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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Solos. |
Data corrente: |
08/01/2014 |
Data da última atualização: |
30/05/2017 |
Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Autoria: |
MOREIRA, F. M. de S.; LIMA, A. S.; ACIOLI, A. N. S.; MOINO JUNIOR, A.; TRGUE, A. P.; BARBERI, A.; MARTINS, A. L. U.; NOGUEIRA, C. L. B.; GRIPPA, C. R.; PEREZ, D. V.; SILVA FILHO, D. F. da; ALBUQUERQUE, D. C. de; JESUS, E. da C.; ANDRADE, E. P.; FIDALGO, E. C. C.; ARAUJO, F. de O.; VILLANI, F. T.; MACHADO, F. M.; RIBEIRO, F. V.; RIBEIRO, G.; SILVA, G. A. e; SCHIFFLER, G.; PEREIRA, H.; NODA, H.; SANTOS, H. G. dos; AMARAL, I. L. do; DELABIE, J.; SIQUEIRA, J. O.; MORAIS, J. W.; PEREIRA, J. P. R.; VIDAL, J. de O.; LOUZADA, J.; CARES, J.; UGUEN, K.; SILVA, K. de; FLORENTINO, L. A.; ABREU, L. M. de; PFENNING, L. H.; OLIVEIRA, M. S.; GOMIDE, M. L.; MESQUITA, M. da G. B. de; BREFIN, M. de L. M. S.; RODRIGUES, M. I. D.; COELHO, M. R.; SILVA, M. A.; SANTOS, M. S.; SILVA, N. M. da; DIAS, N.; NÓBREGA, R. S. A.; CONSTANTINO, R.; CAVALCANTI, R. S.; OLIVEIRA, R. F. M. de; LEAL, P. L.; FERREIRA, P. A.; SILVA, P. H.; ZANETTI, R.; TAPIA-CORAL, S. C.; STUMER, S. L.; ALFAIA, S. S.; ANDALÓ, V.; OLIVEIRA, V. dos S. |
Afiliação: |
Fatima Maria de Souza Moreira, UFLA; Adriana S. Lima., Universidade Federal de Lavras; Agno N. S. Acioli, UFAM; Alcides Moino Junior, Universidade Federal de Lavras; Alexandra Priscila Tregue, Universidade Federal do Amazonas; Alexandre Barberi, Universidade Federal de Lavras; Ayrton Luiz Urizzi Martins, Centro Universitário Luterano de Manaus; Carla Luciane Bentes Nogueira, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; Carlos Roberto Grippa, Universidade Regional de Blumenau; DANIEL VIDAL PEREZ, CNPS; Danilo Fernandes da Silva Filho, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.; Diego Cunha de Albuquerque, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; Ederson da Conceição Jesus., Universidade Federal de Lavras; Ednalva P. Andrade, Universidade de Brasília; ELAINE CRISTINA CARDOSO FIDALGO, CNPS; FABIANO DE OLIVEIRA ARAUJO, CNPS; Fernanda Tunes Villani, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; Francisco Manoares Machado, nstituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus; Frederico Vasconcelos Ribeiro., Universidade Federal do Amazonas; Gyovanni Ribeiro., Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; Glaucia Alves e Silva, Universidade Federal de Lavras; Gustavo Schiffler., Universidade Federal de Lavras; Henrique Pereira., Universidade Federal do Amazonas; Hiroshi Noda., Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; HUMBERTO GONCALVES DOS SANTOS, CNPS; Ieda Leão do Amaral, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus; Jacques Delabie, CEPEC/CEPLAC; José Oswaldo Siqueira., Universidade Federal de Lavras; José Wellington Morais, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; João Paulo R. Pereira, Universidade Federal de Lavras; Jucélia de Oliveira Vidal, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; Julio Louzada, Universidade Federal de Lavras; Juvenil Cares, Universidade de Brasília; Katell Uguen, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; Krisle da Silva, Universidade Federal de Lavras; Ligiane Aparecida Florentino., Universidade Federal de Lavras; Lucas Magalhães de Abreu, Universidade Federal de Lavras; Ludwig H. Pfenning, Universidade Federal de Lavras; Marcelo Silva de Oliveira, Universidade Federal de Lavras; Márcia Lídia Gomide, Universidade Federal de Lavras; Maria da Glória Bastos de Freitas Mesquita, Universidade Federal de Lavras; MARIA DE LOURDES M SANTOS BREFIN, CNPS; Maria Isabel Dantas Rodrigues, Universidade Federal de Lavras; MAURICIO RIZZATO COELHO, CNPS; Michele A. Silva, Universidade Federal de Lavras; Mônica Silva Santos, Universidade Federal de Lavras; Neliton Marques da Silva, Universidade Federal do Amazonas; Nívia