| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
|
Data corrente: |
16/04/2024 |
|
Data da última atualização: |
19/04/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
SALOJÄRVI.; RAMBANI, A.; YU, Z.; GUYOT, R.; STRICKLER, S.; LEPELLEY, M.; WANG, C.; RAJARAMAN, S.; RASTAS, P.; ZHENG, C.; MUÑOZ, D. S.; MEIDANIS, J.; PASCHOAL, A. R.; BAWIN, Y.; KRABBENHOFT, T. J.; WANG, Z. Q.; FLECK, S. J.; AUSSEL, R.; BELLANGER, L.; CHARPAGNE, A.; FOURNIER, C.; KASSAM, M.; LEFEBVRE, G.; MÉTAIRON, S.; MOINE, D.; RIGOREAU, M.; STOLTE, J.; HAMON, P.; COUTURON, E.; TRANCHANT-DUBREUIL, C.; MUKHERJEE, M.; LAN, T.; ENGELHARDT, J.; STADLER, P.; LEMOS, S. M. C. de; SUZUKI, S. I.; SUMIRAT, U.; WAI, C. M.; DAUCHOT, N.; OROZCO-ARIAS, S.; GARAVITO, A.; KIWUKA, C.; MUSOLI, P.; NALUKENGE, A.; GUICHOUX, E.; REINOUT, H.; SMIT, M.; CARRETERO-PAULET, L.; GUERREIRO FILHO, O.; BRAGHINI, M. T.; PADILHA, L.; SERA, G. H.; RUTTINK, T.; HENRY, R.; MARRACCINI, P.; PEER, Y. V. de; ANDRADE, A. C.; DOMINGUES, D.; GIULIANO, G.; MUELLER, L.; PEREIRA, L. F. P.; PLAISANCE, S.; PONCET, V.; ROMBAUTS, S.; SANKOFF, D.; ALBERT, V. A.; CROUZILLAT, D.; KOCHKO, A. de; DESCOMBES, P. |
|
Afiliação: |
JARKKO SALOJÄRVI, NANYANG TECHNOLOGICAL UNIVERSITY; ADITI RAMBANI, CORNELL UNIVERSITY; ZHE YU, UNIVERSITY OF OTTAWA; ROMAIN GUYOT, UNIVERSITÉ DE MONTPELLIER; SUSAN STRICKLER, CORNELL UNIVERSITY; MAUD LEPELLEY, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; CUI WANG, UNIVERSITY OF HELSINKI; SITARAM RAJARAMAN, UNIVERSITY OF HELSINKI; PASI RASTAS, UNIVERSITY OF HELSINKI; CHUNFANG ZHENG, UNIVERSITY OF OTTAWA; DANIELLA SANTOS MUÑOZ, UNIVERSITY OF OTTAWADAVID; JOÃO MEIDANIS, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; ALEXANDRE ROSSI PASCHOAL, UNIVERSIDADE TECNOLÓGICA FEDERAL DO PARANÁ; YVES BAWIN, FLANDERS RESEARCH INSTITUTE FOR AGRICULTURE; TREVOR J. KRABBENHOFT, UNIVERSITY AT BUFFALO; ZHEN QIN WANG, UNIVERSITY AT BUFFALO; STEVEN J. FLECK, UNIVERSITY AT BUFFALO; RUDY AUSSEL, AIX MARSEILLE UNIVERSITÉ; LAURENCE BELLANGER, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; ALINE CHARPAGNE, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; CORALIE FOURNIER, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; MOHAMED KASSAM, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; GREGORY LEFEBVRE, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; SYLVIANE MÉTAIRON, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; DÉBORAH MOINE, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; MICHEL RIGOREAU, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; JENS STOLTE, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; PERLA HAMON, UNIVERSITÉ DE MONTPELLIER; EMMANUEL COUTURON, UNIVERSITÉ DE MONTPELLIER; CHRISTINE TRANCHANT-DUBREUIL, UNIVERSITÉ DE MONTPELLIER; MINAKSHI MUKHERJEE, UNIVERSITY AT BUFFALO; TIANYING LAN, UNIVERSITY AT BUFFALO; JAN ENGELHARDT, UNIVERSITY OF LEIPZIG; PETER STADLER, UNIVERSITY OF LEIPZIG; SAMARA MIREZA CORREIA DE LEMOS, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SÃO PAULO; SUZANA IVAMOTO SUZUKI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; UCU SUMIRAT, INDONESIAN COFFEE AND COCOA RESEARCH INSTITUTE; CHING MAN WAI, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN; NICOLAS