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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
07/10/2008 |
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Data da última atualização: |
07/10/2008 |
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Autoria: |
NIVA, C. C.; LEE, J. M.; MYOHARA, M. |
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Título: |
PCNA as a cell proliferation marker in the oligochaete Enchytraeus japonensis. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON SOIL ZOOLOGY, 15; INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON APTERYGOTA, 12., 2008, Curitiba. Biodiversity, conservation and sustainabele management of soil animal: abstracts. Colombo: Embrapa Florestas. Editors: George Gardner Brown; Klaus Dieter Sautter; Renato Marques; Amarildo Pasini. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
PCNA (proliferating cell nuclear antigen) is a protein involved in DNA replication expressed in
dividing cells which has been used as a cell proliferation marker for clinical studies of neoplastic
tissues in vertebrates, and also for developmental studies in several vertebrates and
invertebrates. Among invertebrates, PCNA has been detected by immunohistochemical methods
in several organisms, including the fragmenting oligochaete annelid E. japonensis. Despite the
apparent positive cross-reaction with commercially available antibodies, it was unknown whether
PCNA protein was really synthesized by E. japonensis. The objective of this study was to clarify
this question and verify whether PCNA could be used as a reliable molecular marker for
proliferative cells during E. japonensis regeneration, growth and embryo development at the
RNA level. For that purpose we cloned a cDNA encoding PCNA from E. japonensis by carrying
out degenerate PCR with primers designed from the conserved regions of known PCNAs using
a cDNA library of regenerating E. japonensis as the template. Two full-length cDNA sequences
with identical deduced amino acid sequence were obtained and the amino acid sequence
showed high similarity to known PCNAs of other organisms. We analyzed the gene expression
by RT-PCR and in situ hybridization in whole mounts (WISH) and paraffin sections in intact and
regenerating worms. The results showed a strong expression of pcna gene in the developing
growth zone of intact worms. In regenerating fragments, pcna expression was first detected in a
few cells in the vicinity of the amputated surface, and then clearly seen in cell agglomerates in
the blastema as regeneration progressed. Embryos also showed strong expression. We conclude
that pcna is a good cell proliferation marker for E. japonensis and may be a good biomarker to
study effects of stressors on developmental processes. MenosPCNA (proliferating cell nuclear antigen) is a protein involved in DNA replication expressed in
dividing cells which has been used as a cell proliferation marker for clinical studies of neoplastic
tissues in vertebrates, and also for developmental studies in several vertebrates and
invertebrates. Among invertebrates, PCNA has been detected by immunohistochemical methods
in several organisms, including the fragmenting oligochaete annelid E. japonensis. Despite the
apparent positive cross-reaction with commercially available antibodies, it was unknown whether
PCNA protein was really synthesized by E. japonensis. The objective of this study was to clarify
this question and verify whether PCNA could be used as a reliable molecular marker for
proliferative cells during E. japonensis regeneration, growth and embryo development at the
RNA level. For that purpose we cloned a cDNA encoding PCNA from E. japonensis by carrying
out degenerate PCR with primers designed from the conserved regions of known PCNAs using
a cDNA library of regenerating E. japonensis as the template. Two full-length cDNA sequences
with identical deduced amino acid sequence were obtained and the amino acid sequence
showed high similarity to known PCNAs of other organisms. We analyzed the gene expression
by RT-PCR and in situ hybridization in whole mounts (WISH) and paraffin sections in intact and
regenerating worms. The results showed a strong expression of pcna gene in the developing
growth zone of intact worms... Mostrar Tudo |
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520 $aPCNA (proliferating cell nuclear antigen) is a protein involved in DNA replication expressed in dividing cells which has been used as a cell proliferation marker for clinical studies of neoplastic tissues in vertebrates, and also for developmental studies in several vertebrates and invertebrates. Among invertebrates, PCNA has been detected by immunohistochemical methods in several organisms, including the fragmenting oligochaete annelid E. japonensis. Despite the apparent positive cross-reaction with commercially available antibodies, it was unknown whether PCNA protein was really synthesized by E. japonensis. The objective of this study was to clarify this question and verify whether PCNA could be used as a reliable molecular marker for proliferative cells during E. japonensis regeneration, growth and embryo development at the RNA level. For that purpose we cloned a cDNA encoding PCNA from E. japonensis by carrying out degenerate PCR with primers designed from the conserved regions of known PCNAs using a cDNA library of regenerating E. japonensis as the template. Two full-length cDNA sequences with identical deduced amino acid sequence were obtained and the amino acid sequence showed high similarity to known PCNAs of other organisms. We analyzed the gene expression by RT-PCR and in situ hybridization in whole mounts (WISH) and paraffin sections in intact and regenerating worms. The results showed a strong expression of pcna gene in the developing growth zone of intact worms. In regenerating fragments, pcna expression was first detected in a few cells in the vicinity of the amputated surface, and then clearly seen in cell agglomerates in the blastema as regeneration progressed. Embryos also showed strong expression. We conclude that pcna is a good cell proliferation marker for E. japonensis and may be a good biomarker to study effects of stressors on developmental processes.
