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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
26/05/2017 |
Data da última atualização: |
14/06/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOMAVILLA, A. L.; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, G. J. M.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P. |
Afiliação: |
Adriana Luiza Somavilla, Unesp; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Guilherme Jordão Magalhães Rosa, University of Wisconsin; Fabiana Barichello Mokry, UFSCar; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; Polyana Cristine Tizioto, UFSCar; Priscila Silva Neubern de Oliveira, UFSCar; Marcela Maria de Souza, UFSCar; Luiz Lehmann Coutinho, USP; Danísio Prado Munari, Unesp. |
Título: |
Genome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
G3: Genes, Genomes, Genetics, v. 7, p. 1-17, 2017. |
DOI: |
https://doi.org/10.1534/g3.117.041442 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Nelore is the most economically important cattle breed in Brazil, and the use of genetically improved animals has contributed to increase beef production efficiency. The Brazilian beef feedlot industry has grown considerably in the last decade, so the selection of animals with higher growth rates on feedlot has become quite important. Genomic selection could be used to reduce generation intervals and improve the rate of genetic gains. The aim of this study was to evaluate the prediction of genomic estimated breeding values for average daily gain in 718 feedlot-finished Nelore steers. Analyses of three Bayesian model specifications (Bayesian GBLUP, BayesA, and BayesCπ) were performed with four genotype panels (Illumina BovineHD BeadChip, TagSNPs, GeneSeek High and Low-density indicus). Estimates of Pearson correlations, regression coefficients, and mean squared errors were used to assess accuracy and bias of predictions. Overall, the BayesCπ model resulted in less biased predictions. Accuracies ranged from 0.18 to 0.27, which are reasonable values given the heritability estimates (from 0.40 to 0.44) and sample size (568 animals in the training population). Furthermore, results from Bos taurus indicus panels were as informative as those from Illumina BovineHD, indicating that they could be used to implement genomic selection at lower costs. |
Palavras-Chave: |
Bayesian model; Bos taurus indicus; Feedlot performance; Genomic selection; Growth; Modelos de regressão; Polimorfismo de nucleotídeo único; Regression models. |
Thesagro: |
Gado nelore. |
Thesaurus Nal: |
Feedlots; Marker-assisted selection; Models; Single nucleotide polymorphism. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160256/1/g3.117.041442.full.pdf
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Marc: |
LEADER 02571naa a2200397 a 4500 001 2070097 005 2019-06-14 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1534/g3.117.041442$2DOI 100 1 $aSOMAVILLA, A. L. 245 $aGenome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aNelore is the most economically important cattle breed in Brazil, and the use of genetically improved animals has contributed to increase beef production efficiency. The Brazilian beef feedlot industry has grown considerably in the last decade, so the selection of animals with higher growth rates on feedlot has become quite important. Genomic selection could be used to reduce generation intervals and improve the rate of genetic gains. The aim of this study was to evaluate the prediction of genomic estimated breeding values for average daily gain in 718 feedlot-finished Nelore steers. Analyses of three Bayesian model specifications (Bayesian GBLUP, BayesA, and BayesCπ) were performed with four genotype panels (Illumina BovineHD BeadChip, TagSNPs, GeneSeek High and Low-density indicus). Estimates of Pearson correlations, regression coefficients, and mean squared errors were used to assess accuracy and bias of predictions. Overall, the BayesCπ model resulted in less biased predictions. Accuracies ranged from 0.18 to 0.27, which are reasonable values given the heritability estimates (from 0.40 to 0.44) and sample size (568 animals in the training population). Furthermore, results from Bos taurus indicus panels were as informative as those from Illumina BovineHD, indicating that they could be used to implement genomic selection at lower costs. 650 $aFeedlots 650 $aMarker-assisted selection 650 $aModels 650 $aSingle nucleotide polymorphism 650 $aGado nelore 653 $aBayesian model 653 $aBos taurus indicus 653 $aFeedlot performance 653 $aGenomic selection 653 $aGrowth 653 $aModelos de regressão 653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único 653 $aRegression models 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 700 1 $aROSA, G. J. M. 700 1 $aMOKRY, F. B. 700 1 $aMUDADU, M. de A. 700 1 $aTIZIOTO, P. C. 700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de 700 1 $aSOUZA, M. M. de 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aMUNARI, D. P. 773 $tG3: Genes, Genomes, Genetics$gv. 7, p. 1-17, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Registros recuperados : 133 | |
81. | | URBITANI, I.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C. S.; MORKRY, F. B; REGITANO, L. C. A.; HIGA, R. H.; MUNARI, D. P. Selection signatures in Canchim beef cattle. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. Não paginado.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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82. | | NASCIMENTO, G. B.; SAVEGNAGO, R. P.; URBINATI, I.; BERNARDES, P. A.; FERRAUDO, A. S.; SCHMIDT, G. S.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. The use of artificial neural networks to explore the relationship between breeding values of egg production with other phenotypic measurements in hens of a white leghorn population. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: SBG, 2012. p. 38.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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83. | | PERIPOLLI, E.; OLIVIERI. B. F.; FEITOSA, F. L. B.; LEMOS, M. V. A. de; TONUSSI, R. L.; MUNARI, D. P.