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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
20/06/2022 |
Data da última atualização: |
27/06/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOUZA, M. I. F.; VISOLI, M. C.; TORRES, T. Z.; OSAWA, C. C.; SILVA, A. R. da; GIACHETTO, P. F.; NHANI JUNIOR, A.; FALCAO, P. R. K. |
Afiliação: |
MARCIA IZABEL FUGISAWA SOUZA, CNPTIA; MARCOS CEZAR VISOLI, CNPTIA; TERCIA ZAVAGLIA TORRES, CNPTIA; CARLA CRISTIANE OSAWA, CNPTIA; ALESSANDRA RODRIGUES DA SILVA, SGE; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; ANTONIO NHANI JUNIOR, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA. |
Título: |
Catalogação de datasets ômicos no Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Biblioteconomia e Documentação, v. 18, p. 1-28, 2022. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
RESUMO. O estudo teve o objetivo de definir e estabelecer regras mínimas para a catalogação de datasets ômicos, oriundos do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa (LMB), no Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa (Redape). Foram adotados os seguintes procedimentos metodológicos: i) revisão bibliográfica; ii) construção do estado do conhecimento sobre catalogação; iii) identificação de regras mínimas para descrição de datasets; iv) exploração dos elementos metadados do software Dataverse; v) identificação de atributos para descrever elementos metadados; vi) estabelecimento de regras para orientar a descrição de elementos, campos e subcampos dos esquemas Metadados de Citação e Metadados Ciência da Vida. Como resultados foram definidas e estabelecidas: i) regras mínimas de catalogação e descrição de metadados, contemplando aspectos da representação descritiva e temática; ii) instruções para o preenchimento do formulário de catalogação no Redape, uma instância do software Dataverse; iii) orientações para o uso de vocabulários controlados FAIR; iv) recomendações para revisão na catalogação de datasets. O artigo relata a experiência de catalogação de datasets ômicos no Redape, descrevendo as orientações estabelecidas para a geração de metadados qualificados, descritos de acordo com padrões internacionais de representação descritiva, e em aderência aos princípios FAIR. A aderência aos princípios FAIR assegura a interoperabilidade e o compartilhamento, bem como o uso e o reúso dos dados de pesquisa, aspectos preconizados nas diretrizes e estratégias da Política de Governança de Dados, Informação e Conhecimento da Embrapa. MenosRESUMO. O estudo teve o objetivo de definir e estabelecer regras mínimas para a catalogação de datasets ômicos, oriundos do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa (LMB), no Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa (Redape). Foram adotados os seguintes procedimentos metodológicos: i) revisão bibliográfica; ii) construção do estado do conhecimento sobre catalogação; iii) identificação de regras mínimas para descrição de datasets; iv) exploração dos elementos metadados do software Dataverse; v) identificação de atributos para descrever elementos metadados; vi) estabelecimento de regras para orientar a descrição de elementos, campos e subcampos dos esquemas Metadados de Citação e Metadados Ciência da Vida. Como resultados foram definidas e estabelecidas: i) regras mínimas de catalogação e descrição de metadados, contemplando aspectos da representação descritiva e temática; ii) instruções para o preenchimento do formulário de catalogação no Redape, uma instância do software Dataverse; iii) orientações para o uso de vocabulários controlados FAIR; iv) recomendações para revisão na catalogação de datasets. O artigo relata a experiência de catalogação de datasets ômicos no Redape, descrevendo as orientações estabelecidas para a geração de metadados qualificados, descritos de acordo com padrões internacionais de representação descritiva, e em aderência aos princípios FAIR. A aderência aos princípios FAIR assegura a interoperabilidade e o compartilhamento, bem como o ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Biological data; Catalogação; Dados biológicos; Datasets; Datasets ômicos; Descriptive representation; Gestão de dados de pesquisa; Representação descritiva; Representação temática; Research data management; Thematic representation. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/236568/1/AP-Catalogacao-datasets-omicos-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Registros recuperados : 63 | |
8. | | MAR, T. B.; LAU, D.; NHANI JUNIOR, A.; SCHONS, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; PEREIRA, J. F. Barley and cereal yellow dwarf virus genetic diversity in Brazil. Virus: reviews and research, v. 14, p. 77-78, 2009. Suplemento, ref. 060. Edição dos Resumos do XX National Meeting of Virology, Brasília, DF, nov. 2009.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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9. | | MAR, T. B.; LAU, D.; SCHONS, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; BRAMMER, S. P.; NHANI JUNIOR, A. Caracterização molecular de isolados virais associados ao nanismo amarelo dos cereais visando à seleção e o desenvolvimento de genótipos de trigo resistentes. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 3., 2007, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2007. 1 p. html. (Embrapa Trigo. Documentos Online, 82).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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10. | | MAR, T. B.; LAU, D.; YAMAZAKI-LAU, E.; SCHONS, J.; NHANI JUNIOR, A. Caracterização molecular de isolados virais do Barley/Cereal Yellow Dwarf Virus (B/CYDV) do Rio Grande do Sul. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 4., 2008, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2008. 1 p. html. (Embrapa Trigo. Documentos online, 94).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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11. | | YAMAZAKI-LAU, E.; LAU, D.; SCHONS, J.; NHANI JUNIOR, A.; BRAMMER, S. P. Caracterização molecular de isolados do vírus do nanismo amarelo do Rio Grande do Sul. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 2., 2008, Passo Fundo. Atas e resumos... Passo Fundo: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Embrapa Trigo: Embrapa Transferência de Tecnologia, 2008. 1 p. 1 CD-ROM. Fitopatologia, 6. Área: Fitopatologia.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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13. | | MAR, T. B.; LAU, D.; SCHONS, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; NHANI JUNIOR, A. Molecular identification based on coat protein sequences of the Barley yellow dwarf virus from Brazil. Scientia Agrícola, Piracicaba, v. 70, n. 6, p. 428-434, Nov./Dec. 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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15. | | MAR, T. B.; LAU, D.; NHANI JUNIOR, A.; SCHONS, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; PEREIRA, J. F. Diversidade genética do barley e cereal yellow dwarf virus no Brasil. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 5., 2009, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2009. 1 p. html. (Embrapa Trigo. Documentos online, 115).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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16. | | BUENO, P.; LAU, E. Y.; BINNECK, E.; NHANI JUNIOR, A.; SCAGLIUSI, S. M. M. RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 15.; MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 12., 2020, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2021. p. 48.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Soja. |
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17. | | BUENO, P.; LAU, E. Y.; BINNECK, E.; NHANI JUNIOR, A.; SCAGLIUSI, S. M. M. RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 15.; MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 12., 2020, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2021. p. 48.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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18. | | BRAMMER, S. P.; SCAGLIUSI, S. M. M.; BONATO, A. L. V.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; NHANI JUNIOR, A. Biotecnologia aplicada à cultura do trigo. In: PIRES, J. L. F.; VARGAS, L.; CUNHA, G. R. da (Ed.). Trigo no Brasil: bases para produção competitiva e sustentável. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2011. Cap. 18, p. 453-488.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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19. | | GONZÁLES, H.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; NHANI JUNIOR, A.; PEREIRA, J. F.; WEBBER, N. F. Prospection for genes expressed during wheat - Magnaporthe oryzae interaction. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 4., 2013, Bento Gonçalves. Resumos... Bento Gonçalves: Sociedade Brasileira de Genética, 2013. p. 38.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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