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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
20/07/2011 |
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Data da última atualização: |
27/06/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARAZZOLLE, M. F.; RABELLO, F. R.; MARTINS, N. F.; SOUZA, A. A. de; AMARAL, A. M. do; FREITAS-ASTUA, J.; PEREIRA, G. A. G.; MACHADO, M. A.; MEHTA, A. |
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Afiliação: |
Marcelo Falsarella Carazzolle, UNICAMP; Fernanda Rodrigues Rabello, UnB; NATALIA FLORENCIO MARTINS, CENARGEN; Alessandra A. de Souza, APTA; Alexandre M. do Amaral, APTA; JULIANA DE FREITAS ASTUA, CNPMF; Gonçalo A. G. Pereira, UNICAMP; Marcos A. Machado, APTA; ANGELA MEHTA DOS REIS, CENARGEN. |
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Título: |
Identification of defence-related genes expressed in coffee and citrus during infection by Xylella fastidiosa. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
European Journal of Plant Pathology , v. 130, n. 4, p. 529-540, 2011. |
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DOI: |
10.1007/s10658-011-9775-5 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
One of the phytosanitary problems of coffee cultivation in Brazil is Coffee Leaf Scorch (CLS) disease, caused by the phytopathogenic bacterium Xylella fastidiosa. Due to the economic importance of coffee to Brazil and the losses caused by X. fastidiosa, a cDNA library (RX1) was constructed using infected coffee stems. This library is one of the 37 coffee EST libraries constructed using different organs and tissues and biological conditions (Coffee Genome Project-CafEST). The objective of this study was to identify genes potentially involved in defence processes in response to X. fastidiosa infection by in silico analysis of the transcripts from the RX1 library as well as compare the coffee ESTs to citrus Xylella-infected ESTs. Clustering analysis of the RX1 library grouped a total of 7,501 sequences into 3,248 contigs, 19 of which were not found in the other 36 libraries. Additionally, 119 contigs were considered differentially expressed in comparison with the other libraries and according to statistical criteria. The global analysis of these contigs showed several genes involved in dehydration and photosynthesis. A total of 2,235 singlets were also obtained in the RX1 library and several of these genes are classically involved in defence processes. The comparison to a Xylella-infected citrus EST library revealed several genes similarly modulated in both species, indicating common defence mechanisms in both host plants in response to X. fastidiosa. The results obtained showed that water deprivation and response to osmotic and oxidative stress were expressed in a similar way in both coffee and citrus libraries. This is the first study to propose a common mechanism shared by citrus and coffee plants in response to the same pathogen. MenosOne of the phytosanitary problems of coffee cultivation in Brazil is Coffee Leaf Scorch (CLS) disease, caused by the phytopathogenic bacterium Xylella fastidiosa. Due to the economic importance of coffee to Brazil and the losses caused by X. fastidiosa, a cDNA library (RX1) was constructed using infected coffee stems. This library is one of the 37 coffee EST libraries constructed using different organs and tissues and biological conditions (Coffee Genome Project-CafEST). The objective of this study was to identify genes potentially involved in defence processes in response to X. fastidiosa infection by in silico analysis of the transcripts from the RX1 library as well as compare the coffee ESTs to citrus Xylella-infected ESTs. Clustering analysis of the RX1 library grouped a total of 7,501 sequences into 3,248 contigs, 19 of which were not found in the other 36 libraries. Additionally, 119 contigs were considered differentially expressed in comparison with the other libraries and according to statistical criteria. The global analysis of these contigs showed several genes involved in dehydration and photosynthesis. A total of 2,235 singlets were also obtained in the RX1 library and several of these genes are classically involved in defence processes. The comparison to a Xylella-infected citrus EST library revealed several genes similarly modulated in both species, indicating common defence mechanisms in both host plants in response to X. fastidiosa. The results obtained showe... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Plant disease. |
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Thesagro: |
Doença de Planta; Xylella Fastidiosa. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/38084/1/id27798.pdf
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Marc: |
LEADER 02587naa a2200265 a 4500
001 1901587
005 2024-06-27
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520 $aOne of the phytosanitary problems of coffee cultivation in Brazil is Coffee Leaf Scorch (CLS) disease, caused by the phytopathogenic bacterium Xylella fastidiosa. Due to the economic importance of coffee to Brazil and the losses caused by X. fastidiosa, a cDNA library (RX1) was constructed using infected coffee stems. This library is one of the 37 coffee EST libraries constructed using different organs and tissues and biological conditions (Coffee Genome Project-CafEST). The objective of this study was to identify genes potentially involved in defence processes in response to X. fastidiosa infection by in silico analysis of the transcripts from the RX1 library as well as compare the coffee ESTs to citrus Xylella-infected ESTs. Clustering analysis of the RX1 library grouped a total of 7,501 sequences into 3,248 contigs, 19 of which were not found in the other 36 libraries. Additionally, 119 contigs were considered differentially expressed in comparison with the other libraries and according to statistical criteria. The global analysis of these contigs showed several genes involved in dehydration and photosynthesis. A total of 2,235 singlets were also obtained in the RX1 library and several of these genes are classically involved in defence processes. The comparison to a Xylella-infected citrus EST library revealed several genes similarly modulated in both species, indicating common defence mechanisms in both host plants in response to X. fastidiosa. The results obtained showed that water deprivation and response to osmotic and oxidative stress were expressed in a similar way in both coffee and citrus libraries. This is the first study to propose a common mechanism shared by citrus and coffee plants in response to the same pathogen.