Dias, Universidade Federal de Lavras; Rafaela S. A. Nóbrega, Universidade Federal do Piauí; Reginaldo Constantino, Universidade de Brasília; Ricardo Souza Cavalcanti, Universidade Federal de Lavras; Rina Fátima Maranhão de Oliveira, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; Patricia Lopes Leal, Universidade Federal de Lavras; Paulo A. Ferreira, Universidade Federal de Lavras; Paulo Henrique Silva, Universidade Federal de Lavras; Ronald Zanetti, Universidade Federal de Lavras; Sandra Celia Tapia-Coral, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus; Sidney Luiz Stürmer, Universidade Regional de Blumenau; Sonia Sena Alfaia, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; Vanessa Andaló, Universidade Federal de Lavras; Viviane dos Santos Oliveira, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. |
Título: |
Biodiversidade do solo em sistemas de uso da terra na Amazônia ocidental. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
In: PERES, C. A.; BARLOW, J.; GARDNER, T. A.; VIEIRA, I. C. G. (Org.). Conservação da biodiversidade em paisagens antropizadas do Brasil. Curitiba: UFPR, 2013. cap. 14, p. 293-326. |
Idioma: |
Português |
Palavras-Chave: |
Amazôna ocidental. |
Thesagro: |
Biodiversidade. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94839/1/cap.-14-Conservacao-da-Biodiversidade-paisagens-antropizadas-do-Brasil.pdf
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Marc: |
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Embrapa Solos (CNPS) |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Suínos e Aves. Para informações adicionais entre em contato com cnpsa.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
19/10/2018 |
Data da última atualização: |
19/10/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
LORENZETTI, W. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; OLIVEIRA, H. C. de; LEDUR, M. C. |
Afiliação: |
WILLIAM RAPHAEL LORENZETTI, UDESC/Chapecó; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MARCOS ANTONIO ZANELLA MORES, CNPSA; IGOR RICARDO SAVOLDI, UNC/Concórdia; KAMILLA BLEIL DO CARMO, UNC/Concórdia; HANIEL CEDRAZ DE OLIVEIRA, UFV; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
Título: |
Identification of endogenous normalizing genes for expression studies in inguinal ring tissue for scrotal hernias in pigs. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 13, n.9, e0204348, 2018. |
DOI: |
10.1371/journal.pone.0204348 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract: The use of reference genes is required for relative quantification in gene expression analysis and since the stability of these genes could be variable depending on the experimental design, it has become indispensable to test the reliability of endogenous genes. Therefore, this study evaluated 10 reference candidate genes in two different experimental conditions in order to obtain stable genes to be used as reference in expression studies related to scrotal hernias in pigs. Two independent experiments were performed: one with 30 days-old MS115 pigs and the other with 60 days-old Landrace pigs. The inguinal ring/canal was collected, frozen and further submitted to real-time PCR analysis (qPCR). For the reference genes stability evaluation, four tools were used: GeNorm in the SLqPCR, BestKeeper, NormFinder and Comparative CT. A general ranking was generated using the BruteAggreg function of R environment. In this study, the RPL19 was one of the most reliable endogenous genes for both experiments. The breed/age effects influenced the expression stability of candidate reference genes evaluated in the inguinal ring of pigs. Therefore, this study reinforces the importance of evaluating the stability of several endogenous genes previous their use, since a consensual set of reference genes is not easily obtained. Here, two sets of genes are recommended: RPL19, RPL32 and H3F3A for 30-days MS115 and PPIA and RPL19 for the 60 