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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
05/11/2021 |
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Data da última atualização: |
05/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OKINO, C. H.; CAMINOTTO, L. C. F.; KAPRITCHKOFF, R. T. I.; NICIURA, S. C. M.; ESTEVES, S. N.; SANTOS, I. B. DOS; TOSCANO, J. H. B.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S. |
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Afiliação: |
CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE; LARA CRISTINA FRIZONI CAMINOTTO, UNICEP; RAFAELA TAMI IKEDA KAPRITCHKOFF, UNESP; SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; SERGIO NOVITA ESTEVES, CPPSE; ISABELLA BARBOSA DOS SANTOS, UNESP; JOAO HENRIQUE BARBOSA TOSCANO, UNESP; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
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Título: |
Comparison of ovine B-globin haplotype sequences and a new multiplex PCR for identification. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Veterinary Parasitology, v.300, 109592, dec. 2021. |
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Páginas: |
5 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.vetpar.2021.109592 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Deletion of pre-adult BC-globin in sheep harboring BB haplotype of B-globin was associated to decreased tolerance to anemia and hypoxia, and consequently, reduced resistance to Haemonchus contortus infection, which is closely related to severe anemia. Recently, a qPCR using hydrolysis probe was successfully developed for B-globin haplotype identification, and association between resistance against H. contortus and presence of ?A allele was observed in Morada Nova sheep. Thus, this study aimed to better investigate the differences between B-globin haplotypes and to develop a conventional multiplex PCR, as an alternative to qPCR assay for B-globin haplotype identification. A total of 333 Morada Nova lambs had their blood collected and tested by both qPCR and new multiplex PCR, and 100 % of agreement was observed between the results. Since different primers were designed for such assay development, including different target genes, high specificity of both methods may be also highlighted. Three A haplotype samples were submitted to DNA Sanger sequencing of B-globin gene and compared to sequences previously deposited in Genbank. One nucleotide deletion in intronic region was observed only in AA haplotype of Morada Nova animals, while in BB animals the nucleotide remained present. To the best of our knowledge, this is the first report of multiplex conventional PCR for ovine B-globin haplotype identification. The advantages of the developed conventional PCR are reduced reagents costs (less than a half price) and wider reachability, since even labs without real time PCR thermocyclers are able to offer this assay. Therefore, it may become an important tool for sheep producers to improve genetic selection of parasite resistant animals. MenosDeletion of pre-adult BC-globin in sheep harboring BB haplotype of B-globin was associated to decreased tolerance to anemia and hypoxia, and consequently, reduced resistance to Haemonchus contortus infection, which is closely related to severe anemia. Recently, a qPCR using hydrolysis probe was successfully developed for B-globin haplotype identification, and association between resistance against H. contortus and presence of ?A allele was observed in Morada Nova sheep. Thus, this study aimed to better investigate the differences between B-globin haplotypes and to develop a conventional multiplex PCR, as an alternative to qPCR assay for B-globin haplotype identification. A total of 333 Morada Nova lambs had their blood collected and tested by both qPCR and new multiplex PCR, and 100 % of agreement was observed between the results. Since different primers were designed for such assay development, including different target genes, high specificity of both methods may be also highlighted. Three A haplotype samples were submitted to DNA Sanger sequencing of B-globin gene and compared to sequences previously deposited in Genbank. One nucleotide deletion in intronic region was observed only in AA haplotype of Morada Nova animals, while in BB animals the nucleotide remained present. To the best of our knowledge, this is the first report of multiplex conventional PCR for ovine B-globin haplotype identification. The advantages of the developed conventional PCR are reduced reagents co... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Allele; B haplotype; Beta globin C; Morada Nova; Resistance. |
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Thesaurus Nal: |
Sheep. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Trigo. |
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Data corrente: |
25/03/2015 |
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Data da última atualização: |
16/06/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Documentos |
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Autoria: |
KARAM, D.; SILVA, W. T. da; VARGAS, L.; GAZZIERO, D. L. P. |
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Afiliação: |
DECIO KARAM, CNPMS; WILTON TAVARES DA SILVA, BOLSISTA; LEANDRO VARGAS, CNPT; DIONISIO LUIZ PISA GAZZIERO, CNPSO. |
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Título: |
Levantamento de plantas daninhas em regiões produtoras de milho e soja nos Estados de Goiás e Minas Gerais. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2014. |
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Páginas: |
31 p. |
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Descrição Física: |
il. |
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Série: |
