement; Complex traits; Ganho genético; Genetic gains; Genomic-enabled prediction accuracy; Selective efficiency; SNP molecular marker. |
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Thesagro: |
Café; Coffea Arábica. |
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Thesaurus Nal: |
Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/193820/1/Early-selection-enabled-by-the-implementation.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/197479/1/2019-M.Deon-FPS-Early.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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| Registros recuperados : 382 | |
| 241. |  | COSTAMILAN, L. M.; BERTAGNOLLI, P. F.; OLIVEIRA, A. C. B. de; MELO, C. L. P. de; SOARES, R. M.; CLEBSCH, C. C. Resistência a Phytophthora sojae em linhagens de soja da Embrapa, em 2020. Passo Fundo, RS: Embrapa Trigo, maio 2021. 11 p. (Embrapa Trigo. Circular Técnica online, 63).| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Trigo. |
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| 243. | | CHAGAS, F. E. de O.; BARBOSA, I. de P.; LANA, M. E. G.; PEREIRA, V. V.; SUDÁRIO, A. F.; FERREIRA, P. H. S.; OLIVEIRA, A. C. B. de. Rede de correlação entre caracteres fenotípicos de cultivares de Coffea arabica. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 245. | | EMYGDIO, B. M.; MACHADO, J. R. A.; MEIRELLES, W.; PEREIRA, F. R.; BACKES, R. L.; OLIVEIRA, A. C. B. de; GUADAGNIN, J. P.; RODRIGUES, L. R. Rede Embrapa Sul de variedades de milho na região de clima temperado. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 56.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 39., 2011, Ijui. Atas e resumos. Porto Alegre: FEPAGRO, 2011. p. 20.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 246. | | GOMES, C. B.; LIMA-MEDINA, I.; COUTO, M. E. O.; SCHNEIDE, L. F.; OLIVEIRA, A. C. B. de; ROSENTHAL, M. D. Registros de ocorrência do nematoide das galhas (meloidogyne spp.) Em soja na metade sul do rio grande do Sul. Root-knot nematode report (Meloidogyne spp.) in soybean in the southern half of Rio Grande do Sul State. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 31., 2013, Cuiabá. Nematoides: desafios e manejo - anais. Cuiabá: Sociedade Brasileira de Namatologia, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 247. | | LANA, M. E. G.; BARBOSA, I. de P.; PEREIRA, V. V.; SUDÁRIO, A. F.; CHAGAS, F. E. de O.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de. Qualidade de bebida de cultivares de Coffea arabica em função do processamento pós-colheita. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 570| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 248. | | BARBOSA, I. de P.; LANA, M. E. G.; OLIVEIRA, D. R. de; FERREIRA, P. H. S.; FERRAZ, A. G.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A. Qualidade de bebida de cultivares de Coffea arabica na região das matas de minas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 571| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 251. | | EMYGDIO, B. M.; MACHADO, J. R. de A.; GUADAGNIN, J. P.; MEIRELLES, W.; PEREIRA, F. R.; BACKES, R. L.; OLIVEIRA, A. C. B. de; RODRIGUES, L. R. Recomendação de variedades de milho para o Sul do Brasil para a safra 2011/12. Pesquisa Agropecuária Gaúcha, Porto Alegre, v. 17, n. 1. p. 7-13, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 252. | | EMYGDIO, B. M.; MACHADO, J. R. de A.; GUADAGNIN, J. P.; MEIRELLES, W.; PEREIRA, F. R.; BLACKES, R. L.; OLIVEIRA, A. C. B. de; RODRIGUES, L. R. Recomendação de variedades de milho para o sul do Brasil para a safra 2011/12. Pesquisa Agropecuária Gaúcha, Porto Alegre, v. 17, n. 1, 7-13, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 253. | | CARVALHO, J. P. F.; ANDRADE, V. T.; ABRAHÃO, J. C. de R.; CARVALHO, G. R. de; BOTELHO, C. E.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de. Seleção genética de progênies de cafeeiro com potencial de cultivar. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 254. | | FEITOSA, F. de M.; ALMEIDA, D. P. de; ZAMBOLIM, L.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; CAIXETA, E. T. Seleção assistida por marcadores moleculares de cafeeiros resistentes a ferrugem e antracnose dos frutos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 98| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 255. | | ALKIMIM, E. R.; CAIXETA, E. T.; SOUSA, T. V.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Seleção assistida por marcadores moleculares para resistência à ferrugem do cafeeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 256. | | OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SILVA, F. L. da; PEREIRA, H. de A.; BONOMO, V. S.; BOTELHO, C. E.; REZENDE, J. C. de. Seleção de cafeeiros arábicas portadores do gene SH3 de resistência à ferrugem. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 257. | | REZENDE, J. C. de; CARVALHO, G. R.; BOTELHO, C. E.; OLIVEIRA, A. C. B. de; SILVA, F. L. da; PEREIRA, A. A. Seleção na predição de ganhos genéticos em progênies de coffea arabica. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 258. | | OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SILVA, F. L. da; PEREIRA, H. de A.; BOTELHO, C. E.; REZENDE, J. C. de. Seleção de progênies F2 de café arábica, visando produtividade e resistência à ferrugem. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA CAFEEIROAS, 36., 2010, Guarapari. Anais...Brasília, DF: Embrapa Café, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 259. | | MALTA, M. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; LISKA, G. R.; CARVALHO, G. R.; PEREIRA, A. A.; SILVA, A. D.; ALVAR, L. N.; MOTA, D. M. Selection of Elite Genotypes of Coffee arabica L. to Produce Specialty Coffees. Frontiers in Sustainable Food Systems, v. 5, Jul. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 260. | | CARLI, R. de; ROSA, F. K. da; HAMMES, J.; OLIVEIRA, A. C. B. de; ROSA, A. P. S. A. da; EMYGDIO, B. M. Desempenho de genótipos de soja em área de rotação com a cultura do arroz irrigado no RS. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 845-847.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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