days-old Landrace pigs. This is the first study using the inguinal ring tissue and the results can be useful as an indicative for other studies working with gene expression in this tissue. Resumo: O uso de genes de referência é necessário para a quantificação relativa na análise da expressão gênica e como a estabilidade desses genes pode ser variável dependendo do desenho experimental, tornou-se indispensável testar a confiabilidade dos genes endógenos. Portanto, este estudo avaliou 10 genes candidatos de referência em duas condições experimentais diferentes, a fim de obter genes estáveis para serem usados como referência em estudos de expressão relacionados a hérnias escrotais em suínos. Dois experimentos independentes foram realizados: um com porcos MS115 com 30 dias de idade e outro com porcos Landrace com 60 dias de idade. O anel / canal inguinal foi coletado, congelado e posteriormente submetido à análise de PCR em tempo real (qPCR). Para a avaliação da estabilidade dos genes de referência, foram utilizadas quatro ferramentas: GeNorm no SLqPCR, BestKeeper, NormFinder e Comparative CT. Uma classificação geral foi gerada usando a função BruteAggreg do ambiente R. Neste estudo, o RPL19 foi um dos genes endógenos mais confiáveis para ambos os experimentos. Os efeitos raça / idade influenciaram a estabilidade de expressão dos genes de referência candidatos avaliados no anel inguinal de suínos. Portanto, este estudo reforça a importância de avaliar a estabilidade de vários genes endógenos antes do seu uso, uma vez que um conjunto consensual de genes de referência não é facilmente obtido. Aqui, dois conjuntos de genes são recomendados: RPL19, RPL32 e H3F3A para MS115 de 30 dias e PPIA e RPL19 para os suínos Landrace com 60 dias de idade. Este é o primeiro estudo usando o tecido anelar inguinal e os resultados podem ser úteis como um indicativo para outros estudos que trabalham com expressão gênica neste tecido. MenosAbstract: The use of reference genes is required for relative quantification in gene expression analysis and since the stability of these genes could be variable depending on the experimental design, it has become indispensable to test the reliability of endogenous genes. Therefore, this study evaluated 10 reference candidate genes in two different experimental conditions in order to obtain stable genes to be used as reference in expression studies related to scrotal hernias in pigs. Two independent experiments were performed: one with 30 days-old MS115 pigs and the other with 60 days-old Landrace pigs. The inguinal ring/canal was collected, frozen and further submitted to real-time PCR analysis (qPCR). For the reference genes stability evaluation, four tools were used: GeNorm in the SLqPCR, BestKeeper, NormFinder and Comparative CT. A general ranking was generated using the BruteAggreg function of R environment. In this study, the RPL19 was one of the most reliable endogenous genes for both experiments. The breed/age effects influenced the expression stability of candidate reference genes evaluated in the inguinal ring of pigs. Therefore, this study reinforces the importance of evaluating the stability of several endogenous genes previous their use, since a consensual set of reference genes is not easily obtained. Here, two sets of genes are recommended: RPL19, RPL32 and H3F3A for 30-days MS115 and PPIA and RPL19 for the 60 days-old Landrace pigs. This is the first study us... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Hérnias escrotais; Scrotal hernias. |
Thesagro: |
Genética Animal; Hérnia; Melhoramento Genético Animal; Suíno. |
Thesaurus NAL: |