(Embrapa Milho e Sorgo. Documentos, 175). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Dentre os fatores prejudiciais ao rendimento e à produtividade agrícola, a interferência imposta pelas plantas daninhas pode ser considerada uma das mais importantes, pois em casos extremos pode reduzir a produção de soja e milho em mais de 60%. Uma das formas de conhecer as populações de plantas daninhas é a utilização de parâmetros fitossociológicos, como densidade, frequência, abundância, índice de valor de importância e índices de similaridade. Outros estudos, como a distribuição espacial e temporal das plantas daninhas, se apresentam também como de fundamental importância pois este conhecimento auxilia na seleção de técnicas de manejo que visem reduzir as populações destas plantas em níveis que não ocasionem prejuízos diretos ou indiretos à cultura de interesse nem venham a se tornar problemas nas safras seguintes. Este documento disponibiliza mapas de distribuição das principais plantas daninhas presentes nos sistemas de produção de soja e milho nos estados de Goiás e Minas Gerais, capaz de propiciar aos leitores o conhecimento da dispersão e distribuição destas nestes estados. Estas informações contribuem para tomadas de decisões pelos produtores, agrônomos, técnicos, pesquisadores e extensionistas para que retardem o surgimento dos problemas verificados em outras regiões produtoras, como o caso da buva (Conyza sp.) e do capim amargoso (Digitaria insularis) resistentes ao herbicida glyphosate, e mesmo a seleção de espécies de difícil controle, como a erva-de-santa luzia (Chamaesyce hirta). Espera-se, portanto, que o manejo integrado de plantas daninhas se tornem cada vez mais sustentável, levando os agricultores a produzir em sistemas que visem mais a proteção ao meio ambiente e a saúde da população, de forma mais econômica. MenosDentre os fatores prejudiciais ao rendimento e à produtividade agrícola, a interferência imposta pelas plantas daninhas pode ser considerada uma das mais importantes, pois em casos extremos pode reduzir a produção de soja e milho em mais de 60%. Uma das formas de conhecer as populações de plantas daninhas é a utilização de parâmetros fitossociológicos, como densidade, frequência, abundância, índice de valor de importância e índices de similaridade. Outros estudos, como a distribuição espacial e temporal das plantas daninhas, se apresentam também como de fundamental importância pois este conhecimento auxilia na seleção de técnicas de manejo que visem reduzir as populações destas plantas em níveis que não ocasionem prejuízos diretos ou indiretos à cultura de interesse nem venham a se tornar problemas nas safras seguintes. Este documento disponibiliza mapas de distribuição das principais plantas daninhas presentes nos sistemas de produção de soja e milho nos estados de Goiás e Minas Gerais, capaz de propiciar aos leitores o conhecimento da dispersão e distribuição destas nestes estados. Estas informações contribuem para tomadas de decisões pelos produtores, agrônomos, técnicos, pesquisadores e extensionistas para que retardem o surgimento dos problemas verificados em outras regiões produtoras, como o caso da buva (Conyza sp.) e do capim amargoso (Digitaria insularis) resistentes ao herbicida glyphosate, e mesmo a seleção de espécies de difícil controle, como a erva-de-santa luz... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Brasil; Distribuição espacial; Planta daninha; Planta invasora. |
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Thesagro: |
Glycine max; Zea mays. |
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Categoria do assunto: |
--
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/125440/1/doc-175.pdf
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Marc: |
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520 $aDentre os fatores prejudiciais ao rendimento e à produtividade agrícola, a interferência imposta pelas plantas daninhas pode ser considerada uma das mais importantes, pois em casos extremos pode reduzir a produção de soja e milho em mais de 60%. Uma das formas de conhecer as populações de plantas daninhas é a utilização de parâmetros fitossociológicos, como densidade, frequência, abundância, índice de valor de importância e índices de similaridade. Outros estudos, como a distribuição espacial e temporal das plantas daninhas, se apresentam também como de fundamental importância pois este conhecimento auxilia na seleção de técnicas de manejo que visem reduzir as populações destas plantas em níveis que não ocasionem prejuízos diretos ou indiretos à cultura de interesse nem venham a se tornar problemas nas safras seguintes. Este documento disponibiliza mapas de distribuição das principais plantas daninhas presentes nos sistemas de produção de soja e milho nos estados de Goiás e Minas Gerais, capaz de propiciar aos leitores o conhecimento da dispersão e distribuição destas nestes estados. Estas informações contribuem para tomadas de decisões pelos produtores, agrônomos, técnicos, pesquisadores e extensionistas para que retardem o surgimento dos problemas verificados em outras regiões produtoras, como o caso da buva (Conyza sp.) e do capim amargoso (Digitaria insularis) resistentes ao herbicida glyphosate, e mesmo a seleção de espécies de difícil controle, como a erva-de-santa luzia (Chamaesyce hirta). Espera-se, portanto, que o manejo integrado de plantas daninhas se tornem cada vez mais sustentável, levando os agricultores a produzir em sistemas que visem mais a proteção ao meio ambiente e a saúde da população, de forma mais econômica.
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700 1 $aVARGAS, L.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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