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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
30/03/2016 |
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Data da última atualização: |
24/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SANTOS, L. F. dos; FREGAPANI, R. M.; FALCAO, L. L.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; LOPES, U. V.; GRAMACHO, K. P.; ALVES, R. M.; MICHELI, F.; MARCELLINO, L. H. |
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Afiliação: |
Lucas Ferraz dos Santos, UESC/CENARGEN; Roberta Moreira Fregapani, CENARGEN; LOENI LUDKE FALCAO, CENARGEN; ROBERTO COITI TOGAWA, CENARGEN; MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, CENARGEN; Uilson Vanderlei Lopes, CEPLAC/CEPEC; Karina Peres Gramacho, CEPLAC/CEPEC; RAFAEL MOYSES ALVES, CPATU; Fabienne Micheli, UESC/CIRAD; LUCILIA HELENA MARCELLINO, CENARGEN. |
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Título: |
First microsatellite markers developed from cupuassu ESTs: application in diversity analysis and cross-species transferability to cacao. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
PLoS ONE, v. 11, n. 3, e0151074, 2016. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0151074 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The cupuassu tree (Theobroma grandiflorum) (Willd. ex Spreng.) Schum. is a fruitful species from the Amazon with great economical potential, due to the multiple uses of its fruit´s pulp and seeds in the food and cosmetic industries, including the production of cupulate, an alternative to chocolate. In order to support the cupuassu breeding program and to select plants presenting both pulp/seed quality and fungal disease resistance, SSRs from Next Generation Sequencing ESTs were obtained and used in diversity analysis. From 8,330 ESTs, 1,517 contained one or more SSRs (1,899 SSRs identified). The most abundant motifs identified in the EST-SSRs were hepta- and trinucleotides, and they were found with a minimum and maximum of 2 and 19 repeats, respectively. From the 1,517 ESTs containing SSRs, 70 ESTs were selected based on their functional annotation, focusing on pulp and seed quality, as well as resistance to pathogens. The 70 ESTs selected contained 77 SSRs, and among which, 11 were polymorphic in cupuassu genotypes. These EST-SSRs were able to discriminate the cupuassu genotype in relation to resistance/susceptibility to witches? broom disease, as well as to pulp quality (SST/ATT values). Finally, we showed that these markers were transferable to cacao genotypes, and that genome availability might be used as a predictive tool for polymorphism detection and primer design useful for both Theobroma species. To our knowledge, this is the first report involving EST-SSRs from cupuassu and is also a pioneer in the analysis of marker transferability from cupuassu to cacao. Moreover, these markers might contribute to develop or saturate the cupuassu and cacao genetic maps, respectively. MenosThe cupuassu tree (Theobroma grandiflorum) (Willd. ex Spreng.) Schum. is a fruitful species from the Amazon with great economical potential, due to the multiple uses of its fruit´s pulp and seeds in the food and cosmetic industries, including the production of cupulate, an alternative to chocolate. In order to support the cupuassu breeding program and to select plants presenting both pulp/seed quality and fungal disease resistance, SSRs from Next Generation Sequencing ESTs were obtained and used in diversity analysis. From 8,330 ESTs, 1,517 contained one or more SSRs (1,899 SSRs identified). The most abundant motifs identified in the EST-SSRs were hepta- and trinucleotides, and they were found with a minimum and maximum of 2 and 19 repeats, respectively. From the 1,517 ESTs containing SSRs, 70 ESTs were selected based on their functional annotation, focusing on pulp and seed quality, as well as resistance to pathogens. The 70 ESTs selected contained 77 SSRs, and among which, 11 were polymorphic in cupuassu genotypes. These EST-SSRs were able to discriminate the cupuassu genotype in relation to resistance/susceptibility to witches? broom disease, as well as to pulp quality (SST/ATT values). Finally, we showed that these markers were transferable to cacao genotypes, and that genome availability might be used as a predictive tool for polymorphism detection and primer design useful for both Theobroma species. To our knowledge, this is the first report involving EST-SSRs from cup... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
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Thesagro: |
