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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
19/05/2017 |
Data da última atualização: |
17/06/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, R. A. da; SOUZA, G.; LEMOS, L. S. L.; LOPES, U. V.; PATROCÌNIO, N. G. R. B.; ALVES, R. M.; MARCELLINO, L. H.; CLEMENT, D.; MICHELI, F.; GRAMACHO, K. P. |
Afiliação: |
RANGELINE AZEVEDO DA SILVA, UESC; GUSTAVO SOUZA, UFPE; LÍVIA SANTOS LIMA LEMOS, UFSB; UILSON VANDERLEI LOPES, CEPLAC/CEPEC; NARA GEÓRGIA RIBEIRO BRAZ PATROCÌNIO, UESC; RAFAEL MOYSES ALVES, CPATU; LUCILIA HELENA MARCELLINO, Cenargen; DIDIER CLEMENT, CEPLAC/CEPEC; FABIENNE MICHELI, UESC; KARINA PERES GRAMACHO, CEPLAC/CEPEC. |
Título: |
Genome size, cytogenetic data and transferability of EST-SSRs markers in wild and cultivated species of the genus Theobroma L. (Byttnerioideae, Malvaceae). |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
PLoS ONE, v. 12, n. 2, 2017. |
DOI: |
10.1371/journal.pone.0170799 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The genus Theobroma comprises several trees species native to the Amazon. Theobroma cacao L. plays a key economic role mainly in the chocolate industry. Both cultivated and wild forms are described within the genus. Variations in genome size and chromosome number have been used for prediction purposes including the frequency of interspecific hybridization or inference about evolutionary relationships. In this study, the nuclear DNA content, karyotype and genetic diversity using functional microsatellites (EST-SSR) of seven Theobroma species were characterized. The nuclear content of DNA for all analyzed Theobroma species was 1C = ~ 0.46 pg. These species presented 2n = 20 with small chromosomes and only one pair of terminal heterochromatic bands positively stained (CMA+/DAPI− bands). The small size of Theobroma ssp. genomes was equivalent to other Byttnerioideae species, suggesting that the basal lineage of Malvaceae have smaller genomes and that there was an expansion of 2C values in the more specialized family clades. A set of 20 EST-SSR primers were characterized for related species of Theobroma, in which 12 loci were polymorphic. The polymorphism information content (PIC) ranged from 0.23 to 0.65, indicating a high level of information per locus. Combined results of flow cytometry, cytogenetic data and EST-SSRs markers will contribute to better describe the species and infer about the evolutionary relationships among Theobroma species. In addition, the importance of a core collection for conservation purposes is highlighted. MenosThe genus Theobroma comprises several trees species native to the Amazon. Theobroma cacao L. plays a key economic role mainly in the chocolate industry. Both cultivated and wild forms are described within the genus. Variations in genome size and chromosome number have been used for prediction purposes including the frequency of interspecific hybridization or inference about evolutionary relationships. In this study, the nuclear DNA content, karyotype and genetic diversity using functional microsatellites (EST-SSR) of seven Theobroma species were characterized. The nuclear content of DNA for all analyzed Theobroma species was 1C = ~ 0.46 pg. These species presented 2n = 20 with small chromosomes and only one pair of terminal heterochromatic bands positively stained (CMA+/DAPI− bands). The small size of Theobroma ssp. genomes was equivalent to other Byttnerioideae species, suggesting that the basal lineage of Malvaceae have smaller genomes and that there was an expansion of 2C values in the more specialized family clades. A set of 20 EST-SSR primers were characterized for related species of Theobroma, in which 12 loci were polymorphic. The polymorphism information content (PIC) ranged from 0.23 to 0.65, indicating a high level of information per locus. Combined results of flow cytometry, cytogenetic data and EST-SSRs markers will contribute to better describe the species and infer about the evolutionary relationships among Theobroma species. In addition, the importance o... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Theobroma Cacao. |
Thesaurus Nal: |
Theobroma. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/214031/1/journal.pone.0170799.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/180926/1/journal.pone.0170799.pdf
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Marc: |
