| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
08/09/2020 |
|
Data da última atualização: |
10/09/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
AFONSO, J.; FORTES, M. R. S.; REVERTER, A.; DINIZ, W. J. da S.; CESAR, A. S. M.; LIMA, A. O. de; PETRINI, J.; SOUZA, M. de S.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. A.; REGITANO, L. C. de A. |
|
Afiliação: |
JULIANA AFONSO, UFSCar; MARINA RUFINO SALINAS FORTES, The University of Queensland; ANTONIO REVERTER, Agriculture and Food, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, Brisbane; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, UFSCar; ALINE SILVA MELLO CESAR, Esalq/USP; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, UFSCar; JULIANA PETRINI, UNIFAL; MARCELA M. DE SOUZA, Iowa State University; LUIZ LEHMANN COUTINHO, Esalq/USP; GERSON BARRETO MOURÃO, Esalq/USP; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; CAIO FERNANDO GROMBONI, Bahia Federal Institute of Education, Science and Technology, Ilhéus; ANA RITA ARAÚJO NOGUEIRA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
|
Título: |
Genetic regulators of mineral amount in Nelore cattle muscle predicted by a new co-expression and regulatory impact factor approach. |
|
Ano de publicação: |
2020 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-16, 2020 |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-020-65454-7 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Article: 8436. |
|
Conteúdo: |
Mineral contents in bovine muscle can affect meat quality, growth, health, and reproductive traits. To better understand the genetic basis of this phenotype in Nelore (Bos indicus) cattle, we analysed genome-wide mRNA and miRNA expression data from 114 muscle samples. The analysis implemented a new application for two complementary algorithms: the partial correlation and information theory (PCIT) and the regulatory impact factor (RIF), in which we included the estimated genomic breeding values (GEBVs) for the phenotypes additionally to the expression levels, originally proposed for these methods. We used PCIT to determine putative regulatory relationships based on significant associations between gene expression and GEBVs for each mineral amount. Then, RIF was adopted to determine the regulatory impact of genes and miRNAs expression over the GEBVs for the mineral amounts. We also investigated over-represented pathways, as well as pieces of evidences from previous studies carried in the same population and in the literature, to determine regulatory genes for the mineral amounts. For example, NOX1 expression level was positively correlated to Zinc and has been described as Zinc-regulated in humans. Based on our approach, we were able to identify genes, miRNAs and pathways not yet described as underlying mineral amount. The results support the hypothesis that extracellular matrix interactions are the core regulator of mineral amount in muscle cells. Putative regulators described here add information to this hypothesis, expanding the knowledge on molecular relationships between gene expression and minerals. MenosMineral contents in bovine muscle can affect meat quality, growth, health, and reproductive traits. To better understand the genetic basis of this phenotype in Nelore (Bos indicus) cattle, we analysed genome-wide mRNA and miRNA expression data from 114 muscle samples. The analysis implemented a new application for two complementary algorithms: the partial correlation and information theory (PCIT) and the regulatory impact factor (RIF), in which we included the estimated genomic breeding values (GEBVs) for the phenotypes additionally to the expression levels, originally proposed for these methods. We used PCIT to determine putative regulatory relationships based on significant associations between gene expression and GEBVs for each mineral amount. Then, RIF was adopted to determine the regulatory impact of genes and miRNAs expression over the GEBVs for the mineral amounts. We also investigated over-represented pathways, as well as pieces of evidences from previous studies carried in the same population and in the literature, to determine regulatory genes for the mineral amounts. For example, NOX1 expression level was positively correlated to Zinc and has been described as Zinc-regulated in humans. Based on our approach, we were able to identify genes, miRNAs and pathways not yet described as underlying mineral amount. The results support the hypothesis that extracellular matrix interactions are the core regulator of mineral amount in muscle cells. Putative regulators describe... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Expressão gênica. |
|
Thesagro: |
Bos Indicus; Gado Nelore. |
|
Thesaurus Nal: |
Cattle; Gene expression. |
|
Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/215819/1/AP-Genetic-regulators-2020.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02716naa a2200361 a 4500
001 2124802
005 2020-09-10
008 2020 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41598-020-65454-7$2DOI
100 1 $aAFONSO, J.
245 $aGenetic regulators of mineral amount in Nelore cattle muscle predicted by a new co-expression and regulatory impact factor approach.$h[electronic resource]
260 $c2020
500 $aArticle: 8436.