Cacau; Cupuaçu; Fruta Tropical. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/141829/1/2016Santos.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
09/11/2020 |
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Data da última atualização: |
09/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PEREIRA, R. M. S.; PERTRINI, F. S.; CASTANHA, R. F.; CASTRO, V. L. S. S. de; JONSSON, C. M. |
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Afiliação: |
RAFAELA MENDES SANTOS PEREIRA, CNPq; FERNANDA SANA PERTRINI, FAPESP; RODRIGO FERNANDES CASTANHA, CNPMA; VERA LUCIA SCHERHOLZ S DE CASTRO, CNPMA; CLAUDIO MARTIN JONSSON, CNPMA. |
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Título: |
Avaliação em invertebrados visando o estabelecimento de uma dose de baixo risco para a toxicidade da nanoprata: estudo em Panagrolaimus sp. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 14., 2020, Campinas. Anais... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2020. RE20408. |
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Páginas: |
p. 1-9. |
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ISBN: |
978-65-88414-00-2 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo: As nanopartículas de prata (AgNP) liberam continuamente um baixo nível de íons de prata para fornecerem proteção contra bactérias e têm sido empregadas em revestimentos antimicrobianos, tecidos, dispositivos biomédicos e outros materiais. No setor agrícola têm sido usadas na desinfecção de sementes e bulbos, assim como no controle de crescimento de fungos como Podosphaera pannosa em abóboras e Pythium ultimum e Colletotrichum gloeosporioides em outros vegetais. A produção de AgNP e o aumento do consumo de produtos que as contém pode levar à contaminação de compartimentos ambientais. Os nematoides de vida livre fazem parte da cadeia alimentar destes compartimentos. Este estudo teve como objetivo a avaliação da toxicidade aguda da AgNP sobre o nematoide Panagrolaimus sp e a utilização deste dado para estimar um nível de proteção para invertebrados do sistema aquático e sua zona de transição com o solo. Os organismos foram expostos à nanopartículas de prata estabilizada em álcool polivinílico (AgNP- PVA) em diferentes concentrações (0,0; 0,01; 0,1; 1; 10 and 100 mg/L). Foi registrada a imobilidade e determinada a concentração efetiva média por um período de 96 horas (CE50-96h) equivalente a 8,45 mg/L. O parâmetro de toxicidade obtido foi útil para estimar uma concentração de baixo risco (2,5 x 10-6 mg/L) para invertebrados. Os resultados auxiliam no estabelecimento de concentrações máximas protetivas das comunidades, assim como no controle de lançamento de efluentes que possam conter o nanomaterial. -- Abstrcat: Silver nanoparticles (AgNP) continuously release a low level of silver ions to provide protection against bacteria and have been used in antimicrobial coatings, clothing fabrics, biomedical devices and other materials. In the agricultural sector it has been used to disinfect seeds and bulbs, as well as to control the growth of fungi such as Podosphaera pannosa in pumpkins, and Pythium ultimum and Colletotrichum gloeosporioides in other vegetables. The production of AgNP and the increased consumption of products that contain them can lead to contamination of environmental compartments. Free-living nematodes belong to the food chain in such compartments. This study aimed to evaluate the acute toxicity of AgNP particles stabilized in polyvinyl alcohol (AgNP-PVA) on the nematode Panagrolaimus sp. and the use this data to estimate a level of protection for inhabits the aquatic system and its transition zone with the soil. The organisms were exposed to AgNP particles stabilized in polyvinyl alcohol (AgNP-PVA) in different concentrations (0.0; 0.01; 0.1; 1; 10 and 100 mg/L). Immobility was recorded and the average effective concentration was determined for a period of 96 hours (EC50-96h) equivalent to 8.45 mg/L. The toxicity parameter obtained was useful to estimate a low risk concentration (2.5 x 10-6 mg/L) for invertebrates. The results help to establish maximum protective concentrations for the communities, as well as to control the release of effluents that may contain the nanomaterial. MenosResumo: As nanopartículas de prata (AgNP) liberam continuamente um baixo nível de íons de prata para fornecerem proteção contra bactérias e têm sido empregadas em revestimentos antimicrobianos, tecidos, dispositivos biomédicos e outros materiais. No setor agrícola têm sido usadas na desinfecção de sementes e bulbos, assim como no controle de crescimento de fungos como Podosphaera pannosa em abóboras e Pythium ultimum e Colletotrichum gloeosporioides em outros vegetais. A produção de AgNP e o aumento do consumo