LEADER 02379naa a2200265 a 4500 001 2123321 005 2020-06-17 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1371/journal.pone.0170799$2DOI 100 1 $aSILVA, R. A. da 245 $aGenome size, cytogenetic data and transferability of EST-SSRs markers in wild and cultivated species of the genus Theobroma L. (Byttnerioideae, Malvaceae).$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aThe genus Theobroma comprises several trees species native to the Amazon. Theobroma cacao L. plays a key economic role mainly in the chocolate industry. Both cultivated and wild forms are described within the genus. Variations in genome size and chromosome number have been used for prediction purposes including the frequency of interspecific hybridization or inference about evolutionary relationships. In this study, the nuclear DNA content, karyotype and genetic diversity using functional microsatellites (EST-SSR) of seven Theobroma species were characterized. The nuclear content of DNA for all analyzed Theobroma species was 1C = ~ 0.46 pg. These species presented 2n = 20 with small chromosomes and only one pair of terminal heterochromatic bands positively stained (CMA+/DAPI− bands). The small size of Theobroma ssp. genomes was equivalent to other Byttnerioideae species, suggesting that the basal lineage of Malvaceae have smaller genomes and that there was an expansion of 2C values in the more specialized family clades. A set of 20 EST-SSR primers were characterized for related species of Theobroma, in which 12 loci were polymorphic. The polymorphism information content (PIC) ranged from 0.23 to 0.65, indicating a high level of information per locus. Combined results of flow cytometry, cytogenetic data and EST-SSRs markers will contribute to better describe the species and infer about the evolutionary relationships among Theobroma species. In addition, the importance of a core collection for conservation purposes is highlighted. 650 $aTheobroma 650 $aTheobroma Cacao 700 1 $aSOUZA, G. 700 1 $aLEMOS, L. S. L. 700 1 $aLOPES, U. V. 700 1 $aPATROCÌNIO, N. G. R. B. 700 1 $aALVES, R. M. 700 1 $aMARCELLINO, L. H. 700 1 $aCLEMENT, D. 700 1 $aMICHELI, F. 700 1 $aGRAMACHO, K. P. 773 $tPLoS ONE$gv. 12, n. 2, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Registros recuperados : 38 | |
1. | | AGUIAR, S. A.; OLIVEIRA, T. M. de; MICHELI, F.; FANCELLI, M. Alterações proteicas induzidas pela infestação de Diaphorina citri (Hemiptera, Liviidae) em genótipos de citros. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 9., 2015: Cruz das Almas, BA. Pesquisa: para quê? para quem? : resumos. Brasília, DF : Embrapa, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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5. | | SILVA, G. C.; D. M. NEVES; SANTANA-VIEIRA, D. D. S.; GESTEIRA, A. da S.; MICHELI, F. Plantas cítricas submetidas a déficit hídrico recorrente alteram a metilação do DNA. CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 25., 2017; REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE INTERAMERICANA DE HORTICULTURA TROPICAL, 62., 2017. Resumos... Porto Seguro, BA: SIHT, 2017.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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6. | | MAGALHÃES, T. de O.; MICHELI, F.; MASERTI, E.; NAVARRO, L.; TALON, M.; OLLITRAULT, P.; GESTEIRA, A. da S.; MORILLON, R. Physiological responses of diploid and doubled diploid Rangpur lime and Carrizo citrange under water deficit. In: INTERNATIONAL CITRUS CONGRESS, 22., 2012.Valencia. Book of abstracts. Valencia: International Society of Citriculture; Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias; Fundación Agroalimed, 2012. Documento eletrônico.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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7. | | OLIVEIRA, T. M.; MICHELI, F.; MASERTI, E. B.; NAVARRO, L.; TALÓN, M.; OLLITRAULT, P.; GESTEIRA, A. da S.; MORILLON, R. Physiological responses of diploid and doubled diploid rangpur lime under water deficit. Acta Horticulturae, 1065, Valencia, Spain , January 2015. Edição do Proceedings of the XII International Citrus Congress - International Society of Citriculture, Valencia, Spain, jan. 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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9. | | FALCAO, L. L.; RAMOS, A.; GESTEIRA, A.; ARGOUT, X.; CASCARDO, J. C.; MICHELI, F.; MARCELLINO, L. H. Gene expression variation in cocoa inolulcate with endophyte. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 9., 2009, St. Louis, Missouri. Proceedings... [S.l.]: The International Society for Plant Molecular Biology, 2009.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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10. | | SILVA, F. A. C.; PIROVANI, C. P.; MENEZES, S. P.; SANTIAGO, A. S.; CASCARDO, J. M. C.; MICHELI, F. F. L.; GESTEIRA, A. S. Action of the pathogenesis-related protein PR10 from Theobroma cacao in triggering response mechanisms of Moniliophtora perniciosa. