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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
Data corrente: |
31/01/2017 |
Data da última atualização: |
05/02/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
ASSIS, M. C. de; MELLO-SILVA, R. de. |
Afiliação: |
MARTA CAMARGO DE ASSIS, CNPMA; RENATO DE MELLO-SILVA, USP. |
Título: |
Alstroemeria (Alstroemeriaceae) in the caatinga of Brazil, with a new species. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Phytotaxa, v. 282, n. 1, p. 19-27, 2016. |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.11646/phytotaxa.282.1.2 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract: Five species of Alstroemeria from caatinga in Brazil are presented. Three of them are endemic to this vegetation, including a new species, A. stramonia, here described. We provide descriptions, illustrations, comments, and a key to the species. |
Palavras-Chave: |
aAlstroemeria; Alstroemeria longistaminea; Alstroemeria monticola; Alstroemeria piauhyensis; Alstroemeria plantaginea; Alstroemeria stramonia; Caatinga endemics. |
Thesagro: |
Caatinga; Taxonomia vegetal. |
Categoria do assunto: |
V Taxonomia de Organismos |
Marc: |
LEADER 01048naa a2200253 a 4500 001 2062290 005 2021-02-05 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.11646/phytotaxa.282.1.2$2DOI 100 1 $aASSIS, M. C. de 245 $aAlstroemeria (Alstroemeriaceae) in the caatinga of Brazil, with a new species.$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aAbstract: Five species of Alstroemeria from caatinga in Brazil are presented. Three of them are endemic to this vegetation, including a new species, A. stramonia, here described. We provide descriptions, illustrations, comments, and a key to the species. 650 $aCaatinga 650 $aTaxonomia vegetal 653 $aaAlstroemeria 653 $aAlstroemeria longistaminea 653 $aAlstroemeria monticola 653 $aAlstroemeria piauhyensis 653 $aAlstroemeria plantaginea 653 $aAlstroemeria stramonia 653 $aCaatinga endemics 700 1 $aMELLO-SILVA, R. de 773 $tPhytotaxa$gv. 282, n. 1, p. 19-27, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
Data corrente: |
21/12/2017 |
Data da última atualização: |
21/12/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
KLUSKA, S.; TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; OLIVERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; PERIPOLLI, E.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; CHIAIA, H. L. J.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A.; MAGNABOSCO, C. de U.; AGUILAR, I.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; BALDI REY, F. S. |
Afiliação: |
SABRINA KLUSKA, FAPESP; RAFAEL LARA TONUSSI, UNESP; RAFAEL MEDEIROS DE OLIVEIRA SILVA, UNIVERSITY OF GEORGIA; BIANCA FERREIRA OLIVIERI, UNESP; FABIELI LOISE BRAGA FEITOSA, UNESP; ELISA PERIPOLLI, UNESP; MARCOS VINICÍUS ANTUNES LEMOS, UNESP; MARIANA PIATTO BERTON, UNESP; HERMENEGILDO LUCAS JUSTINO CHIAIA, UNESP; ANGELICA SIMONE CRAVO PEREIRA, USP; RAYSILDO BARBOSA LÔBO, ANCP; LUIZ ANTÔNIO BEZERRA, USP; CLAUDIO DE ULHOA MAGNABOSCO, CPAC; IGNÁCIO AGUILAR, INIA; FERNANDO DI CROCE, ZOETIS; JASON OSTERSTOCK, ZOETIS; FERNANDO BALDI, UNESP. |
Título: |
Caracterização do desequilíbrio de ligação em uma população de bovinos da raça Nelore. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto, SP. Fenômica e outras ômicas na produção animal: anais... Sertãozinho: Sociedade de Melhoramento Animal/Instituto de Zootecnia, 2017. SBMA 2017. |
Páginas: |
3 p. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Resumo: Tendo em vista a importância da estimação do desequilíbrio de ligação para a seleção genômica, o objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação de uma população de bovinos da raça Nelore participantes do programa de melhoramento da ANCP. Foram utilizadas informações de 9.459 animais genotipados com um painel de alta densidade, totalizando 735.044 SNP?s, antes do controle de qualidade. A estimação do desequilíbrio de ligação foi realizada através do programa SNP1101. Os valores de LD observados para os cromossomos autossômicos variaram de 0,18 a 0,25. Para marcadores distanciados até 1 Kb a média de r² foi de 0,53 e para marcadores distanciados entre 90 e 100 Kb 0,14. Para MAF a média variou de 0,23 a 0,25, considerando MAF mínimo de 5%. Os resultados obtidos neste estudo indicam que, a densidade de marcadores utilizados foi capaz de detectar altos níveis de LD. Adicionalmente, conclui-se que marcadores distanciados até 50 Kb ainda detectam consideráveis níveis de LD. Abstract: Considering the importance of estimating linkage disequilibrium for genomic selection, the objective of this study was to estimate the linkage disequilibrium in a population of Nellore cattle participating in the ANCP breeding program. Information from 9,396 genotyped animals with a high density panel, totaling 735,044 SNP's before quality control were used. The estimation of linkage dissequilibrium (LD) was performed using the SNP1101 program. The mean LD values observed for the autosomal chromosomes ranged from 0.18 to 0.25. For markers distanced lower than 1 Kb the r² mean was 0.53, and for