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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
22/12/2005 |
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Data da última atualização: |
22/12/2005 |
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Autoria: |
BINDE, D. R.; CHUEIRE, L. M. O.; LUCASI. H.; NICOLÁS, M. F.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. P.; SOUZA, R. C.; MARTINEZ-ROMERO, E.; FERNANDO GOMES BARCELLOS, F. G.; SILVA, M. F.; GARCIA, J. E.; HUNGRIA, H. |
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Título: |
Seqüenciamento do plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SEMANA DE BIOTECNOLOGIA, 1., 2005, Londrina. [Resumos]. Londrina: UEL, 2005. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo - Pdf. 41. |
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Conteúdo: |
O objetivo desse trabalho foi seqüenciar parcialmente o plasmídeo simbiótico da estirpe
CFN 299 de Rhizobium tropici, que se associa simbioticamente ao feijoeiro ( Phaseolus
vulgaris), estabelecendo o processo de fixação biológica do nitrogênio. Inicialmente foram
construídas bibliotecas "shotgun" pela fragmentação do DNA ao acaso, por nebulização, obtendo fragmentos de 500 pares de bases (pb) a2 kb. Os fragmentos foram reparados e fosforilados por Klenow da DNA polimerase de Escherichia coli e separados em gel de agarose "low melting". A seguir, foram recuperados e ligados ao vetor pUC18, digerido com a enzima de restrição SmaI-BAP e defosforilados com a enzima T4 DNA ligase. Após a ligação, o material foi utilizado para transformação por eletroporação de células de E. coli estirpe DH10B. As células foram plaqueadas em meio contendo ampicilina, IPTG e X-gal e foram crescidas durante a noite, a 37° C. Colônias brancas individuais ( clones recombinantes) foram inoculadas em meio de cultura com ampicilina e crescidas, procedendo-se ao estoque a -80% e a novo crescimento, conforme descrito, para extração do DNA, realizado pelo método de rompimento alcalino. Após a precipitação, filtragem e verificação da concentração, o seqüenciamento foi realizado pelo método dos terminadores fluorescentes, em um seqüenciador automático MegaBACE ( Amersham Pharmacia Biotech). As leituras obtidas foram submetidas a análises de bioinformática. Até o presente momento foram construídas duas bibliotecas e foram realizadas 1.325 leituras, com o depósito de 1.220.032 pb. MenosO objetivo desse trabalho foi seqüenciar parcialmente o plasmídeo simbiótico da estirpe
CFN 299 de Rhizobium tropici, que se associa simbioticamente ao feijoeiro ( Phaseolus
vulgaris), estabelecendo o processo de fixação biológica do nitrogênio. Inicialmente foram
construídas bibliotecas "shotgun" pela fragmentação do DNA ao acaso, por nebulização, obtendo fragmentos de 500 pares de bases (pb) a2 kb. Os fragmentos foram reparados e fosforilados por Klenow da DNA polimerase de Escherichia coli e separados em gel de agarose "low melting". A seguir, foram recuperados e ligados ao vetor pUC18, digerido com a enzima de restrição SmaI-BAP e defosforilados com a enzima T4 DNA ligase. Após a ligação, o material foi utilizado para transformação por eletroporação de células de E. coli estirpe DH10B. As células foram plaqueadas em meio contendo ampicilina, IPTG e X-gal e foram crescidas durante a noite, a 37° C. Colônias brancas individuais ( clones recombinantes) foram inoculadas em meio de cultura com ampicilina e crescidas, procedendo-se ao estoque a -80% e a novo crescimento, conforme descrito, para extração do DNA, realizado pelo método de rompimento alcalino. Após a precipitação, filtragem e verificação da concentração, o seqüenciamento foi realizado pelo método dos terminadores fluorescentes, em um seqüenciador automático MegaBACE ( Amersham Pharmacia Biotech). As leituras obtidas foram submetidas a análises de bioinformática. Até o presente momento foram construídas duas biblio... Mostrar Tudo |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