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. Avaliação dos coeficientes de endogamia em bovinos da raça Gir (Bos primigenius indicus) In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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84. | | SBARDELLA, A. P; FONSECA, I.; WELLER, M. A. DEL C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R.; WATANABE, R. N.; COSTA, R, M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P. Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-seq In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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85. | | SBARDELLA, A. P.; FONSECA, I.; WELLER, M. M. D. C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R.; WATANABE, R. N.; COSTA, R. M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P. Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-Seq. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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86. | | PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; LIMA, A. L. F.; IRGANG, R.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. Assessment of runs of homozygosity islands and estimates of genomic inbreeding in Gyr (Bos indicus) dairy cattle. BMC Genomics, v. 19, n. 34, 2018. 13 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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87. | | CRUZ, V. A. R. da; IBELLI, A. M. G.; SAVEGNAGO, R. P.; NASCIMENTO, G. B.; SARGOLZAEI, M.; SCHENKEL. F. S.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P. Association of the adiponectin receptor 1 gene with bone integrity traits in a paternal broiler line. In: REUNIÃO ANNUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51, 2014, Barra dos Coqueiros. Anais ... Barra dos Coqueiros: SBZ, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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88. | | CRUZ, V. A. R. da; SCHENKEL, F. S.; SAVEGNAGO, R. P.; GRUPIONI, N. V.; STAFUZZA, N. B.; SARGOZAEL, M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Association of apolipoprotein B and adiponectin receptor 1 genes with carcass, bone integrity and performance traits in a paternal broiler Line. Plos One, v. 10, n.8, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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89. | | CRUZ, V. A. R. da; IBELLI, A. M. G.; BUZANSKAS, M. E.; ROSA, J. O.; CHUD, T. C. S.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P. Association of Apolipoprotein B gene with carcass, performance, and organ traits in a paternal broiler line. In: REUNIÃO ANNUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51, 2014, Barra dos Coqueiros. Anais ... Barra dos Coqueiros: SBZ, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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90. | | GROSSI, D. do; GRUPIONI, N. V.; BUZANSKAS, M. E.; PAZ, C. C. P. de; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; SCHENKEL, F. S.; MUNARI, D. P. Allele substitution effects of IGF1, GH and PIT1 markers on estimated breeding values for weight and reproduction traits in Canchim beef cattle. Livestock Science, v. 180, p. 78-83, oct. 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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91. | | VENTURINI, G. C.; GROSSI, D. do A.; RAMOS, S. B.; CRUZ, A. A. R. da; SOUZA, C. G.; LEDUR, M. C.; EL FARO, L.; SCHMIDT, G. S.; MUNARI, D. P. Estimation of genetic parameters for partial egg production periods by means of random regression models. Genetics and Molecular Research, v. 11, n. 3, p. 1819-1829, 2012. Projeto: 01.06.01.006.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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92. | | MARCHESI, J. A. P.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; BUZANSKAS, M. E.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Estudo de associação global do genoma revela novos genes e regiões genômicas associadas à conversão alimentar em frangos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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93. | | MARCHESI, J. A. P.; ONO, R. K.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P.; LEDUR, M. C. Exploring the genetic architecture of feed efficiency traits in chickens. Scientific Reports, v. 11, n. 4622, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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94. | | SOMAVILLA, A. L.; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, G. J. M.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P. Genome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle. G3: Genes, Genomes, Genetics, v. 7, p. 1-17, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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95. | | BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; VENTURA, R. V.; CHUD, T. C. S.; URBINATI, I.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; SCHENKEL, F. S.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Genome-wide association study on long-yearling scrotal circumference in Canchim cattle. In:WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings...Vancouver: WCGALP: Amarican Society of Animal Science, 2014.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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96. | | STAFUZZA, N. B.; SILVA, R. M. de O.; PERIPOLLI, E.; BEZERRA, L. A. F.; LOBO, R. B.; MAGNABOSCO, C. de U.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; MUNARI, D. P.; LOURENCO, D. A. L.; BALDI, F. Genome-wide association study provides insights into genes related with horn development in Nelore beef cattle. PLoS ONE, v. 13, n. 8, e0202978, August 30, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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97. | | CHUD, T. C. S.; ROSA, J. O.; SILVA, M. V. G. B.; SILVA, T. B. R.; OLIVEIRA, G. A.; VENTURINI, G. C.; BALDI REY, F. S.; MUNARI, D. P. Genome-wide identification of copy number variation regions in Girolando cattle In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 61., 2015, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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98. | | BRAGA, L. G.; CHUD, T. C. S.; WATANABE, R. N.; SAVEGNAGO, R. P.; SENA, T. M.; CARMO, A. S. do; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; MUNARI, D. P. Identification of copy number variations in the genome of Dairy Gir cattle. PLoS ONE, v. 18, n. 4, e0284085, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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