520 $aMineral contents in bovine muscle can affect meat quality, growth, health, and reproductive traits. To better understand the genetic basis of this phenotype in Nelore (Bos indicus) cattle, we analysed genome-wide mRNA and miRNA expression data from 114 muscle samples. The analysis implemented a new application for two complementary algorithms: the partial correlation and information theory (PCIT) and the regulatory impact factor (RIF), in which we included the estimated genomic breeding values (GEBVs) for the phenotypes additionally to the expression levels, originally proposed for these methods. We used PCIT to determine putative regulatory relationships based on significant associations between gene expression and GEBVs for each mineral amount. Then, RIF was adopted to determine the regulatory impact of genes and miRNAs expression over the GEBVs for the mineral amounts. We also investigated over-represented pathways, as well as pieces of evidences from previous studies carried in the same population and in the literature, to determine regulatory genes for the mineral amounts. For example, NOX1 expression level was positively correlated to Zinc and has been described as Zinc-regulated in humans. Based on our approach, we were able to identify genes, miRNAs and pathways not yet described as underlying mineral amount. The results support the hypothesis that extracellular matrix interactions are the core regulator of mineral amount in muscle cells. Putative regulators described here add information to this hypothesis, expanding the knowledge on molecular relationships between gene expression and minerals.
650 $aCattle
650 $aGene expression
650 $aBos Indicus
650 $aGado Nelore
653 $aExpressão gênica
700 1 $aFORTES, M. R. S.
700 1 $aREVERTER, A.
700 1 $aDINIZ, W. J. da S.
700 1 $aCESAR, A. S. M.
700 1 $aLIMA, A. O. de
700 1 $aPETRINI, J.
700 1 $aSOUZA, M. de S.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
700 1 $aMOURÃO, G. B.
700 1 $aZERLOTINI NETO, A.
700 1 $aGROMBONI, C. F.
700 1 $aNOGUEIRA, A. R. A.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
773 $tScientific Reports$gv. 10, n. 1, p. 1-16, 2020
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 245 | |
| 81. |  | CASTRO FILHO, E. S.; RANGEL, J. H. de A.; MUNIZ, E. N.; ARAUJO, H. R. de; BARIN, L. B.; COSTA, J. P. N. Composição percentual dos componentes estruturais de uma pastagem de brachiaria brizantha cv. marandu em função de níveis de N ou do seu consórcio com a gliricidia sepium. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTERIOS, 1., 2011, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2011. 1 CD-ROM. Resumo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
|    |
| 82. | | CASTRO FILHO, E. S.; RANGEL, J. H. de A.; MUNIZ, E. N.; ARAUJO, H. R. de; BARIN. L. B.; SANTANA NETO, A. A. Composição percentual dos componentes estruturais de uma pastagem de Brachiaria brizantha (A. Rich.) Stapf. cv Marandu em função de níveis de nitrogênio ou do seu consócio com a Gliricídia sepium (Jacq.), Kunth Walp. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Salvador: SBZ, 2010. 1 CD-ROM. r. 5676.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
|  |
| 83. | | MUNIZ, A. V. C. da S.; YAGUIU, P.; MUNIZ, E. N.; CARNELOSSI, M. A. G.; RANGEL, J. H. de A.; NARAIN, N. Characterization of jenipapo (Genipa americana) at different maturation stages. In: FRUIT, NUT AND VEGETABLE PRODUCTION ENGINEERING SYMPOSIUM, 8., 2009, Concepción. Proceedings... Concepción: Progap, 2009. Artigo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 84. | | SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; SA, J. L. de; SA, C. O. de; ARAUJO, H. R. de. Características dos cortes da carcaça de ovinos terminados em confinamento recebendo níveis crescentes de silagem de gliricídia. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Salvador: SBZ, 2010. 1 CD-ROM. r. 6177.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 85. | | GOMIDE, C. A. M.; RANGEL, J. H. A.; PACIULLO, D. S. C.; SANTOS, C. A. P. dos; SILVA, T. B.; SANTOS, N. L. Características do pasto de capim-marandu abubado com nitrogênio ou consorciado com gliricídia em manejo rotacionado. In: REUNION ASOCIACION LATINOAMERICANA DE PRODUCCION ANIMAL, 20.; REUNION ASOCIACION PERUANA DE PRODUCCION ANIMAL, 30.; CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cusco. Anais... Cusco: Associacion Peruana de Produccion Animal, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 86. | | GOMIDE, C. A. de M.; RANGEL, J. H. de A.; PACIULLO, D. S. C.; SANTOS, C. A. P.; SILVA, T. B.; SANTOS, N. L. Características do pasto de capim-Marandu adubado com nitrogênio ou consorciado com Gliricídia em manejo rotacionado. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20., REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30., CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Anais... Cuzco: ALPA/APPA, 2007. