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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
03/08/2004 |
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Data da última atualização: |
05/06/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MOTA, F. F. da; GOMES, E. A.; PAIVA, E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L. |
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Afiliação: |
ELIANE APARECIDA GOMES, CNPMS; EMBRAPA-CNPMS. |
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Título: |
Use of rpoB gene analysis for identification of nitrogen-fixing Paenibacillus species as an alternative to the 16S rRNA gene. |
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Ano de publicação: |
2004 |
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Fonte/Imprenta: |
Letters in Applied Microbiology, Oxford, v. 39, n. 1, p. 34-40, 2004. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Aim: To avoid the limitations of 16S rRNA-based phylogenetic analysis for Paenibacillus species, the usefulness of the RNA polymerase beta-subunit encoding gene (rpoB) was investigated as an alternative to the 16S rRNA gene for taxonomic studies. Methods and Results: Partial rpoB sequences were generated for the type strains of eight nitrogen-fixing Paenibacillus species. The presence of only one copy of rpoB in the genome of P. graminis strain RSA19T was demonstrated by denaturing gradient gel electrophoresis and hybridization assays. A comparative analysis of the sequences of the 16S rRNA and rpoB genes was performed and the eight species showed between 91·6-99·1% (16S rRNA) and 77·9-97·3% (rpoB) similarity, allowing a more accurate discrimination between the different species using the rpoB gene. Finally, 24 isolates from the rhizosphere of different cultivars of maize previously identified as Paenibacillus spp. were assigned correctly to one of the nitrogen-fixing species. Conclusions, Significance and Impact of the Study: The data obtained in this study indicate that rpoB is a powerful identification tool, which can be used for the correct discrimination of the nitrogen-fixing species of agricultural and industrial importance within the genus Paenibacillus. |
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Thesagro: |
Gene. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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773 $tLetters in Applied Microbiology, Oxford$gv. 39, n. 1, p. 34-40, 2004.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 4. |  | MOTA, F. F.; GOMES, E. A.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; SELDIN, L. Análise das comunidades bacterianas presentes nas rizosferas de variedades de milho sensíveis e tolerantes ao alumínio plantadas em solo de cerrado. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte, Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 6. | | MOTA, F. F. da; NOBREGA, F. F.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; SELDIN, L. Genetic diversity of Paenibacillus polymyxa populations isolated from the rhizosphere of four cultivars of maize (Zea mays) planted in cerrado soil. Applied Soil Ecology, Amsterdam, v. 20, n. 2, p. 119-132, 2002.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 7. | | MOTA, F. F.; GOMES, E. A.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; SELDIN, L. Efeito da calagem do solo de cerrado na estrutura de comunidades bacterianas e fungicas presentes na rizosfera de linhagens de milho (Zea mays L.) sensiveis e tolerantes ao alumínio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 24.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBACTÉRIAS, 12.; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURA, 2.; ENCONTRO DE ENSINO EM MICROBIOLOGIA, 4., 2007, Brasília, DF. Anais. [São Paulo]: SBM, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 9. | | MOTA, F. F. da; GOMES, E.; MARRIEL, I.; PAIVA, E.; SELDIN, L. Molecular ecology based on 16S rDNA of bacterial communities from rhizospheres of sensitive and tolerant maize varieties under aluminum-stressing and non-stressing conditions thirty and ninety days after sowing. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito. Fertbio 2006: a busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 10. | | MOTA, F. F. da; GOMES, E. A.; PAIVA, E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L. Use of rpoB gene analysis for identification of nitrogen-fixing Paenibacillus species as an alternative to the 16S rRNA gene. Letters in Applied Microbiology, Oxford, v. 39, n. 1, p. 34-40, 2004.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 11. | | COELHO, M. R. R.; MOTA, F. F.; PAIVA, E.; MARRIEL, I. E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L.; CARNEIRO, N. P. Diversidade de Paenibacillus spp. na rizosfera de quatro cultivares de sorgo plantados em solo de cerrado sob condições contrastantes de nitrogênio. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 12. | | COELHO, M. R. R.; MOTA, F. F. da; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L. Diversity of Paenibacillus spp. in the rhizosphere of four sorghum (Sorghum bicolor) cultivars sown with two contrasting levels of nitrogen fertilizer assessed by rpoB-Based PCR-DGGE and sequencing analysis. Journal of Microbiology and Biotechnology, v. 17, n. 5, p. 753-760, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 13. | | COTTA, S. R; MOTA, F. F. da; TUPINAMBÁ, G.; ISHIDA, K.; ROZENTAL, S.; SILVA, D. O. e; SILVA, A. J. R. da; BIZZO, H. R.; ALVIANO, D. S.; ALVIANO, C. S.; SELDIN, L. Antimicrobial activity of Paenibacillus kribbensis POC 115 against the dermatophyte Trichophyton rubrum. World Journal of Microbiology and Biotechnology, v. 28, n. 3, p. 953-962, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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| Registros recuperados : 13 | |
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