650 $aDoença de Planta
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| Registros recuperados : 190 | |
| 161. |  | FARIAS, L. R.; SCHIMMELPFENG, P. H. C.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MARTINS, N. F.; BORGES, M.; MORAES, M. C. B.; LAUMANN, R. A.; BÁO, S. N.; PAULA, D. P. Transcriptome-based identification of highly similar odorant-binding proteins among neotropical stink bugs and their egg parasitoid. Plos One, jul., 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 162. | | MILLER, R. N. G.; BERTIOLI, D. J.; BAURENS, F. C.; QUIRINO, B. F.; CIAMPI, A. Y.; SANTOS, C. M. R.; MARTINS, N. F.; SOUZA JUNIOR, M. T.; PAPPAS JUNIOR, G. J. Understanding plant responses to biotic stress: ongoing research in Musa. Acta Horticulturae, Leuven, n. 828, p. 255-271, 2009. Edição de Proceedings of the International Symposium on Recent Advances in Banana Crop Protection for Sustainable Production and Improved Livelihoods , White River, South Africa, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 163. | | CASTRO, C. S. P. de; FRAZÃO, H. da S.; COUTINHO, M. V.; MARTINS, N. F.; AMARAL, Z. P. de S.; SANTANA, E. de F.; LIMA, L. H. C.; PASSOS, E. M.; DIAS, J. M. C. de. O processo de acreditação da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia nas normas NBR ISO/IEC 17.025 e boas práticas de laboratório. In: CONGRESSO DA ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DAS INSTITUIÇÕES DE PESQUISA TECNOLÓGICA, 2008, Campina Grande. Os desníveis regionais e a inovação no Brasil: os desafios para as instituições de pesquisa tecnológica: resumos. Brasília, DF: ABIPTI, 2008. p. 74| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 164. | | CASTRO, C. S. P. de; FRAZÃO, H. da S.; COUTINHO, M. V.; MARTINS, N. F.; AMARAL, Z. P. de S.; SANTANA, E. de F.; LIMA, L. H. C.; PASSOS, E. M.; DIAS, J. M. C. de. O processo de acreditação da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia nas normas NBR ISO/IEC 17.025 e boas práticas de laboratório. In: CONGRESSO DA ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DAS INSTITUIÇÕES DE PESQUISA TECNOLÓGICA, 2008, Campina Grande. Os desníveis regionais e a inovação no Brasil: os desafios para as instituições de pesquisa tecnológica. Brasília, DF: ABIPTI, 2008. 1 CD-ROM. ABIPTI.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 165. | | CASTRO, C. S. P de; FRAZÃO, H. da S.; COUTINHO, M. V.; MARTINS, N. F.; AMARAL, Z. P. de S.; SANTANA, E. de F.; LIMA, L. H. C.; PASSOS, E. M.; DIAS, J. M. C. de S. O Processo de Acreditação da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia nas Normas NBR ISO/IEC 17.025 e Boas Práticas de Laboratório. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 13 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Circular Técnica, 79).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 166. | | CASTRO, C. S. P. de; AMARAL, Z. P. de S.; SANTANA, E. de F.; PASSOS, E. M.; FRAZÃO, H. da S.; LIMA, L. H. C.; COUTINHO, M. V.; MARTINS, N. F. Procedimento Gerencial de Gestão de Equipamentos e Instrumentos de Medição. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 20 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Série, 275).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 167. | | CASTRO, C. S. P. de; FRAZÃO, H. da S.; COUTINHO, M. V.; MARTINS, N. F.; SANTANA, E. de F.; AMARAL, Z. P. de S.; DIAS, J. M. C. de S. Implantação das normas BPL e NBR ISO/IEC 17.025 na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. 8 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Circular técnica, 52).