700 1 $aLEE, J. M.
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773 $tIn: INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON SOIL ZOOLOGY, 15; INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON APTERYGOTA, 12., 2008, Curitiba. Biodiversity, conservation and sustainabele management of soil animal: abstracts. Colombo: Embrapa Florestas. Editors: George Gardner Brown; Klaus Dieter Sautter; Renato Marques; Amarildo Pasini. 1 CD-ROM.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Solos. |
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Data corrente: |
02/12/2022 |
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Data da última atualização: |
05/12/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PIMENTEL, L. G.; REIS, A. M. H. dos; MARTINS, G. C.; FREGONEZI, F. R.; GONÇALVES, A. O.; TEIXEIRA, W. G. |
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Afiliação: |
LETÍCIA GUIMARÃES PIMENTEL, BOLSISTA ZARC; ALINE MARI HUF DOS REIS, BOLSISTA ZARC; GILVAN COIMBRA MARTINS, CPAA; FABRICIO RESENDE FREGONEZI, AGROPECUÁRIA JAYORO; ALEXANDRE ORTEGA GONCALVES, CNPS; WENCESLAU GERALDES TEIXEIRA, CNPS. |
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Título: |
Ajuste de equações de retenção de água em Latossolos Amarelos muito argilosos da Amazônia Central. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORKSHOP DE SIMULAÇÃO DE FLUXOS DE ÁGUA E SOLUTOS NO SOLO, 2022, Rio de Janeiro. Simulação de fluxos de água e solutos no solo. Rio de Janeiro: Ed. dos Autores, 2022. p. 39-43. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Para determinar a curva de retenção de água no solo (CRA) em solos com distribuição bimodal de poros, o modelo proposto por van Genuchten não os ajusta adequadamente. Entre outros modelos para descrever a CRA, a equação de Durner é frequentemente utilizada para a descrição de solos bimodais. O objetivo principal deste trabalho foi comparar os modelos unimodal (van Genuchten-Mualem) e bimodal (Durner) para descrição da CRA de um Latossolo Amarelo presente no município de Presidente Figueiredo (Estado do Amazonas - Brasil). Amostras indeformadas de solo foram coletadas em diferentes profundidades na Fazenda Jayoro, sob cultivo de cana-de-açúcar, e estas foram submetidas a tensões matriciais (cm) de 0; 10; 30; 60; 100; 330; 1100; 5000 e 15000 até o equilíbrio quando a água volumétrica do solo foi medida. O software Hyprop foi utilizado para obter os parâmetros das equações da CRA uni e bimodal, e foram considerados os menores valores da raiz do erro quadrático médio (RMSE) como parâmetros de ajuste para comparar as equações. O teor de água disponível para a planta (AD) também foi calculado. O modelo de Durner apresentou menores valores de RMSE para todas as profundidades avaliadas. Além disso, os maiores valores de AD foram verificados para quatro dos seis pontos avaliados. |
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Palavras-Chave: |
Água disponível; Distribuição bimodal; Equação de Durner. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1149187/1/Ajuste-de-equacoes-de-retencao-de-agua-em-Latossolos-Amarelos-2022.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1149140/1/Ajuste-de-equacoes-de-retencao-de-agua-em-Latossolos-Amarelos-2022.pdf
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Marc: |
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520 $aPara determinar a curva de retenção de água no solo (CRA) em solos com distribuição bimodal de poros, o modelo proposto por van Genuchten não os ajusta adequadamente. Entre outros modelos para descrever a CRA, a equação de Durner é frequentemente utilizada para a descrição de solos bimodais. O objetivo principal deste trabalho foi comparar os modelos unimodal (van Genuchten-Mualem) e bimodal (Durner) para descrição da CRA de um Latossolo Amarelo presente no município de Presidente Figueiredo (Estado do Amazonas - Brasil). Amostras indeformadas de solo foram coletadas em diferentes profundidades na Fazenda Jayoro, sob cultivo de cana-de-açúcar, e estas foram submetidas a tensões matriciais (cm) de 0; 10; 30; 60; 100; 330; 1100; 5000 e 15000 até o equilíbrio quando a água volumétrica do solo foi medida. O software Hyprop foi utilizado para obter os parâmetros das equações da CRA uni e bimodal, e foram considerados os menores valores da raiz do erro quadrático médio (RMSE) como parâmetros de ajuste para comparar as equações. O teor de água disponível para a planta (AD) também foi calculado. O modelo de Durner apresentou menores valores de RMSE para todas as profundidades avaliadas. Além disso, os maiores valores de AD foram verificados para quatro dos seis pontos avaliados.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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