DAUCHOT, UNIVERSITY OF NAMUR; SIMON OROZCO-ARIAS, UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE MANIZALES; ANDREA GARAVITO, UNIVERSIDAD DE CALDAS; CATHERINE KIWUKA, NATIONAL AGRICULTURAL RESEARCH ORGANIZATION; PASCAL MUSOLI, NATIONAL AGRICULTURAL RESEARCH ORGANIZATION; ANNE NALUKENGE, NATIONAL AGRICULTURAL RESEARCH ORGANIZATION; ERWAN GUICHOUX, INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE; HAVINGA REINOUT, HORTUS BOTANICUS AMSTERDAM; MARTIN SMIT, HORTUS BOTANICUS AMSTERDAM; LORENZO CARRETERO-PAULET, UNIVERSIDAD DE ALMERÍA; OLIVEIRO GUERREIRO FILHO, INSTITUTO AGRONÔMICO; MASAKO TOMA BRAGHINI, INSTITUTO AGRONÔMICO; LILIAN PADILHA, CNPCA; GUSTAVO HIROSHI SERA, INSTITUTO DE DESENVOLVIMENTO RURAL DO PARANÁ; TOM RUTTINK, FLANDERS RESEARCH INSTITUTE FOR AGRICULTURE; ROBERT HENRY, UNIVERSITY OF QUEENSLAND; PIERRE MARRACCINI, UNIVERSITÉ DE MONTPELLIER; YVES VAN DE PEER, UNIVERSITY OF PRETORIA; ALAN CARVALHO ANDRADE, CNPCA; DOUGLAS DOMINGUES, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SÃO PAULO; GIOVANNI GIULIANO, ITALIAN NATIONAL AGENCY FOR NEW TECHNOLOGIES; LUKAS MUELLER, CORNELL UNIVERSITY; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCA; STEPHANE PLAISANCE, VIB NUCLEOMICS CORE; VALERIE PONCET, UNIVERSITÉ DE MONTPELLIER; STEPHANE ROMBAUTS, CENTER FOR PLANT SYSTEMS BIOLOGY; DAVID SANKOFF, UNIVERSITY OF OTTAWA; VICTOR A. ALBERT, UNIVERSITY AT BUFFALO; DOMINIQUE CROUZILLAT, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA; ALEXANDRE DE KOCHKO, UNIVERSITÉ DE MONTPELLIER; PATRICK DESCOMBES, SOCIÉTÉ DES PRODUITS NESTLÉ SA. |
|
Título: |
The genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars. |
|
Ano de publicação: |
2024 |
|
Fonte/Imprenta: |
Nature Genetics, v. 56, n. 4, p. 721-731, 2024. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Coffea arabica, an allotetraploid hybrid of Coffea eugenioides and Coffea canephora, is the source of approximately 60% of coffee products worldwide, and its cultivated accessions have undergone several population bottlenecks. We present chromosome-level assemblies of a di-haploid C. arabica accession and modern representatives of its diploid progenitors, C. eugenioides and C. canephora. The three species exhibit largely conserved genome structures between diploid parents and descendant subgenomes, with no obvious global subgenome dominance. We find evidence for a founding polyploidy event 350,000–610,000 years ago, followed by several pre-domestication bottlenecks, resulting in narrow genetic variation. A split between wild accessions and cultivar progenitors occurred ~30.5 thousand years ago, followed by a period of migration between the two populations. Analysis of modern varieties, including lines historically introgressed with C. canephora, highlights their breeding histories and loci that may contribute to pathogen resistance, laying the groundwork for future genomics-based breeding of C. arabica. |
|
Thesaurus Nal: |
Coffea arabica var. arabica; Genomics. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1163646/1/genome-and-population-genomics.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03600naa a2200961 a 4500
001 2163646
005 2024-04-19
008 2024 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSALOJÄRVI.
