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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
12/02/2016 |
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Data da última atualização: |
16/02/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
NANI, T. F. |
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Afiliação: |
THAÍS FURTADO NANI. |
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Título: |
Citogenética de espécies de Brachiaria: contribuições para a construção de mapas físicos. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
2015. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, MG. Co-orientador: Fausto de Souza Sobrinho, Embrapa Gado de Leite. |
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Conteúdo: |
Brachiaria spp. (Poaceae) agrega espécies de interesse forrageiro. Análises citogenéticas mostram diferentes níveis de ploidia e variabilidade intraespecífica para a morfologia cromossômica e para o número de sítios de DNAr. Sequências de DNA repetitivo têm sido amplamente utilizadas em análises citogenéticas, contudo o uso de sequências de genes de cópia única/baixo número de cópias é pouco explorado, provavelmente pelo fato de o gênero não possuir espécie modelo de genoma sequenciado. O estudo das sequências que compõem o centrômetro em cromossomos de Brashia spp., assim como detalhamento do cariótipo com localização de sequências específicas em Brachiaria decumbens são inexistentes. Em outras espécies do gênero as informações por vezes são divergentes. Nesse sentido, este trabalho teve como objetivo contribuir para a construção de mapas físicos dos cromossomos de Brachiaria brizantha, B. decumbens e Brachiaria ruziziensis com a localização de sequências repetitivas de DNAr 5S e 45S, Retrotransposons Centroméricos (CR), além de bandas CMA/DAPI. Genes de cópia única/baixo número de cópias também foram localizadas nos pares cromossômicos utilizando-se dados de RNAseq e de sequenciamento de Setaria italica e Sorghum bicolor por meio da técnica de FISH. A avaliação da atividade transcricional das Regiões Organizadoras de Nucléolo (RONs) foi também avaliada. Com o detalhamento do cariograma das três espécies foi possível a identificação de pares cromossômicos, incluindo a observação de pares heteromórficos, além de diferenças intra e interespecíficas quanto ao número e tamanho dos sítios de DNA ribossomais. O cariótipo das espécies avaliadas foi considerado simétrico. A atividade transcricional das RONs é variável e foram detectados um ou dois nucléolos heteromórficos. Alguns dos genes de cópia única/baixo número de cópias estavam em sintenia com sítios de genes ribossomais, o que foi fundamental para a identificação dos pares cromossômicos portadores de alguns dos referidos genes. Em Brachiaria spp., foram observados alguns cromossomos com segmentos de estrutura conservada. Possíveis quebras cromossômicas fizeram parte do processo de diversificação das espécies do gênero. O uso de dados de sequenciamento genômico foi de fundamental importância para o enriquecimento de análises citogenéticas. MenosBrachiaria spp. (Poaceae) agrega espécies de interesse forrageiro. Análises citogenéticas mostram diferentes níveis de ploidia e variabilidade intraespecífica para a morfologia cromossômica e para o número de sítios de DNAr. Sequências de DNA repetitivo têm sido amplamente utilizadas em análises citogenéticas, contudo o uso de sequências de genes de cópia única/baixo número de cópias é pouco explorado, provavelmente pelo fato de o gênero não possuir espécie modelo de genoma sequenciado. O estudo das sequências que compõem o centrômetro em cromossomos de Brashia spp., assim como detalhamento do cariótipo com localização de sequências específicas em Brachiaria decumbens são inexistentes. Em outras espécies do gênero as informações por vezes são divergentes. Nesse sentido, este trabalho teve como objetivo contribuir para a construção de mapas físicos dos cromossomos de Brachiaria brizantha, B. decumbens e Brachiaria ruziziensis com a localização de sequências repetitivas de DNAr 5S e 45S, Retrotransposons Centroméricos (CR), além de bandas CMA/DAPI. Genes de cópia única/baixo número de cópias também foram localizadas nos pares cromossômicos utilizando-se dados de RNAseq e de sequenciamento de Setaria italica e Sorghum bicolor por meio da técnica de FISH. A avaliação da atividade transcricional das Regiões Organizadoras de Nucléolo (RONs) foi também avaliada. Com o detalhamento do cariograma das três espécies foi possível a identificação de pares cromossômicos, incluindo a obser... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Cariograma; Forrageira; Idiograma; Variação intraespecífica. |
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Thesaurus Nal: |
fish. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aBrachiaria spp. (Poaceae) agrega espécies de interesse forrageiro. Análises citogenéticas mostram diferentes níveis de ploidia e variabilidade intraespecífica para a morfologia cromossômica e para o número de sítios de DNAr. Sequências de DNA repetitivo têm sido amplamente utilizadas em análises citogenéticas, contudo o uso de sequências de genes de cópia única/baixo número de cópias é pouco explorado, provavelmente pelo fato de o gênero não possuir espécie modelo de genoma sequenciado. O estudo das sequências que compõem o centrômetro em cromossomos de Brashia spp., assim como detalhamento do cariótipo com localização de sequências específicas em Brachiaria decumbens são inexistentes. Em outras espécies do gênero as informações por vezes são divergentes. Nesse sentido, este trabalho teve como objetivo contribuir para a construção de mapas físicos dos cromossomos de Brachiaria brizantha, B. decumbens e Brachiaria ruziziensis com a localização de sequências repetitivas de DNAr 5S e 45S, Retrotransposons Centroméricos (CR), além de bandas CMA/DAPI. Genes de cópia única/baixo número de cópias também foram localizadas nos pares cromossômicos utilizando-se dados de RNAseq e de sequenciamento de Setaria italica e Sorghum bicolor por meio da técnica de FISH. A avaliação da atividade transcricional das Regiões Organizadoras de Nucléolo (RONs) foi também avaliada. Com o detalhamento do cariograma das três espécies foi possível a identificação de pares cromossômicos, incluindo a observação de pares heteromórficos, além de diferenças intra e interespecíficas quanto ao número e tamanho dos sítios de DNA ribossomais. O cariótipo das espécies avaliadas foi considerado simétrico. A atividade transcricional das RONs é variável e foram detectados um ou dois nucléolos heteromórficos. Alguns dos genes de cópia única/baixo número de cópias estavam em sintenia com sítios de genes ribossomais, o que foi fundamental para a identificação dos pares cromossômicos portadores de alguns dos referidos genes. Em Brachiaria spp., foram observados alguns cromossomos com segmentos de estrutura conservada. Possíveis quebras cromossômicas fizeram parte do processo de diversificação das espécies do gênero. O uso de dados de sequenciamento genômico foi de fundamental importância para o enriquecimento de análises citogenéticas.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 4 | |
| 4. |  | NANI, T. F.; SCHNABLE, J. C.; WASHBURN, J. D.; ALBERT, P.; PEREIRA, W. A.; SOUZA SOBRINHO, F. de; BIRCHLER, J. A.; TECHIO, V. H. Location of low copy genes in chromosomes of Brachiaria spp. Molecular Biology Reports, v. 45, n. 2, p. 109-118, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 4 | |
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