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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
13/12/2007 |
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Data da última atualização: |
09/10/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
OLIVEIRA, E. J. de; GARCIA, A. A. F.; MUNHOZ, C. de F.; MARGARIDO, G. R. A.; CONSOLI, L.; MATTA, F. de P.; MORAES, M. C. de; ZUCCHI, M. I.; FUNGARO, M. H. P.; VIEIRA, M. L. C. |
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Afiliação: |
Eder Jorge de Oliveira, CNPMF; Antonio Augusto Franco Garcia, ESALQ; Carla de Freitas Munhoz, ESALQ; Gabriel Rodriguez Alves Margarido, ESALQ; Luciano Consoli, CNPT; Frederico de Pina Matta, UFES; Michel Choairy de Moraes, Canavialis; Maria Imaculada Zucchi, IAC; Maria Helena Peleginelli Fungaro, UEL; Maria Lucia Carneiro Vieira, ESALQ. |
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Título: |
Integração de mapas genético-moleculares de maracujá-amarelo. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. São Lourenço:[s.n.], 2007. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A dificuldade de obtenção de linhas puras para a formação de populações tradicionais de mapeamento, dificulta a construção de mapas de ligação em espécies auto-imcompatíveis, como o maracujá-amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpa). Nesses casos, emprega-se uma população F1 e apenas marcas segregantes para um ou outro genitor (tipo 1:1), permitindo a construção de mapas individuais. Esta estratégia é denominada 2-way pseudo-testcross (Grattapaglia & Sederoff, 1994). Contudo, é possível promover a integração desses mapas com marcas biparentais, com segregações do tipo: 3:1 e 1:2:1 e 1:1:1:1. O objetivo desse estudo foi a construção de um mapa integrado de maracujá-amarelo combinando diferentes tipos de segregações usando-se marcadores AFLP (Amplified Fragement Lenght Polymophism) e microssatélites (SSR-Simple Sequence Repeats), por meio de um algoritmo que estima, simultaneamente, a fração de recombinação e a fase de ligação, desconhecida à priori, por se tratar de uma população F1 não-endogâmica. |
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Palavras-Chave: |
Marcadores molecular. |
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Thesagro: |
Fruticultura. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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520 $aA dificuldade de obtenção de linhas puras para a formação de populações tradicionais de mapeamento, dificulta a construção de mapas de ligação em espécies auto-imcompatíveis, como o maracujá-amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpa). Nesses casos, emprega-se uma população F1 e apenas marcas segregantes para um ou outro genitor (tipo 1:1), permitindo a construção de mapas individuais. Esta estratégia é denominada 2-way pseudo-testcross (Grattapaglia & Sederoff, 1994). Contudo, é possível promover a integração desses mapas com marcas biparentais, com segregações do tipo: 3:1 e 1:2:1 e 1:1:1:1. O objetivo desse estudo foi a construção de um mapa integrado de maracujá-amarelo combinando diferentes tipos de segregações usando-se marcadores AFLP (Amplified Fragement Lenght Polymophism) e microssatélites (SSR-Simple Sequence Repeats), por meio de um algoritmo que estima, simultaneamente, a fração de recombinação e a fase de ligação, desconhecida à priori, por se tratar de uma população F1 não-endogâmica.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
02/07/2009 |
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Data da última atualização: |
31/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
MEIRA, C. A. A.; RODRIGUES, L. H. A. |
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Afiliação: |
CARLOS ALBERTO ALVES MEIRA, CNPTIA; LUIZ HENRIQUE ANTUNES RODRIGUES, FEAGRI/UNICAMP. |
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Título: |
Modelos em árvore de decisão para alerta da ferrugem do cafeeiro. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. Não paginado. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi desenvolver modelos em árvore de decisão para alerta da ferrugem do cafeeiro. Dados de oito anos de incidência mensal da doença no campo foram transformados em valores binários, considerando o limite de 5 pontos percentuais na taxa de infecção. Dois modelos foram gerados a partir de dados meteorológicos e do espaçamento entre plantas,, sendo um para lavouras com alta carga pendente de frutos e outro para lavouras com baixa carga pendente. O alerta é indicado quando a taxa de infecção, prevista para o prazo de um mês, atingir ou ultrapassar 5 pontos percentuais. A acurácia do modelo para lavouras com alta carga pendente foi de 81%, calculada por validação cruzada. Este modelo apresentou bons resultados também para outras medidas de avaliação importantes, como sensitividade (80%), especificidade (83%) e confiabilidades positiva (79%) e negativa (84%). O modelo para lavouras com baixa carga pendente não apresentou o mesmo bom desempenho. A acurácia foi estimada em 72% e não houve equilíbrio entre as medidas de avaliação. O modelo de alerta para lavouras com alta carga pendente pode auxiliar na tomada de decisão referente ao controle da ferrugem do cafeeiro no campo. O modelo em árvore de decisão facilita a interpretação e a compreensão de suas regras e assim pode contribuir para que o tomador de decisões tenha maior confiança em adotá-lo como ferramenta de apoio. |
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Palavras-Chave: |
Árvore de decisão; Cafeeiro; Data mining; Decision tree; Mineração de dados; Modelos; Plantas; Predição de doenças de plantas. |
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Thesagro: |
Agricultura; Café; Coffea Arábica; Ferrugem; Hemileia Vastatrix. |
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Thesaurus NAL: |
Models. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/158325/1/modelos-arvore.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. Não paginado.$c2009
520 $aO objetivo deste trabalho foi desenvolver modelos em árvore de decisão para alerta da ferrugem do cafeeiro. Dados de oito anos de incidência mensal da doença no campo foram transformados em valores binários, considerando o limite de 5 pontos percentuais na taxa de infecção. Dois modelos foram gerados a partir de dados meteorológicos e do espaçamento entre plantas,, sendo um para lavouras com alta carga pendente de frutos e outro para lavouras com baixa carga pendente. O alerta é indicado quando a taxa de infecção, prevista para o prazo de um mês, atingir ou ultrapassar 5 pontos percentuais. A acurácia do modelo para lavouras com alta carga pendente foi de 81%, calculada por validação cruzada. Este modelo apresentou bons resultados também para outras medidas de avaliação importantes, como sensitividade (80%), especificidade (83%) e confiabilidades positiva (79%) e negativa (84%). O modelo para lavouras com baixa carga pendente não apresentou o mesmo bom desempenho. A acurácia foi estimada em 72% e não houve equilíbrio entre as medidas de avaliação. O modelo de alerta para lavouras com alta carga pendente pode auxiliar na tomada de decisão referente ao controle da ferrugem do cafeeiro no campo. O modelo em árvore de decisão facilita a interpretação e a compreensão de suas regras e assim pode contribuir para que o tomador de decisões tenha maior confiança em adotá-lo como ferramenta de apoio.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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