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520 $aO objetivo desse trabalho foi seqüenciar parcialmente o plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici, que se associa simbioticamente ao feijoeiro ( Phaseolus vulgaris), estabelecendo o processo de fixação biológica do nitrogênio. Inicialmente foram construídas bibliotecas "shotgun" pela fragmentação do DNA ao acaso, por nebulização, obtendo fragmentos de 500 pares de bases (pb) a2 kb. Os fragmentos foram reparados e fosforilados por Klenow da DNA polimerase de Escherichia coli e separados em gel de agarose "low melting". A seguir, foram recuperados e ligados ao vetor pUC18, digerido com a enzima de restrição SmaI-BAP e defosforilados com a enzima T4 DNA ligase. Após a ligação, o material foi utilizado para transformação por eletroporação de células de E. coli estirpe DH10B. As células foram plaqueadas em meio contendo ampicilina, IPTG e X-gal e foram crescidas durante a noite, a 37° C. Colônias brancas individuais ( clones recombinantes) foram inoculadas em meio de cultura com ampicilina e crescidas, procedendo-se ao estoque a -80% e a novo crescimento, conforme descrito, para extração do DNA, realizado pelo método de rompimento alcalino. Após a precipitação, filtragem e verificação da concentração, o seqüenciamento foi realizado pelo método dos terminadores fluorescentes, em um seqüenciador automático MegaBACE ( Amersham Pharmacia Biotech). As leituras obtidas foram submetidas a análises de bioinformática. Até o presente momento foram construídas duas bibliotecas e foram realizadas 1.325 leituras, com o depósito de 1.220.032 pb.
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773 $tIn: SEMANA DE BIOTECNOLOGIA, 1., 2005, Londrina. [Resumos]. Londrina: UEL, 2005.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 49 | |
| 22. |  | SOUZA, R. C. de; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLAS, M. F.; HUNGRIA, M. Biodiversidade de procariotos em solo sob plantio direto e plantio convencional em rotação ou sucessão de culturas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBILOGIA, 26.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BACTÉRIAS LÁTICAS; ENCONTRO NACIONAL DE PROFESSORES DE MICROBIOLOGIA; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURAS, 4., 2011, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: SBM, 2011. Resumo, 365-1.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 23. | | ELIAS NETO, N.; LOUREIRO, M. de F.; NICOLÁS, M. F.; MARIANOWSKI, T.; TORRES, A. R.; HUNGRIA, M. Identification of Discolobium species indigenous to the Brazilian Pantanal ecosystem by microsatellite (SSRs) markers. Semina, Ciência Agrárias, Londrina, v. 33, Supl. 1, p. 3017-3022, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 24. | | NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M.; ARIAS, C. A. A.; MARIANOWSKI, T.; CAMPO, R. J.; NODARI, R, O. Desempenho simbiótico de cultivares de soja e busca de marcadores moleculares relacionados à fixação biológica do nitrogênio (04.2001.338-2). In: HOFFMANN-CAMPO, C. B.; SARAIVA, O. F. (Org.). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2002: microbiologia de solos. Londrina: Embrapa Soja, 2003. p. 59-75. (Embrapa Soja. Documentos, 216).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 25. | | HUNGRIA, M.; NICOLAS, M. F.; GUIMARAES, C. T.; JARDIM, S. N.; GOMES, E. A.; VASCONCELOS, A. T. R. de. Tolerance to stress and environmental adaptability of Chromobacterium violaceum. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 3, n. 1, p. 102-116, 2004.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 26. | | HUNGRIA, M.; NICOLÁS, M. F.; GUIMARAES, C. T.; JARDIM, S. N.; GOMES, E. A.; VASCONCELOS, A. T. T. de. Tolerance to stress and environmental adaptability of Chromobacterium violaceum. Genetics and Molecular Research, v. 3, n. 1, p. 102-116, Mar. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 27. | | HUNGRIA, M.; CAMPO, R. J.; CHUEIRE, L. M. O.; MENDES, I. C.; FRANCHINI, J. C.; ANDRADE, D. S.; NICOLÁS, M. F.; GRANGE, L.; LOUREIRO, M. de F. Aspectos agronômicos da fixação simbiótica do nitrogênio no Brazil. In: REUNIÓN LATINOAMERICANA DE RHIZOBIOLOGIA, 21.; CONGRESO NACIONAL DE LA FIJACIÓN BIOLÓGICA DE NITRÓGENO, 6., 2002. Cocoyoc. Memorias... [S.l.]: Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno; Universidade Nacional Autónoma de México, 2002. p. 53.