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Biblioteca(s):  Embrapa Meio Ambiente.
Data corrente:  22/04/2020
Data da última atualização:  22/04/2020
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ROSSMANN, M; PÉREZ-JARAMILLO, J. E.; KAVAMURA, V. N.; CHIARAMONTE, J. B.; DUMACK, K.; FIORE-DONNO, A. M.; MENDES, L. W.; FERREIRA, M. M. C.; BONKOWSKI, M.; RAAIJMAKERS, J. M.; MAUCHLINE, T. H.; MENDES, R.
Afiliação:  MIKE ROSSMANN; JUAN ESTEBAN PÉREZ-JARAMILLO, Netherlands Institute of Ecology; VANESSA NESSNER KAVAMURA, Sustainable Agriculture Sciences; JOSIANE BARROS CHIARAMONTE; KENNETH DUMACK, University of Cologne; ANA MARIA FIORE-DONNO, University of Cologne; KUCAS WILLIAM MENDES, CENA-USP; MÁRCIA MIGUEL CASTRO FERREIRA, IQ-UNICAMP; MICHAEL BONKOWSKI, University of Cologne; JOS M RAAIJMAKERS, Netherlands Institute of Ecology; TIM H MAUCHLINE, Rothamsted Research; RODRIGO MENDES, CNPMA.
Título:  Multitrophic interactions in the rhizosphere microbiome of wheat: from bacteria and fungi to protists.
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  FEMS Microbiology Ecology, v. 96, n. 4, 2020. Article fiaa032.
DOI:  https://doi.org/10.1093/femsec/fiaa032
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Plants modulate the soil microbiota by root exudation assembling a complex rhizosphere microbiome with organisms spanning different trophic levels. Here, we assessed the diversity of bacterial, fungal and cercozoan communities in landraces and modern varieties of wheat. The dominant taxa within each group were the bacterial phyla Proteobacteria, Actinobacteria and Acidobacteria; the fungi phyla Ascomycota, Chytridiomycota and Basidiomycota; and the Cercozoa classes Sarcomonadea, Thecofilosea and Imbricatea. We showed that microbial networks of the wheat landraces formed a more intricate network topology than that of modern wheat cultivars, suggesting that breeding selection resulted in a reduced ability to recruit specific microbes in the rhizosphere. The high connectedness of certain cercozoan taxa to bacteria and fungi indicated trophic network hierarchies where certain predators gain predominance over others. Positive correlations between protists and bacteria in landraces were preserved as a subset in cultivars as was the case for the Sarcomonadea class with Actinobacteria. The correlations between the microbiome structure and plant genotype observed in our results suggest the importance of top-down control by organisms of higher trophic levels as a key factor for understanding the drivers of microbiome community assembly in the rhizosphere.
Palavras-Chave:  Interações planta-microbioma; ITS amplicon sequencing; Plant-microbiome interactions.
Thesagro:  Rizosfera.
Thesaurus Nal:  Microbiome; Rhizosphere.
Categoria do assunto:  S Ciências Biológicas
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Meio Ambiente (CNPMA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPMA16759 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoKAVAMURA, V. N.; MENDES, R.; BARGAZ, A.; MAUCHLINE, T. H. Defining the wheat microbiome: towards microbiome-facilitated crop production. Computational and Structural Biotechnology Journal, v. 19, p. 1200-1213, 2021.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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2.Imagem marcado/desmarcadoTAKETANI, R. G.; MOITINHO, M. A.; MAUCHLINE, T.; MELO, I. S. de. Co-occurrence patterns of litter decomposing communities in mangroves indicate a robust community resistant to disturbances. PeerJ, v. 6, 2018. Article e5710.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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3.Imagem marcado/desmarcadoKAVAMURA, V.; HIRSCH, P. R.; CLARK, I.; ROSSMANN, M.; MENDES, R.; MAUCHLINE, T. Impact of long-term fertilisation regimes on wheat rhizosphere bacterial communities and 16S rRNA gene-predicted functions related to nitrogen and phosphorus metabolism in soils. In: SYMPOSIUM ON BACTERIAL GENETICS AND ECOLOGY, 14., 2017, Aberdeen. Annals... Aberdeen: BAGECO, 2017. p. 121.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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4.Imagem marcado/desmarcadoKAVAMURA, V. N.; CLARK, I. M.; MELO, I. S. de; MAUCHLINE, T. H. Insights into the rhizosphere microbiome: past and future perspectives In: PLANT MICROBIOME SYMPOSIUM, 3., 2022, Dundee. Abstracts... Dundee, Scotland: 2022. Ref. S1.K2.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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5.Imagem marcado/desmarcadoKAVAMURA, V. N.; HAYAT, R.; CLARK, I. M.; ROSSMANN, M.; MENDES, R.; HIRSCH, P. R.; MAUCHLINE, T. H. Inorganic nitrogen application affects both taxonomical and predicted functional structure of wheat rhizosphere bacterial communities. Frontiers in Microbiology, Lausanne, v. 9, 2018. Article 1074. 