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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças; Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
16/12/2019 |
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Data da última atualização: |
16/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NAITO, F. Y. B.; MELO, F. L.; FONSECA, M. E. N.; SANTOS, C. A. F.; CHANES, C. R.; RIBEIRO, B. M.; GILBERTSON, R. L.; BOITEUX, L. S.; PEREIRA-CARVALHO, R. de C. |
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Afiliação: |
FERNANDA Y. B. NAITO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; FERNANDO L. MELO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; MARIA ESTHER DE N FONSECA BOITEUX, CNPH; CARLOS ANTONIO FERNANDES SANTOS, CPATSA; CAROLINA R. CHANES, UNIVERSIDADE CATÓLICA DE BRASÍLIA; BERGMANN M. RIBEIRO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ROBERT L. GILBERTSON, UNIVERSITY OF CALIFORNIA; LEONARDO SILVA BOITEUX, CNPH; RITA DE CÁSSIA PEREIRA-CARVALHO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
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Título: |
Nanopore sequencing of a novel bipartite New World begomovirus infecting cowpea. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 164, n. 7, p. 1907-1910, 2019. |
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DOI: |
10.1007/s00705-019-04254-5 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A new bipartite begomovirus (family Geminiviridae) was detected on cowpea (Vigna unguiculata) plants exhibiting bright golden mosaic symptoms on leaves under field conditions in Brazil. Complete consensus sequences of DNA-A and DNA-B components of an isolate of the virus (PE?088) were obtained by nanopore sequencing and confirmed by Sanger sequencing. The genome components presented the typical genomic organization of New World (NW) begomoviruses. Pairwise sequence comparisons revealed low levels of identity with other begomovirus species previously reported infecting cowpea around the world. Phylogenetic analysis using complete sequences of DNA-A components revealed that the closest relatives of PE?088 (85-87% nucleotide sequence identities) were three legume-infecting begomoviruses from Brazil: bean golden mosaic virus, macroptilium common mosaic virus and macroptilium yellow vein virus. According to the current classification criteria, PE?088 represents a new species in the genus Begomovirus, tentatively named as cowpea bright yellow mosaic virus (CoBYMV). |
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Palavras-Chave: |
Caupi; Feijao caupi; Nanopore. |
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Thesagro: |
Doença; Feijão; Mosca Branca. |
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Thesaurus Nal: |
Bean golden mosaic virus; Begomovirus; Geminiviridae; Vigna unguiculata subsp. unguiculata var. spontanea. |
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Categoria do assunto: |
--
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/210753/1/Nanopore-sequencing-of-a-novel-bipartite-New-World-begomovirus-infecting-cowpea.-2019.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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| Registros recuperados : 8 | |
| 2. |  | REIS, L. de N. A. dos; FONSECA, M. E. de N.; RIBEIRO, S. G.; NAITO, F. Y. B.; BOITEUX, L. S.; PEREIRA-CARVALHO, R. de C. Metagenomics of neotropical single-stranded DNA viruses in tomato cultivars with and without the Ty-1 gene. Viruses, v. 12, n. 8, 819, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 3. | | ROSSATO, M.; SOUZA, C. A.; MELO, F. L.; ORILIO, A. F.; RESENDE, R. O.; RIBEIRO, S. G.; NAITO, F. Y. B.; RIBEIRO, G. P.; ANDRADE, G. P.; PEREIRA-CARVALHO, R. C. An isolate of sweet potato chlorotic stunt virus from Brazil with a distinct genome organization. Archives of Virology, v. 164, p. 2175-2178, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 4. | | NAITO, F. Y. B.; MELO, F. L.; FONSECA, M. E. N.; SANTOS, C. A. F.; CHANES, C. R.; RIBEIRO, B. M.; GILBERTSON, R. L.; BOITEUX, L. S.; PEREIRA-CARVALHO, R. de C. Nanopore sequencing of a novel bipartite New World begomovirus infecting cowpea. Archives of Virology, v. 164, n. 7, p. 1907-1910, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças; Embrapa Semiárido. |
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| 5. | | PEREIRA, T. G.; NAITO, F. Y. B.; FONTENELE, R. S.; BLAWID, R.; FERNANDES, F. R.; LIMA, A. T. M.; SILVA, F. N.; ROCHA, C. S.; ROSALES, G. P.; OLIVEIRA, C. L.; RESENDE, R. O.; ZERBINI, F. M.; RIBEIRO, S. da G.; ARAGAO, F. J. L.; NAGATA, A. K. I. Begomovirus species diversity in South American weeds. In: INTERNATIONAL GEMINIVIRUS SYMPOSIUM, 6.; INTERNATIONAL ssDNA COMPARATIVE VIROLOGY WORKSHOP, 4., 2010, Guanajuato, Mexico. [Programme & abstracts]. Guanajuato: Cinvestav: Conacyt, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | FERNANDES, F. R.; ALBUQUERQUE, L. C. de; OLIVEIRA, C. L. de; CRUZ, A. R. R.; ROCHA, W. B. da; PEREIRA, T. G.; NAITO, F. Y. B.; DIAS, N. de M.; NAGATA, T.; FARIA, J. C.; ZERBINI, F. M.; ARAGÃO, F. J. L.; INOUE-NAGATA, A. K. Molecular and biological characterization of a new Brazilian begomovirus, Euphorbia yellow mosaic virus (EuYMV), infecting Euphorbia heterophylla plants. Tropical Plant Pathology, v. 36, p. 982, ago. 2011. Suplemento, ref. 1406. Edição dos Resumos do 44 Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Bento Gonçalves, ago. 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Hortaliças. |
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| 7. | | FERNANDES, F. R.; ALBUQUERQUE, L. C.; OLIVEIRA, C. L. de; CRUZ, A. R. R.; ROCHA, W. B. da; PEREIRA, T. G.; NAITO, F. Y. B.; DIAS, N. de M.; NAGATA, T.; FARIA, J. C.; ZERBINI, F. M.; ARAGAO, F. J. L.; NAGATA, A. K. I. Molecular and biological characterization of a new Brazilian begomovirus, euphorbia yellow mosaic virus (EuYMV), infecting Euphorbia heterophylla plants. Archives of Virology, New York, v. 156, n. 11, p. 2063-2069, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | FERNANDES, F. R.; ALBUQUERQUE, L. C.; OLIVEIRA, C. L. de; CRUZ, A. R. R.; ROCHA, W. B. da; PEREIRA, T. G.; NAITO, F. Y. B.; DIAS, N. de M.; NAGATA, T.; FARIA, J. C. de; ZERBINI, F. M.; ARAGAO, F. J. L.; NAGATA, A. K. I. Molecular and biological characterization of a new Brazilian begomovirus, Euphorbia yellow mosaic virus (EuYMV), infecting Euphorbia heterophylla plants. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 36, supl, p. 982, 2011. Resumo 1406 p. 982 Edição dos resumos do 44º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2011, Bento Gonçalves.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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