de produtos que as contém pode levar à contaminação de compartimentos ambientais. Os nematoides de vida livre fazem parte da cadeia alimentar destes compartimentos. Este estudo teve como objetivo a avaliação da toxicidade aguda da AgNP sobre o nematoide Panagrolaimus sp e a utilização deste dado para estimar um nível de proteção para invertebrados do sistema aquático e sua zona de transição com o solo. Os organismos foram expostos à nanopartículas de prata estabilizada em álcool polivinílico (AgNP- PVA) em diferentes concentrações (0,0; 0,01; 0,1; 1; 10 and 100 mg/L). Foi registrada a imobilidade e determinada a concentração efetiva média por um período de 96 horas (CE50-96h) equivalente a 8,45 mg/L. O parâmetro de toxicidade obtido foi útil para estimar uma concentração de baixo risco (2,5 x 10-6 mg/L) para invertebrados. Os resultados auxiliam no estabelecimento de concentrações máximas protetivas das comunidades, assim como no controle de lançamento de efluentes que... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Nanomateriais; Nanoprata. |
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Thesagro: |
Composto Químico; Nematóide; Toxidez. |
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Thesaurus NAL: |
Ecotoxicology; Nanomaterials; Nanosilver; Nematoda; Panagrolaimus; Risk assessment. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/217567/1/Castro-Toxicidade-nanoprata-2020.pdf
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Marc: |
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520 $aResumo: As nanopartículas de prata (AgNP) liberam continuamente um baixo nível de íons de prata para fornecerem proteção contra bactérias e têm sido empregadas em revestimentos antimicrobianos, tecidos, dispositivos biomédicos e outros materiais. No setor agrícola têm sido usadas na desinfecção de sementes e bulbos, assim como no controle de crescimento de fungos como Podosphaera pannosa em abóboras e Pythium ultimum e Colletotrichum gloeosporioides em outros vegetais. A produção de AgNP e o aumento do consumo de produtos que as contém pode levar à contaminação de compartimentos ambientais. Os nematoides de vida livre fazem parte da cadeia alimentar destes compartimentos. Este estudo teve como objetivo a avaliação da toxicidade aguda da AgNP sobre o nematoide Panagrolaimus sp e a utilização deste dado para estimar um nível de proteção para invertebrados do sistema aquático e sua zona de transição com o solo. Os organismos foram expostos à nanopartículas de prata estabilizada em álcool polivinílico (AgNP- PVA) em diferentes concentrações (0,0; 0,01; 0,1; 1; 10 and 100 mg/L). Foi registrada a imobilidade e determinada a concentração efetiva média por um período de 96 horas (CE50-96h) equivalente a 8,45 mg/L. O parâmetro de toxicidade obtido foi útil para estimar uma concentração de baixo risco (2,5 x 10-6 mg/L) para invertebrados. Os resultados auxiliam no estabelecimento de concentrações máximas protetivas das comunidades, assim como no controle de lançamento de efluentes que possam conter o nanomaterial. -- Abstrcat: Silver nanoparticles (AgNP) continuously release a low level of silver ions to provide protection against bacteria and have been used in antimicrobial coatings, clothing fabrics, biomedical devices and other materials. In the agricultural sector it has been used to disinfect seeds and bulbs, as well as to control the growth of fungi such as Podosphaera pannosa in pumpkins, and Pythium ultimum and Colletotrichum gloeosporioides in other vegetables. The production of AgNP and the increased consumption of products that contain them can lead to contamination of environmental compartments. Free-living nematodes belong to the food chain in such compartments. This study aimed to evaluate the acute toxicity of AgNP particles stabilized in polyvinyl alcohol (AgNP-PVA) on the nematode Panagrolaimus sp. and the use this data to estimate a level of protection for inhabits the aquatic system and its transition zone with the soil. The organisms were exposed to AgNP particles stabilized in polyvinyl alcohol (AgNP-PVA) in different concentrations (0.0; 0.01; 0.1; 1; 10 and 100 mg/L). Immobility was recorded and the average effective concentration was determined for a period of 96 hours (EC50-96h) equivalent to 8.45 mg/L. The toxicity parameter obtained was useful to estimate a low risk concentration (2.5 x 10-6 mg/L) for invertebrates. The results help to establish maximum protective concentrations for the communities, as well as to control the release of effluents that may contain the nanomaterial.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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