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 3, 2011, Ilhéus. Resumos. [S. l.]: Sociedade Brasileira de Genética, 2011. 1 CD-ROM. pdf 35180Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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11. | | AGUIAR, S. A.; FANCELLI, M.; MASCARENHAS JUNIOR, F. P.; COELHO FILHO, M. A.; MICHELI, F. F. L.; GESTEIRA, A. da S.; SOARES FILHO, W. dos S. Análise proteômica de folhas de genótipos de citros infestadas por Diaphorina citri. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro : [anais]. Cruz das Almas, BA, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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12. | | SOUZA, J. D. de; SILVA, E. M. de A.; COELHO FILHO, M. A.; MORILLON, R.; BONATTO, D.; MICHELI, F.; GESTEIRA, A. da S. Different adaptation strategies of two citrus scion/rootstock Combinations in response to drought stress. PLOS ONE, May, 2017,Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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13. | | OLIVEIRA JÚNIOR, G. P.; FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; GESTEIRA, A. da S.; ARGOUT, X.; CASCARDO, J. C. M.; MICHELI, F.; MARCELLINO, L. H. Influência de um endofítico bacteriano na expressão gênica em folhas de cacau (Theobroma cacao). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 271.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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14. | | LOPES, M. A.; HORA JUNIOR, B. T.; DIAS, C. V.; SANTOS, G. C.; GRAMACHO, K. P.; CASCARDO, J. C. M.; GESTEIRA, A. da S.; MICHELI, F. Expression analysis of transcription factors from the interaction between cacao and Moniliophthora perniciosa (Tricholomataceae). Genetics and Molecualr Reseach, Ribeirão Preto, v. 9, n. 3, p. 1279-1297, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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15. | | PUNGARTNIK, C.; SILVA, A. C. da; MELO, S. A. de; GRAMACHO, K. P.; CASCARDO, J. C. de M.; BRENDEL, M.; MICHELI, F.; GESTEIRA, A. da S. High-affinity copper transport and Snq2 export permease of Saccharomyces cerevisiae modulate cytotoxicity of PR-10 from Theobroma cacao. Molecular Plant-Microbe Interactions, St. Paul, v. 22, n. 1, p. 39-51, jan. 2009. DOI: 10.1094/MPMI - 22 - 1 - 0039Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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16. | | SILVA, F. A. C.; PIROVANI, C. P.; MENEZES, S.; PUNGARTNIK, C.; SANTIAGO, A. S.; COSTA, M. G. C.; MICHELI, F.; GESTEIRA, A. da S. Proteomic response of Moniliophthora perniciosa exposed to pathogenesis-related protein-10 from Theobroma cacao. Genetics and Molecular Research, v.12, n. 4, p. 4855-4868, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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17. | | BRITTO, D. S.; PIROVANI, C. P.; ANDRADE, B. S.; SANTOS, T. P. dos; PUNGARTNIK, C.; CASCARDO, J. C. M.; MICHELI, F.; GESTEIRA, A. da S. Recombinant b-1,3-1,4-glucanase from Theobroma cacao impairs Moniliophthora perniciosa mycelial growth. Molecular Biology Reports, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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18. | | MASCARENHAS JUNIOR, F. P.; COELHO FILHO, M. A.; AGUIAR, S. A.; MICHELI, F. F. L.; GESTEIRA, A. da S.; FANCELLI, M. Respostas fisiológicas de plantas cítricas submetidas ao estresse hídrico e infestação por Diaphorina citri. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro: [anais]. Cruz das Almas, BA, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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19. | | NASCIMENTO, L. S. do; NEVES, C. G.; AMARAL, D. O. J. do; PAULA, M. F. B. de; COSTA, C. L. dos S.; PASSOS, O. S.; GESTEIRA, A. da S.; MICHELI, F. Avaliação morfológica e agronômica de variedades de tangerinas. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 10., 2016: Cruz das Almas, BA. Traduzindo ciência para o mundo : resumos. Brasília, DF : Embrapa, 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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20. | | LIMA, L. S.; GRAMACHO, K. P.; PIRES, J. L.; CLEMENT, D.; LOPES, U. V.; CARELS, N.; GESTEIRA, A. da S.; GAIOTTO, F. A.; CASCARDO, J. C. de MATTOS; MICHELI, F. Development, characterization, validation, and mapping of SSRs derived from Theobroma cacao L.?Moniliophthora perniciosa interaction ESTs. Tree Genetics & Genomes, Heidelberg, mar. 2010. On line first: 10 march 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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