|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
18/12/2012 |
Data da última atualização: |
26/03/2013 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
BINNECK, E.; NASCIMENTO, L. S. do. |
Afiliação: |
ELISEU BINNECK, CNPSO; LUCAS SOARES DO NASCIMENTO. |
Título: |
A web-based platform for RNA-Seq data analysis and storage: a case study on soybean gene expression experiments. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CROP SCIENCE CONGRESS, 6., 2012, Bento Gonçalves. [Proceedings...]. [S.l.]: International Crop Science Society, 2012. 1 CD-ROM. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The availability of the soybean genome sequence and the rapid evolution of DNA sequencing technologies in recent years bring us exciting new promises for scientific discovery and its conversion into required technological breakthroughs in the production and use of soybean. In addition to be a major protein source in animal feeds, soybean is ranked number one among the chief oil crops in the world and is becoming a major crop for biodiesel production. As a leguminous crop, soybean fixes nitrogen in association with Bradyrhizobium, which significantly reduces the needs for ammonium-based fertilizer even in other crops. In this presentation, it will be described using a web-based platform, Soybean Gene Express, for analyzing and storing RNA-Seq data from whole-genome transcription profiling experiments. It will be presented firsthand how Soybean Gene Express supports researchers going from raw data to visual reports comparing the different genes within same sample or comparing gene expression across different biological samples/conditions. Also, it will be explored the power of link-based integration with other sources of biological information and databases such as ontologies, KEGG pathways, Pfam, and others, to uncover the biological meaning of these data. The ultimate goal is to facilitate the discovery of new biological insights into fundamental molecular processes as responses to biotic and abiotic stresses in soybean. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática. |
Thesagro: |
Gene; Genoma; Soja. |
Thesaurus Nal: |
Gene expression; Soybeans. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/79694/1/ELISEU-BINNECK.docx
|
Marc: |
LEADER 02100nam a2200193 a 4500 001 1943038 005 2013-03-26 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aBINNECK, E. 245 $aA web-based platform for RNA-Seq data analysis and storage$ba case study on soybean gene expression experiments. 260 $aIn: INTERNATIONAL CROP SCIENCE CONGRESS, 6., 2012, Bento Gonçalves. [Proceedings...]. [S.l.]: International Crop Science Society, 2012. 1 CD-ROM.$c2012 520 $aThe availability of the soybean genome sequence and the rapid evolution of DNA sequencing technologies in recent years bring us exciting new promises for scientific discovery and its conversion into required technological breakthroughs in the production and use of soybean. In addition to be a major protein source in animal feeds, soybean is ranked number one among the chief oil crops in the world and is becoming a major crop for biodiesel production. As a leguminous crop, soybean fixes nitrogen in association with Bradyrhizobium, which significantly reduces the needs for ammonium-based fertilizer even in other crops. In this presentation, it will be described using a web-based platform, Soybean Gene Express, for analyzing and storing RNA-Seq data from whole-genome transcription profiling experiments. It will be presented firsthand how Soybean Gene Express supports researchers going from raw data to visual reports comparing the different genes within same sample or comparing gene expression across different biological samples/conditions. Also, it will be explored the power of link-based integration with other sources of biological information and databases such as ontologies, KEGG pathways, Pfam, and others, to uncover the biological meaning of these data. The ultimate goal is to facilitate the discovery of new biological insights into fundamental molecular processes as responses to biotic and abiotic stresses in soybean. 650 $aGene expression 650 $aSoybeans 650 $aGene 650 $aGenoma 650 $aSoja 653 $aBioinformática 700 1 $aNASCIMENTO, L. S. do
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 13 | |