245 $aThe genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars.$h[electronic resource]
260 $c2024
520 $aCoffea arabica, an allotetraploid hybrid of Coffea eugenioides and Coffea canephora, is the source of approximately 60% of coffee products worldwide, and its cultivated accessions have undergone several population bottlenecks. We present chromosome-level assemblies of a di-haploid C. arabica accession and modern representatives of its diploid progenitors, C. eugenioides and C. canephora. The three species exhibit largely conserved genome structures between diploid parents and descendant subgenomes, with no obvious global subgenome dominance. We find evidence for a founding polyploidy event 350,000–610,000 years ago, followed by several pre-domestication bottlenecks, resulting in narrow genetic variation. A split between wild accessions and cultivar progenitors occurred ~30.5 thousand years ago, followed by a period of migration between the two populations. Analysis of modern varieties, including lines historically introgressed with C. canephora, highlights their breeding histories and loci that may contribute to pathogen resistance, laying the groundwork for future genomics-based breeding of C. arabica.
650 $aCoffea arabica var. arabica
650 $aGenomics
700 1 $aRAMBANI, A.
700 1 $aYU, Z.
700 1 $aGUYOT, R.
700 1 $aSTRICKLER, S.
700 1 $aLEPELLEY, M.
700 1 $aWANG, C.
700 1 $aRAJARAMAN, S.
700 1 $aRASTAS, P.
700 1 $aZHENG, C.
700 1 $aMUÑOZ, D. S.
700 1 $aMEIDANIS, J.
700 1 $aPASCHOAL, A. R.
700 1 $aBAWIN, Y.
700 1 $aKRABBENHOFT, T. J.
700 1 $aWANG, Z. Q.
700 1 $aFLECK, S. J.
700 1 $aAUSSEL, R.
700 1 $aBELLANGER, L.
700 1 $aCHARPAGNE, A.
700 1 $aFOURNIER, C.
700 1 $aKASSAM, M.
700 1 $aLEFEBVRE, G.
700 1 $aMÉTAIRON, S.
700 1 $aMOINE, D.
700 1 $aRIGOREAU, M.
700 1 $aSTOLTE, J.
700 1 $aHAMON, P.
700 1 $aCOUTURON, E.
700 1 $aTRANCHANT-DUBREUIL, C.
700 1 $aMUKHERJEE, M.
700 1 $aLAN, T.
700 1 $aENGELHARDT, J.
700 1 $aSTADLER, P.
700 1 $aLEMOS, S. M. C. de
700 1 $aSUZUKI, S. I.
700 1 $aSUMIRAT, U.
700 1 $aWAI, C. M.
700 1 $aDAUCHOT, N.
700 1 $aOROZCO-ARIAS, S.
700 1 $aGARAVITO, A.
700 1 $aKIWUKA, C.
700 1 $aMUSOLI, P.
700 1 $aNALUKENGE, A.
700 1 $aGUICHOUX, E.
700 1 $aREINOUT, H.
700 1 $aSMIT, M.
700 1 $aCARRETERO-PAULET, L.
700 1 $aGUERREIRO FILHO, O.
700 1 $aBRAGHINI, M. T.
700 1 $aPADILHA, L.
700 1 $aSERA, G. H.
700 1 $aRUTTINK, T.
700 1 $aHENRY, R.
700 1 $aMARRACCINI, P.
700 1 $aPEER, Y. V. de
700 1 $aANDRADE, A. C.
700 1 $aDOMINGUES, D.
700 1 $aGIULIANO, G.
700 1 $aMUELLER, L.
700 1 $aPEREIRA, L. F. P.
700 1 $aPLAISANCE, S.
700 1 $aPONCET, V.
700 1 $aROMBAUTS, S.
700 1 $aSANKOFF, D.
700 1 $aALBERT, V. A.
700 1 $aCROUZILLAT, D.
700 1 $aKOCHKO, A. de
700 1 $aDESCOMBES, P.