15 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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6.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, L. S. A. S.; FARIA, M. R. de; CHIARAMONTE, J. B.; MAUCHLINE, T. H.; BETTIOL, W.; MENDES, R. Rhizobacterial community dynamics of resistant and susceptible wheat genotypes in the presence of the pathogen Fusarium graminearum. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2019, Recife. Os avanços da fitopatologia na era genômica: anais. Recife: SBF, UFRPE, 2019. p. 147.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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7.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, L. S. A. S.; FARIA, M. R. de; CHIARAMONTE, J. B.; MAUCHLINE, T. H.; BETTIOL, W.; MENDES, R. Wheat rhizosphere bacterial communities and protection against root rot caused by Bipolaris sorokiniana. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2019, Recife. Os avanços da fitopatologia na era genômica: anais. Recife: SBF, UFRPE, 2019. p. 148.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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8.Imagem marcado/desmarcadoKAVAMURA, V. N.; ROBINSON, R. J.; HAYAT, R.; CLARK, I. M.; HUGHES, D.; ROSSMANN, M.; HIRSCH, P. R.; MENDES, R.; MAUCHLINE, T. H. Land management and microbial seed load effect on rhizosphere and endosphere bacterial community assembly in wheat. Frontiers in Microbiology, Lausanne, v. 10, 2019. Article 2625.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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9.Imagem marcado/desmarcadoKAVAMURA, V. N.; CLARK, I.; HIRSCH, P. R.; CAULFIELD, J.; SARRIA, A. F.; ROSSMANN, M.; BIRKETT, M.; MELO, I. S. de; MENDES, R.; MAUCHLINE, T. Wheat breeding influences root traits and selection of bacterial communities in the rhizosphere. In: PLANT MICROBIOME SYMPOSIUM, 2., 2018, Amsterdam. [Abstracts...] Amsterdam: Netherlands Institute of Ecology (NIOO-KNAW), 2018.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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10.Imagem marcado/desmarcadoKAVAMURA, V. N.; CLARK, I.; HIRSCH, P. R.; SARRIA, A. F.; MELO, I. S. de; ROSSMANN, M.; MENDES, R.; BIRKETT, M.; MAUCHLINE, T. Wheat breeding and its impact on root exudates and rhizosphere bacterial communities. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MICROBIAL ECOLOGY, 16., 2016, Montreal. Proceedings... Wageningen: The International Society for Microbial Ecology (ISME), 2016. p. 1063.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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11.Imagem marcado/desmarcadoKAVAMURA, V. N.; ROBINSON, R. J.; HUGHES, D.; CLARK, I. M.; ROSSMANN, M.; MELO, I. S. de; HIRSCH, P. R.; MENDES, R.; MAUCHLINE, T. H. Wheat dwarfing influences selection of the rhizosphere microbiome. Scientific Reports, v. 10, Article 1452, 2020.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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12.Imagem marcado/desmarcadoROSSMANN, M.; PÉREZ-JARAMILLO, J. E.; CHIARAMONTE, J. B.; KAVAMURA, V. N.; DUMACK, K.; FIORE-DONNO, A. M.; MENDES, L. W.; BONKOWSKI, M.; MAUCHLINE, T.; RAAIJMAKERS, J. M.; MENDES, R. Back to the roots: revealing beneficial interactions between the rhizosphere microbiome and wild wheat. In: PLANT MICROBIOME SYMPOSIUM, 2., 2018, Amsterdam. [Abstracts...] Amsterdam: Netherlands Institute of Ecology (NIOO-KNAW), 2018. Ref. P56.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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13.Imagem marcado/desmarcadoROSSMANN, M; PÉREZ-JARAMILLO, J. E.; KAVAMURA, V. N.; CHIARAMONTE, J. B.; DUMACK, K.; FIORE-DONNO, A. M.; MENDES, L. W.; FERREIRA, M. M. C.; BONKOWSKI, M.; RAAIJMAKERS, J. M.; MAUCHLINE, T. H.; MENDES, R. Multitrophic interactions in the rhizosphere microbiome of wheat: from bacteria and fungi to protists. FEMS Microbiology Ecology, v. 96, n. 4, 2020. Article fiaa032.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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14.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, L. S. A. S.; FARIA, M. R. de; CHIARAMONTE, J. B.; MENDES, L. W.; SEPO, E.; HOLLANDER, M. de; FERNANDES, J. M. C.; CARRIÓN, V. J.; BETTIOL, W.; MAUCHLINE, T. H.; RAAIJMAKERS, J. M.; MENDES, R. Repeated exposure of wheat to the fungal root pathogen Bipolaris sorokiniana modulates rhizosphere microbiome assembly and disease suppressiveness. Environmental Microbiome, v. 18, n. 1, p., 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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