markers distanced between 90 and 100 Kb was 0.14. For MAF, the mean ranged from 0.23 to 0.25, a minimum MAF of 0.05 was considered. The results obtained in this study indicated that the density of markers used was able to detect high levels of LD. Additionally, for markers distanced up to 50 Kb, considerable levels of LD was detected. MenosResumo: Tendo em vista a importância da estimação do desequilíbrio de ligação para a seleção genômica, o objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação de uma população de bovinos da raça Nelore participantes do programa de melhoramento da ANCP. Foram utilizadas informações de 9.459 animais genotipados com um painel de alta densidade, totalizando 735.044 SNP?s, antes do controle de qualidade. A estimação do desequilíbrio de ligação foi realizada através do programa SNP1101. Os valores de LD observados para os cromossomos autossômicos variaram de 0,18 a 0,25. Para marcadores distanciados até 1 Kb a média de r² foi de 0,53 e para marcadores distanciados entre 90 e 100 Kb 0,14. Para MAF a média variou de 0,23 a 0,25, considerando MAF mínimo de 5%. Os resultados obtidos neste estudo indicam que, a densidade de marcadores utilizados foi capaz de detectar altos níveis de LD. Adicionalmente, conclui-se que marcadores distanciados até 50 Kb ainda detectam consideráveis níveis de LD. Abstract: Considering the importance of estimating linkage disequilibrium for genomic selection, the objective of this study was to estimate the linkage disequilibrium in a population of Nellore cattle participating in the ANCP breeding program. Information from 9,396 genotyped animals with a high density panel, totaling 735,044 SNP's before quality control were used. The estimation of linkage dissequilibrium (LD) was performed using the SNP1101 program. The mean LD values observed for the ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Densidade de Marcadores. |
Thesagro: |
Cromossoma; Marcador Genético; Seleção Genótipa. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/169674/1/Caracterizacao-do-desequilibrio-de-ligacao-em-uma-populacao-de-bovinos-da-raca-Nelore.pdf
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Marc: |
LEADER 03200nam a2200361 a 4500 001 2083353 005 2017-12-21 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aKLUSKA, S. 245 $aCaracterização do desequilíbrio de ligação em uma população de bovinos da raça Nelore.$h[electronic resource] 260 $aIn: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto, SP. Fenômica e outras ômicas na produção animal: anais... Sertãozinho: Sociedade de Melhoramento Animal/Instituto de Zootecnia, 2017. SBMA 2017.$c2017 300 $a3 p. 520 $aResumo: Tendo em vista a importância da estimação do desequilíbrio de ligação para a seleção genômica, o objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação de uma população de bovinos da raça Nelore participantes do programa de melhoramento da ANCP. Foram utilizadas informações de 9.459 animais genotipados com um painel de alta densidade, totalizando 735.044 SNP?s, antes do controle de qualidade. A estimação do desequilíbrio de ligação foi realizada através do programa SNP1101. Os valores de LD observados para os cromossomos autossômicos variaram de 0,18 a 0,25. Para marcadores distanciados até 1 Kb a média de r² foi de 0,53 e para marcadores distanciados entre 90 e 100 Kb 0,14. Para MAF a média variou de 0,23 a 0,25, considerando MAF mínimo de 5%. Os resultados obtidos neste estudo indicam que, a densidade de marcadores utilizados foi capaz de detectar altos níveis de LD. Adicionalmente, conclui-se que marcadores distanciados até 50 Kb ainda detectam consideráveis níveis de LD. Abstract: Considering the importance of estimating linkage disequilibrium for genomic selection, the objective of this study was to estimate the linkage disequilibrium in a population of Nellore cattle participating in the ANCP breeding program. Information from 9,396 genotyped animals with a high density panel, totaling 735,044 SNP's before quality control were used. The estimation of linkage dissequilibrium (LD) was performed using the SNP1101 program. The mean LD values observed for the autosomal chromosomes ranged from 0.18 to 0.25. For markers distanced lower than 1 Kb the r² mean was 0.53, and for markers distanced between 90 and 100 Kb was 0.14. For MAF, the mean ranged from 0.23 to 0.25, a minimum MAF of 0.05 was considered. The results obtained in this study indicated that the density of markers used was able to detect high levels of LD. Additionally, for markers distanced up to 50 Kb, considerable levels of LD was detected. 650 $aCromossoma 650 $aMarcador Genético 650 $aSeleção Genótipa 653 $aDensidade de Marcadores 700 1 $aTONUSSI, R. L. 700 1 $aSILVA, R. M. de O. 700 1 $aOLIVERI, B. F. 700 1 $aFEITOSA, F. L. B. 700 1 $aPERIPOLLI, E. 700 1 $aLEMOS, M. V. A. 700 1 $aBERTON, M. P. 700 1 $aCHIAIA, H. L. J. 700 1 $aPEREIRA, A. S. C. 700 1 $aLOBO, R. B. 700 1 $aBEZERRA, L. A. 700 1 $aMAGNABOSCO, C. de U. 700 1 $aAGUILAR, I. 700 1 $aDI CROCE, F. 700 1 $aOSTERSTOCK, J. 700 1 $aBALDI REY, F. S.
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