Breeding; Breeding and Genetic Improvement; Swine. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 04455naa a2200325 a 4500 001 2097801 005 2018-10-19 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1371/journal.pone.0204348$2DOI 100 1 $aLORENZETTI, W. R. 245 $aIdentification of endogenous normalizing genes for expression studies in inguinal ring tissue for scrotal hernias in pigs.$h[electronic resource] 260 $c2018 520 $aAbstract: The use of reference genes is required for relative quantification in gene expression analysis and since the stability of these genes could be variable depending on the experimental design, it has become indispensable to test the reliability of endogenous genes. Therefore, this study evaluated 10 reference candidate genes in two different experimental conditions in order to obtain stable genes to be used as reference in expression studies related to scrotal hernias in pigs. Two independent experiments were performed: one with 30 days-old MS115 pigs and the other with 60 days-old Landrace pigs. The inguinal ring/canal was collected, frozen and further submitted to real-time PCR analysis (qPCR). For the reference genes stability evaluation, four tools were used: GeNorm in the SLqPCR, BestKeeper, NormFinder and Comparative CT. A general ranking was generated using the BruteAggreg function of R environment. In this study, the RPL19 was one of the most reliable endogenous genes for both experiments. The breed/age effects influenced the expression stability of candidate reference genes evaluated in the inguinal ring of pigs. Therefore, this study reinforces the importance of evaluating the stability of several endogenous genes previous their use, since a consensual set of reference genes is not easily obtained. Here, two sets of genes are recommended: RPL19, RPL32 and H3F3A for 30-days MS115 and PPIA and RPL19 for the 60 days-old Landrace pigs. This is the first study using the inguinal ring tissue and the results can be useful as an indicative for other studies working with gene expression in this tissue. Resumo: O uso de genes de referência é necessário para a quantificação relativa na análise da expressão gênica e como a estabilidade desses genes pode ser variável dependendo do desenho experimental, tornou-se indispensável testar a confiabilidade dos genes endógenos. Portanto, este estudo avaliou 10 genes candidatos de referência em duas condições experimentais diferentes, a fim de obter genes estáveis para serem usados como referência em estudos de expressão relacionados a hérnias escrotais em suínos. Dois experimentos independentes foram realizados: um com porcos MS115 com 30 dias de idade e outro com porcos Landrace com 60 dias de idade. O anel / canal inguinal foi coletado, congelado e posteriormente submetido à análise de PCR em tempo real (qPCR). Para a avaliação da estabilidade dos genes de referência, foram utilizadas quatro ferramentas: GeNorm no SLqPCR, BestKeeper, NormFinder e Comparative CT. Uma classificação geral foi gerada usando a função BruteAggreg do ambiente R. Neste estudo, o RPL19 foi um dos genes endógenos mais confiáveis para ambos os experimentos. Os efeitos raça / idade influenciaram a estabilidade de expressão dos genes de referência candidatos avaliados no anel inguinal de suínos. Portanto, este estudo reforça a importância de avaliar a estabilidade de vários genes endógenos antes do seu uso, uma vez que um conjunto consensual de genes de referência não é facilmente obtido. Aqui, dois conjuntos de genes são recomendados: RPL19, RPL32 e H3F3A para MS115 de 30 dias e PPIA e RPL19 para os suínos Landrace com 60 dias de idade. Este é o primeiro estudo usando o tecido anelar inguinal e os resultados podem ser úteis como um indicativo para outros estudos que trabalham com expressão gênica neste tecido. 650 $aBreeding 650 $aBreeding and Genetic Improvement 650 $aSwine 650 $aGenética Animal 650 $aHérnia 650 $aMelhoramento Genético Animal 650 $aSuíno 653 $aHérnias escrotais 653 $aScrotal hernias 700 1 $aIBELLI, A. M. G. 700 1 $aPEIXOTO, J. de O. 700 1 $aMORES, M. A. Z. 700 1 $aSAVOLDI, I. R. 700 1 $aCARMO, K. B. do 700 1 $aOLIVEIRA, H. C. de 700 1 $aLEDUR, M. C. 773 $tPlos One$gv. 13, n.9, e0204348, 2018.
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