3. | | REINHARDT, D. H. R. C.; NASCIMENTO, L. S. do; LEDO, C. A. da S. Podemos plantar mudas de abacaxi, produzidas in vitro e aclimatadas em tubetes, sem o torrão com o sistema radicular? CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 25., 2017; REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE INTERAMERICANA DE HORTICULTURA TROPICAL, 62., 2017. Resumos... Porto Seguro, BA: SIHT, 2017.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
4. | | NASCIMENTO, L. S. do; MARTINS, J. L. F.; ARAUJO, A. R. de; FERREIRA, A. D.; MACEDO, M. C. M. Influência da inoculação de bactérias do gênero Azospirillum em sementes de Brachiaria brizantha cv marandu sobre a produtividade e caracterísitcas morfológicas. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
6. | | PEDRINHO, D. R.; FERREIRA, A. D.; LAURA, V. A.; BONO, J. A. M.; PEREIRA, S. R.; MARQUES, S. P. de M.; MATIAS, R.; NASCIMENTO, L. S. do. Biometria de genótipos de eucalipto cultivados em solo arenoso na Região Central de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2019. 24 p. Embrapa Gado de Corte. Documentos, 265).Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
7. | | FERREIRA, A. D.; LAURA, V. A.; ARAUJO, A. R. de; ALMEIDA, R. G. de; MACEDO, M. C. M.; BUNGENSTAB, D. J.; NASCIMENTO, L. S. do. Potential of environmental services of eucalyptus on integrated production systems. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GREENHOUSE GASES IN AGRICULTURE, 2., 2016, Campo Grande, MS. Proceedings... Brasília, DF: Embrapa, 2016. 502 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 216). Coordenador Roberto Giolo de Almeida. II SIGEE p. 200-204Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
8. | | NASCIMENTO, L. S. do; OLIVEIRA, J. R. de; SOUZA, N. F. M. R. de; SANTOS, R. S. dos; ANDRADE NETO, R. de C. Efeito de coberturas de solo e épocas sobre as características vegetativas do abacaxizeiro, cv. BRS RBO. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFAC, 26., 2017, Rio Branco. Anais... Rio Branco: Ufac, 2018. p. 556.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
| |
9. | | NASCIMENTO, L. S. do; ARAUJO, A. R. de; FERREIRA, A. D.; CORRÊA, B. O.; MACEDO, M. C. M.; BONO, J. A. M.; ZIMMER, A. H. Resistência do solo à penetração em diferentes sistemas de uso e manejo na região do Cerrado. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2020. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 285)Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
10. | | NASCIMENTO, L. S. do; NEVES, C. G.; AMARAL, D. O. J. do; PAULA, M. F. B. de; COSTA, C. L. dos S.; PASSOS, O. S.; GESTEIRA, A. da S.; MICHELI, F. Avaliação morfológica e agronômica de variedades de tangerinas. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 10., 2016: Cruz das Almas, BA. Traduzindo ciência para o mundo : resumos. Brasília, DF : Embrapa, 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
11. | | NASCIMENTO, L. S. do; NEVES, C. G.; SOARES, L. K. D.; AMARAL, D. O. J. do; PAULA, M. F. B. de; COSTA, C. L. dos S.; SOARES FILHO, W. dos S.; PASSOS, O. S.; GESTEIRA, A. da S.; MICHELI, F. Caracterização físico-química de citros para avaliação da qualidade do fruto. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro: [anais]. Cruz das Almas, BA, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
12. | | LINO, E. J.; STOLF-MOREIRA, R.; PEREIRA, R. M.; ROMERO, C. C. T.; SILLA, P. R.; NASCIMENTO, L. S. do; NASCIMENTO, L. C. do; CARAZZOLLE, M. F.; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Genome-wide expression profiling of a incompatible interaction between Glycine max and Phakopsora pachyrizi revealed by next-generation sequencing. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 246-247.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
13. | | ROMERO, C. C. T.; STOLF-MOREIRA, R.; BRITO JÚNIOR, S. L.; CATELLI, L. L.; PEREIRA, R. M.; LINO, E. J.; SILLA, P. R.; NASCIMENTO, L. S. do; NASCIMENTO, L. C. do; CARAZZOLLE, M. F.; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Genome-wide expression analysis of soybean plants under an incompatible interaction with the fungus Uromyces appendiculatus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 219-220.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
Registros recuperados : 13 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|