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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
Data corrente: |
09/09/2010 |
Data da última atualização: |
06/06/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, R. P. V.; BRESEGHELLO, F.; COELHO, A. S. G.; MENDONÇA, J. A.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C. |
Afiliação: |
TEREZA CRISTINA DE OLIVEIRA BORBA, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO BRONDANI, CNPAF; FLAVIO BRESEGHELLO, CNPAF; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UFG; JOAO ANTONIO MENDONCA, CNPAF; PAULO HIDEO NAKANO RANGEL, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF. |
Título: |
Association mapping for yield and grain quality traits in rice (Oryza sativa L.). |
Ano de publicação: |
2010 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 33, n. 3, p. 515-524, 2010. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1415-47572010005000065 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Association analysis was applied to a panel of accessions of Embrapa Rice Core Collection (ERiCC) with 86 SSR and field data from two experiments. A clear subdivision between lowland and upland accessions was apparent, thereby indicating the presence of population structure. Thirty-two accessions with admixed ancestry were identified through structure analysis, these being discarded from association analysis, thus leaving 210 accessions subdivided into two panels. The association of yield and grain-quality traits with SSR was undertaken with a mixed linear model, with markers and subpopulation as fixed factors, and kinship matrix as a random factor. Eight markers from the two appraised panels showed significant association with four different traits, although only one (RM190) maintained the marker-trait association across years and cultivation. The significant association detected between amylose content and RM190 was in agreement with previous QTL analyses in the literature. Herein, the feasibility of undertaking association analysis in conjunction with germplasm characterization was demonstrated, even when considering low marker density. The high linkage disequilibrium expected in rice lines and cultivars facilitates the detection of marker-trait associations for implementing marker assisted selection, and the mining of alleles related to important traits in germplasm. |
Palavras-Chave: |
Association analysis; Core collection; Genetic structure. |
Thesagro: |
Arroz; Germoplasma; Oryza sativa; Recurso genético. |
Thesaurus Nal: |
Germplasm conservation; Rice. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/166817/1/CNPAF-2010-gmb.pdf
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Marc: |
LEADER 02328naa a2200313 a 4500 001 1862017 005 2022-06-06 008 2010 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1415-47572010005000065$2DOI 100 1 $aBORBA, T. C. de O. 245 $aAssociation mapping for yield and grain quality traits in rice (Oryza sativa L.).$h[electronic resource] 260 $c2010 520 $aAssociation analysis was applied to a panel of accessions of Embrapa Rice Core Collection (ERiCC) with 86 SSR and field data from two experiments. A clear subdivision between lowland and upland accessions was apparent, thereby indicating the presence of population structure. Thirty-two accessions with admixed ancestry were identified through structure analysis, these being discarded from association analysis, thus leaving 210 accessions subdivided into two panels. The association of yield and grain-quality traits with SSR was undertaken with a mixed linear model, with markers and subpopulation as fixed factors, and kinship matrix as a random factor. Eight markers from the two appraised panels showed significant association with four different traits, although only one (RM190) maintained the marker-trait association across years and cultivation. The significant association detected between amylose content and RM190 was in agreement with previous QTL analyses in the literature. Herein, the feasibility of undertaking association analysis in conjunction with germplasm characterization was demonstrated, even when considering low marker density. The high linkage disequilibrium expected in rice lines and cultivars facilitates the detection of marker-trait associations for implementing marker assisted selection, and the mining of alleles related to important traits in germplasm. 650 $aGermplasm conservation 650 $aRice 650 $aArroz 650 $aGermoplasma 650 $aOryza sativa 650 $aRecurso genético 653 $aAssociation analysis 653 $aCore collection 653 $aGenetic structure 700 1 $aBRONDANI, R. P. V. 700 1 $aBRESEGHELLO, F. 700 1 $aCOELHO, A. S. G. 700 1 $aMENDONÇA, J. A. 700 1 $aRANGEL, P. H. N. 700 1 $aBRONDANI, C. 773 $tGenetics and Molecular Biology$gv. 33, n. 3, p. 515-524, 2010.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Registros recuperados : 82 | |
21. | | SANTOS, F. F. dos; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; MENDONÇA, J. A.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P. Avaliação da expressão de genes candidatos para tolerância à deficiência hídrica em arroz de terras altas na plataforma de fenotipagem SITIS. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 11., 2017, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2017. p. 83. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 316).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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22. | | MELO, A. T. O.; RANGEL, P. N.; BRONDANI, C.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, R. P. V.; MENDONÇA, J. A. Ampliação da variabilidade genética de genes relacionados a produção em arroz por meio da metodologia de AB-QTLs em cruzamento Oryza sativa x O. glumaepatula. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 157.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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23. | | MELO, A. T. O.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; RANGEL, P. N.; RANGEL, P. H. N.; MENDONÇA, J. A. Caracterização molecular de linhagens de introgressão do cruzamento interespecífico Oryza sativaI x O. Glumaepatula por marcadores SSR fluorescentes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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24. | | GARCIA, A. L. B.; MENDONÇA, J. A.; SARTORI, D. E. L.; RAMOS, M. R. F.; BRONDANI, C. Caracterização genética por modelos mistos de uma população de linhas puras recombinantes de arroz irrigado. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 11., 2017, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2017. p. 75. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 316).