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 28. | | MEDEIROS, J. D.; CANTAO, M. E.; CESAR, D. E.; NICOLÁS, M. F.; DINIZ, C. G.; SILVA, V. L.; VASCONCELOS, A. T. R. de; COELHO, C. M. Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, SP, v. 47, n. 4, p. 835-845, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 29. | | GODOY, L. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; CHUEIRE, L. M. de O.; SOUZA, R. C.; NICOLÁS, M. F.; BARCELLOS, F. G.; HUNGRIA, M. Genomic panorama of Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, a commercial inoculant strain largely established in Brazilian soils and belonging to the same serogroup as USDA 123. Soil Biology & Biochemistry, v. 40, n. 11, p. 2743-2753, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 30. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; GONZAGA, L.; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico e bioprospecção de genes de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (SEMIA 4080) utilizada em inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 31. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 98-103. (Embrapa Soja. Documentos, 268).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 32. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 156-161. (Embrapa Soja. Documentos, 276).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 33. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NÍCOLAS, M. F.; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe SEMIA 5079 (=CPAC 15) de Bradyrhizobium japonicum, recomendada para inoculantes comerciais na cultura da soja. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 34. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; GONZAGA, L.; ANDRE, E.; HUNGRIA, M. Panorama genômico de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (Semia 4080). In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 50-55. (Embrapa Soja. Documentos, 268).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 36. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; SOUZA, L. G. R. C.; HUNGRIA, M. Sequênciamento genômico e bioprospecção de genes de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (SEMIA 4080) utilizada em inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 116-121. (Embrapa Soja. Documentos, 276).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 37. | | BELLINI, R. G.; CORONADO, M. A.; PASCHOAL, A. R.; REGO, T. G. do; HUNGRIA, M.; VASCONCELOS, A. T. R. de; NICOLAS, M. F. Structural analysis of a novel N-carbamoyl-D-amino acid amidohydrolase from a Brazilian Bradyrhizobium japonicum strain: In silico insights by molecular modelling, docking and molecular dynamics. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 86, p. 35-42, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 38. | | BINDE, D. R.; HUNGRIA, M.; CHUEIRE, L. M. de O.; LUCAS, I. H.; NICOLÁS, M. F.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; MARTINEZ-ROMERO, E.; BARCELLOS, F. G.; SILVA, M. F. da. Análise estrutural do plasmídio simbiótico de Rhizobium tropici CFN299. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 102-105. (Embrapa Soja. Documentos, 276).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 39. | | HUNGRIA, M.; ASTOLFI FILHO, S.; CHUEIRE, L. M. de O.; NICOLÁS, M. F.; SANTOS, E. B. P.; BULBOL, M. R.; SOUZA FILHO, A.; NOGUEIRA ASSUNÇÃO, E.; GERMANO, M. G.; VASCONCELOS, A. T. R. Genetic characterization of Chromobacterium isolates from black water environments in the Brazilian Amazon. Letters in Applied Microbiology, Oxford, v. 41, n. 1, p. 17-23, July 2005.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 40. | | PINTO, F. G. S.; CHUEIRE, L. M. O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; ALMEIDA, L. G. P.; SOUZA, R. C.; MENNA, P.; BARCELLOS, F. G.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M. Novel genes related to nodulation, secretion systems, and surface structures revealed by a genome draft of Rhizobium tropici strain PRF 81. Functional & Integrative Genomics, Heidelberg, v. 9, n. 2, p. 263-270, May 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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