773 $tNature Genetics$gv. 56, n. 4, p. 721-731, 2024.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Territorial. |
|
Data corrente: |
20/12/2018 |
|
Data da última atualização: |
07/01/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
SPERANZA, E. A.; GREGO, C. R.; RODRIGUES, C. A. G.; SANCHES, G. M.; LUCHIARI JUNIOR, A. |
|
Afiliação: |
EDUARDO ANTONIO SPERANZA, CNPTIA; CELIA REGINA GREGO, CNPTIA; CRISTINA APARECIDA G RODRIGUES, CNPM; GUILHERME MARTINELI SANCHES, Unicamp; ARIOVALDO LUCHIARI JUNIOR, CNPTIA. |
|
Título: |
Caracterização da variabilidade espacial do solo a partir de medidas de condutividade elétrica. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRICULTURA DE PRECISÃO, 2018, Curitiba. Construção dos dados na era da digitalização agrícola: anais. [S.l.]: AsBraAP, [2018]. |
|
Páginas: |
p. 329-334. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
ConBAP 2018. |
|
Conteúdo: |
RESUMO: A caracterização da variabilidade espacial de uma área de cultivo agrícola pode ser identificada a partir de diversos fatores não antrópicos e temporalmente estáveis relacionados ao solo e à cultura. Alguns desses fatores, principalmente aqueles relacionados ao solo, podem ser de difícil obtenção, uma vez que a coleta e análise de amostras de solo georreferenciadas é uma tarefa normalmente dispendiosa com relação ao custo e ao tempo do processo. Por outro lado, diversos desses fatores podem ser altamente correlacionados com a condutividade elétrica aparente do solo (CEa), que pode ser medida por meio de sensores de indução eletromagnética (IEM) em altas resoluções espaciais. Este trabalho descreve um experimento realizado em talhão de cultivo de cana-de-açúcar, onde foram obtidos dados de CEa do solo a partir do sensor EM38- MK2®. A partir desses dados, foram identificadas duas unidades de gestão diferenciada (UGDs) onde a variabilidade do solo é bastante distinta. Essas UGDs podem ser tratadas de maneira diferenciada em atividades dentro do ciclo da agricultura de precisão, permitindo a realização da coleta e análise de solo utilizando quantidades limitadas de amostras, de acordo com a variabilidade espacial identificada. |
|
Palavras-Chave: |
Densidade Amostral; Electromagnetic Induction; Indução Eletromagnética; Management Zones; Sample Density; Unidades de Gestão Diferenciada; Variabilidade espacial. |
|
Thesagro: |
Cana de Açúcar. |
|
Thesaurus NAL: |
Sugarcane. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
Marc: |
LEADER 02294nam a2200289 a 4500
001 2102304
005 2020-01-07
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSPERANZA, E. A.
245 $aCaracterização da variabilidade espacial do solo a partir de medidas de condutividade elétrica.$h[electronic resource]
260 $aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRICULTURA DE PRECISÃO, 2018, Curitiba. Construção dos dados na era da digitalização agrícola: anais. [S.l.]: AsBraAP, [2018].$c2018
300 $ap. 329-334.
500 $aConBAP 2018.
520 $aRESUMO: A caracterização da variabilidade espacial de uma área de cultivo agrícola pode ser identificada a partir de diversos fatores não antrópicos e temporalmente estáveis relacionados ao solo e à cultura. Alguns desses fatores, principalmente aqueles relacionados ao solo, podem ser de difícil obtenção, uma vez que a coleta e análise de amostras de solo georreferenciadas é uma tarefa normalmente dispendiosa com relação ao custo e ao tempo do processo. Por outro lado, diversos desses fatores podem ser altamente correlacionados com a condutividade elétrica aparente do solo (CEa), que pode ser medida por meio de sensores de indução eletromagnética (IEM) em altas resoluções espaciais. Este trabalho descreve um experimento realizado em talhão de cultivo de cana-de-açúcar, onde foram obtidos dados de CEa do solo a partir do sensor EM38- MK2®. A partir desses dados, foram identificadas duas unidades de gestão diferenciada (UGDs) onde a variabilidade do solo é bastante distinta. Essas UGDs podem ser tratadas de maneira diferenciada em atividades dentro do ciclo da agricultura de precisão, permitindo a realização da coleta e análise de solo utilizando quantidades limitadas de amostras, de acordo com a variabilidade espacial identificada.
650 $aSugarcane
650 $aCana de Açúcar
653 $aDensidade Amostral
653 $aElectromagnetic Induction
653 $aIndução Eletromagnética
653 $aManagement Zones
653 $aSample Density
653 $aUnidades de Gestão Diferenciada
653 $aVariabilidade espacial
700 1 $aGREGO, C. R.
700 1 $aRODRIGUES, C. A. G.
700 1 $aSANCHES, G. M.
700 1 $aLUCHIARI JUNIOR, A.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
