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Biblioteca(s):  Embrapa Uva e Vinho.
Data corrente:  18/12/2023
Data da última atualização:  18/12/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  FAJARDO, T. V. M.; PERES, C. A.; NICKEL, O.
Afiliação:  THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; CAIO ANTONIETTE PERES, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO RIO GRANDE DO SUL; OSMAR NICKEL, CNPUV.
Título:  Análise das curvas de dissociação de alta resolução de RT-PCR em tempo real para detetar e diferenciar variantes brasileiras de vírus da videira
Ano de publicação:  2023
Fonte/Imprenta:  Ciência e Técnica Vitivinícola, v. 38, n. 2, p. 188-195, 2023.
DOI:  https://doi.org/10.1051/ctv/ctv20233802188
Idioma:  Português
Conteúdo:  Detectar e identificar infecções virais em plantas perenes, como videiras, pode ser um desafio. Portanto, o objetivo deste estudo foi realizar uma análise da curva de dissociação de alta resolução (HRM) por RT-PCR em tempo real (RT-qPCR) para detectar e diferenciar variantes do vírus do enrolamento foliar tipo 3 (GLRaV-3) e do vírus do urticado ou nó-curto (GFLV) em 74 e 10 plantas infetadas, respectivamente, mantidas em blocos de coleções de videiras. Uma única curva de amplificação foi gerada para cada amostra por RT-qPCR. Considerando a região amplificada dos genomas dos dois vírus, foi possível identificar diferentes variantes de GLRaV-3 e GFLV, que apresentaram valores de temperatura de dissociação (Tm) significamente diferentes entre si, refletindo diferenças nas sequências de nucleotídeos dos respectivos DNA amplificados e, assim, constituindo uma forma simplificada de diferenciar variantes e avaliar a diversidade viral em acessos de videiras. A análise de HRM foi validada pelo sequenciamento e comparação de nucleotídeos de isolados brasileiros de GLRaV-3 e GFLV.
Palavras-Chave:  GFLV; GLRaV-3; HRM; RT-qPCR; Sequence variants; Variantes de sequência.
Categoria do assunto:  --
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1159852/1/Fajardo-CiencTecVit-V-38-n2-p188-195-2023.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Uva e Vinho (CNPUV)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPUV19199 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O. Afídeos (Homoptera: Aphidoidea) da Província de Misiones, Argentina. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.22, n.4, p.353-358, abr. 1987.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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2.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O. Doenças causadas por vírus em morangos, amoras pretas, framboesas e mirtilos. In.: SEMINÁRIO BRASILEIRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS, 1., 2003, Bento Gonçalves, RS. Anais... Bento Gonçalves: SBPF, p. 41-47, 2004. (Embrapa Uva e vinho. Documentos, 37).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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3.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O. Doenças causadas por vírus. In.: Imagem marcado/desmarcado KOVALESKI, A. (ed.). Maçã: fitossanidade. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2004. 85 p. il. (Frutas do Brasil, 38). p. 61-83.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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4.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O. Die Blattlausfauna von Misiones (Argentinien) mit besonderer berucksichtigung der Citrusblattlause (Homoptera : Aphididae), ihrer abundanzdynamik und flugaktivitat in beziehung zur Epidemiologie des Citrus Tristeza Virus. 1982. 148 p. Tese (Doutorado em Agronomia) - Rheinischen Friedrich-Wilhelms-Universitat, Bonn.
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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5.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O. Um marcador fluorescente extraido de pomeleiros (Citrus paradisi Macf.) e laranjeiras (C. sinensis Obs.) afetados pela sorose tipo-Bahia. Revista Brasileira de Fruticultura, Cruz das Almas, v.13, n.4, p.167-172, 1991.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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6.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O. A situação atual da sorose dos citros no mundo. Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 1998. 35p. (Embrapa Mandioca e Fruticultura. Documentos, 72). Memória.
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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7.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O. Viroses em frutíferas de clima temperado: potencial e quantificação de danos à produção e qualidade dos frutos. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE FRUTICULTURA DE CLIMA TEMPERADO, 6., 2003, Fraiburgo. Anais... Caçador: EPAGRI, 2003. p. 173-183.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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8.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O. Vírus em macieira. Cultivar Hortaliças e Frutas, Pelotas, v. 2 n. 13, p. 31-34, abr./maio 2002. p. 31-34. il.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - C
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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9.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O. (ed.). Vinicultor californiano faz doação de US$ 500,000.00 para apoiar a produção de videiras sadias. Agapomi, n. 269, p. 03, out. 2016. Osmar Nickel (CNPUV) Tradutor texto extraido de : http://www.growingproduce.com/fruits/grapes/vintner-donates-500000-to-help-ensure-clean-grapevines/
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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10.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; COELHO, Y. S. Declinio dos citros na Bahia: transmissibilidade Cruz das Almas, BA: EMBRAPA-CNPMF, 1995 2p. EMBRAPA-CNPMF. Pesquisa em Andamento, 30
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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11.Imagem marcado/desmarcadoKUHN, G. B.; NICKEL, O. Viroses e sua importância na viticultura brasileira. Informe Agropecuário, Belo Horizonte, v. 19, n. 194, p. 85-91, 1998. p. 85-91
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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12.Imagem marcado/desmarcadoALVES, S. A. M.; NICKEL, O. Infecções virais como fator de predisposição para o desenvolvimento da Mancha foliar de glomerella em macieiras Maxi Gala. Tropical Plant Pathology, v. 35, p. S151, ago. 2010. 35 Resumo (04.108) apresentado no XLIII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2010, Cuiabá.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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13.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. Eliminação de vírus latentes de macieiras por quimioterapia e cultiva de meristemas in vitro. Bento Gonçalves, RS: Embrapa Uva e Vinho, 2016. (Embrapa Uva e Vinho. Comunicado Técnico, 193)
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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14.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. Elimination of apple latent viruses by in vitro chemotherapy and meristem-culturing. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, p. 2217-2220, 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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15.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. Detecção de vírus de macieiras e pereiras por IC-RT-PCR usando anticorpos policlonais contra proteínas virais expressadas em Escherichia coli. Bento Gonçalves, RS: Embrapa Uva e Vinho, 2016. (Embrapa Uva e Vinho. Comunicado Técnico, 182)
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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16.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. Detection of four viruses in apples and pears by real time RT-PCR using 5'-hydrolysis probes. Journal of the Brazilian Society for Virology, Novo Hamburgo, v. 18, p. 28-29, 2013. Resumo apresentado no XXIV Brazilian Congress of Virology & VIII Mercosur Meeting of Virology, September, 1 - 4, 2013 - Porto Seguro, Bahia.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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17.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. Detection of Viruses in Apples and Pears by Real Time RT-PCR Using 5'-Hydrolysis Probes Journal of Plant Pathology, v. 96, n. 1, p. 207-213, 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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18.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. Descobertos novos vírus e um viróide nas cvs. Royal Gala e Mishima no Brasil. Agapomi, n. 322, p. 4, março 2021.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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19.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. Ocorrência de viroses em morangueiros no Rio Grande do Sul e produção de matrizes de cultivares comerciais de morangos livres de vírus. Jornal da Fruta, Lages, v. 18, n. 222, p. 24, jan. 2010.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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20.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. Obtenção de material propagativo livre de vírus e diagnóstico de vírus em macieiras e pereiras. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2009. 54 p. il., color. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 69).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho.
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