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 87. | | GOMIDE, C. A. de M.; RANGEL, J. H. A.; PACIULLO, D. S. C.; SANTOS, C. A. P.; SILVA, T. B.; SANTOS, N. L. Características do pasto de capim-Marandu adubado com nitrogênio ou consorciado com Gliricídia em manejo rotacionado. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20.; REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30.; CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Resumenes... Cuzco: ALPA/APPA, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 88. | | GOMIDE, C. A. de M.; RANGEL, J. H. A.; PACIULLO, D. S. C.; SANTOS, C. A. dos; SILVA, T. B. da; SANTOS, N. L. Características do pasto de capum-marandu adubado com nitrogênio ou consorciado com gliricídia em manejo rotacionado. In: REUNION ASOCIACION LATINOAMERICANA DE PRODUCCION ANIMAL, 20.; REUNION ASOCIACION PERUANA DE PRODUCCION ANIMAL, 30.; CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cusco. Anais... Cusco: 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 89. | | CRUZ, J. P. M. da; SILVA, D. B. M. da; SANTOS, D. de O.; PIOVEZAN, U.; RANGEL, J. H. de A. Caracterização agronômica de acessos de Desmanthus leptophylus nas condições ambientais dos tabuleiros costeiros de Sergipe. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 12., 2023, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2023. Editores Técnicos: Viviane Talamini, Ana da Silva Ledo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 91. | | SANTANA, T. P.; SOBRAL, A. J. S.; SOUZA, E. Y. B.; MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; CASTRO FILHO, E. S.; SANTOS, D. de O. Caracterização bromatológica de casca de mandioca e da manipueira para utilização na alimentação animal. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFI CA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 4., 2014, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 92. | | SILVA, D. B. M.; MUNIZ, E. N.; SILVA, A. V. C. da; RANGEL, J. H. de A.; SANTOS, D. de O. Caracterização bromatológica da folhagem e das sementes de Moringa oleifera. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 10., 2021, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2021. p. 43-43.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 93. | | MUNIZ, E. N.; CORREIA NETO, J.; AZEVEDO, H. C.; RANGEL, J. H. de A.; FACIONI, S. E.; SILVA, F. F.; LEONARDO S. GLÓRIA. Influence of birth type on growth curve of Santa Inês sheep. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51., 2014, Barra dos Coqueiros. A produção animal frente às mudanças climáticas e tecnológicas - anais. Barra dos coqueiros: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 94. | | CANCIO, C. R. B.; CASTRO, R. S. de; COELHO, L. de A.; RANGEL, J. H. de A.; OLIVEIRA, J. C. de. Idade ao Primeiro Parto, Intervalo entre Partos e Producao Leiteira de Cabras Saanen, Marota e Mesticas em Alagoas. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.27, n.1, p.53-59,jan.1992| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 95. | | ARAUJO, H. R. de; RANGEL, J. H. de A.; MUNIZ, E. N.; CASTRO FILHO, E. S.; BARIN, L. B.; SANTANA NETO, J. A. Interceptação luminosa e índice de área foliar em pastagem de Digitaria umfolozi em diferentes frequencias de desfolhamento. In: CONGRESSO NORDESTINO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 6., 2010, Mossoró. Anais... Mossoró: SNPA, 2010. Artigo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 96. | | SILVA, L. F.; MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; SA, C. O. de; SA, J. L. de; SILVA, H. O. Ganho de peso de cordeiros Santa Inês alimentados com dietas contendo diferentes níveis de silagem de gliricídia. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 13., 2012, Maceió. Anais... Maceió: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 97. | | SOUZA, E. Y. B.; SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; SANTOS, G. R. de A.; RANGEL, J. H. de A.; CASTRO FILHO, E. S. Ganho de peso de cordeiros terminados em confinamento e alimentados com manipueira. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 3., 2013, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM. p. 226-232.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 98. | | SILVA, D. B. M. da; MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; SANTOS, D. de O.; CRUZ, J. P. M. da. Caracterização morfoagronômica e bromatológica do banco ativo de moringa. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 12., 2023, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2023. Editores Técnicos: Viviane Talamini, Ana da Silva Ledo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 99. | | SILVA, D. B. M.; MUNIZ, E. N.; SILVA, A. V. C. da; RANGEL, J. H. de A.; SANTOS, D. de O.; MATIAS, G. B. dos S. Caracterização morfoagronômica e bromatológica do banco ativo de moringa. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 11., 2022, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| Registros recuperados : 245 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