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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25. | | MENDONÇA, J. A.; OLIVEIRA, J. P. de; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C.; ARAÚJO, F. J. M. Cruzamentos dialélicos entre genótipos da coleção nuclear de arroz da Embrapa. In: CONGRESSO DE PESQUISA, ENSINO E EXTENSÃO, 7., 2010, Goiânia. Conhecimento e desenvolvimento sustentável: anais... Goiânia: UFG, 2010. p. 5912-5916. Conpeex 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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26. | | RAMOS, M. R. F.; MENDONÇA, J. A.; PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C. Cruzamentos em dialelo de genótipos de arroz. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 112. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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27. | | ABREU, F. R. M.; OLIVEIRA, J. A. V. de; MENDONÇA, J. A.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Superexpressão do gene PLDa1 para aumento da tolerância à deficiência hídrica da cultivar de arroz aBRSMG Curinga. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 11., 2017, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2017. p. 27. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 316).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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28. | | OLIVEIRA, J. A. V. de; ROCHAS, D. C.; VIANELLO, R. P.; MENDONÇA, J. A.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C. Superexpressão do precursor de rubisco para aumento da produtividade e tolerância à seca em arroz. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 13., 2019, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2019. p. 65.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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29. | | OLIVEIRA, F. A.; VIANELLO, R. P.; RODRIGUES, L. A.; CASTRO, A. P. de; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, C. Validação do marcador SNP7 para identificação da tolerância à seca em variedades de arroz e plantas F2 do cruzamento Douradão x Dinolores. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 13., 2019, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2019. p. 35.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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30. | | OLIVEIRA, J. A. V. de; ABREU, F. R. M.; MENDONÇA, J. A.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Expressão relativa de genes homólogos de Arabidopsis em arroz relacionados ao aumento da produtividade. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 87. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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32. | | RANGEL, P. N.; VIANELLO, R. P.; MELO, A. T. O.; RANGEL, P. H. N.; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, C. Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 3, p. 280-286, mar. 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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33. | | SARTORI, D. E. L.; MENDONÇA, J. A.; SOUZA, R. O.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P.; GUIMARÃES, C. M.; MELO, L. C.; RAMALHO, I. Avaliação de acessos da CONFE sob sistema irrigado por aspersão (Phaseolus vulgaris L.) em ambiente de campo. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 67. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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34. | | BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, R. P. V.; BRESEGHELLO, F.; COELHO, A. S. G.; MENDONÇA, J. A.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C. Association mapping for yield and grain quality traits in rice (Oryza sativa L.). Genetics and Molecular Biology, v. 33, n. 3, p. 515-524, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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35. | | MENDES, C. dos A.; BORBA, T. C. de O.; BUENO, L. G.; CRUZEIRO, G. A. V.; MENDONÇA, J. A.; PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Análise de associação quanto à produtividade e seus caracteres componentes em linhagens e cultivares de arroz de terras altas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 49, n. 10, p. 771-782, out. 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Unidades Centrais. |
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36. | | SARTORI, D. E. L.; MENDONÇA, J. A.; LIMA, L. V. V. de O.; GOMES, M.; OLIVEIRA, J. A. V. de; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Avaliação da produtividade de grãos em arroz (Oryza sativa) geneticamente modificado, cultivado em dois níveis de fertilidade do solo. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 11., 2017, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2017. p. 49. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 316).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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37. | | COLOMBARI FILHO, J. M.; DURÃO, R. da S.; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E.; MENDONÇA, J. A.; VIDOTTI, M. S. Avaliação de progênies derivadas de cruzamentos envolvendo o acesso com espiguetas agrupadas da Embrapa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 8., 2013, Santa Maria. Avaliando cenários para a produção sustentável de arroz: anais. Santa Maria: UFSM; Porto Alegre: Sosbai, 2013. v.1. p. 117-120.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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38. | | ABREU, F. R. M.; OLIVEIRA, J. A. V. de; MENDONÇA, J. A.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. De Arabidopsis a Oryza: identificação de genes ortólogos, transformação e obtenção de plantas de arroz mais tolerantes à seca. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 119. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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39. | | MENDONÇA, J. A.; RANGEL, P. H. N.; MELO, A. T. O.; MENDES, C. A.; BRONDANI, R. P. V.; HEINEMANN, A. B.; BRONDANI, C. Ampliação da variabilidade genética da coleção nuclear de arroz da Embrapa (CNAE). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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40. | | SILVA, D. R. A.; CASTRO, A. P. de; CORDEIRO, A. C. C.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F. P.; VIANELLO, R. P.; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, C. Cluster de QTL para altura e produtividade mapeado no cromossomo 1 de arroz em múltiplos ambientes. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 13., 2019, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2019. p. 64.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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