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 168. | | CASTRO, C. S. P. de; FRAZÃO, H. da S.; COUTINHO, M. V.; MARTINS, N. F.; SANTANA, E. de F.; AMARAL, Z. P. de S.; DIAS, J. M. C. de S. Implantação das normas BPL e NBR ISO/IEC 17.025 na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE METROLOGIA, 5., 2007, Curitiba. Programa completo e caderno de resumos. Curitiba: Rede Paraense de Metrologia e Ensaiso, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 169. | | PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. O. de; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C. de; AZEVEDO, V. C. R.; BRASILEIRO, A. C. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MILLER, R. T N. G. Analysis of the leaf transcriptome of Musa acuminata during interaction with Mycosphaerella musicola: gene assembly, annotation and marker development. BMC Genomics, v.14, n.78, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 170. | | BARBOSA, A. E. A. D.; SOUZA, D. S. L.; LIMA, L. M.; FRAGOSO, R. R.; GUIMARÃES, L. M.; VIANA, A. A. B.; OLIVEIRA NETO, O. B.; PAES, N.; CARNEIRO, R.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; SA, M. F. G. de. Análise de genótipos de algodão contrastantes quanto a resistência ao nematóide Meloidogyne incognita. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. p. 282.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 171. | | BARBOSA, A. E. A. D.; FRAGOSO, R. R.; SOUZA, D. S. L.; LIMA, L. M.; GUIMARÃES, L. M.; VIANA, A. A. B.; OLIVEIRA NETO, O. B.; PAES, N. S.; CARNEIRO, R.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; GROSSI-de-SÁ, M. F. Análise de ests de genótipos contrastantes de algodão quanto a resistência ao nematóide Meloidogyne incognita. In : ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 12., 2007, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 51.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 172. | | MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; IMEDIATO, F. L.; CRUZ, V. O.; TEIXEIRA, C. de C.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J. Keynote: understanding plant immunity: transcriptome profiling in Musa-pathogen interactions using next generation sequencing. In: PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: abstracts. [Montepellier.]: [Bioversity International, 2011. p. 116-117.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 173. | | LEITE, E. L. L.; SOUZA, A. S. DE Q.; RIBEIRO, P. R. V.; PEREIRA, R. de C. A.; MARTINS, N. F.; FERREIRA, M. K. A.; MENEZES, J. E. S. A. DE; SANTOS, H. S. DOS; PESSOA, O. D. L.; CANUTO, K. M. Molecular Docking and GC/MS-Based Approach for Identification of Anxiolytic Alkaloids from Griffinia (Amaryllidaceae) Species in a Zebrafish Model. Chemistry Biodiversity, 21, e202302122, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 174. | | PAES, N. S.; VIANA, A. A. B.; LIMA, L. M. de; BATISTA, J. A. N.; GUIMARÃES, L. M.; BARBOSA, A. E.; SOUZA, D. dos S. de L. e; OLIVEIRA NETO, O. B.; CARNEIRO, R. M. D. G.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; GROSSI-de-SÁ, M. F. Construção de bibliotecas de ESTs de raiz de algodão (Gossypium hirsutum) resistente e susceptível ao nematóide da galha (Meloidogyne incognita). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 5., 2005, Salvador. Algodão: uma fibra natural: resumos. Salvador: ABAPA, 2005. p. 7. Painel 8.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 175. | | PAES, N. S.; VIANA, A. A. B.; LIMA, L. M.; BATISTA, J. A. N.; GUIMARÃES, L. M.; BARBOSA, A. E. A. D.; SOUZA, D. S. L.; OLIVEIRA NETO, O. B.; CARNEIRO, R. M. D. G.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; GROSSI-de-SÁ, M. F. Construção de bibliotecas de ests de raízes de algodão (Gossypium hirsutum) infectadas com o nematóide de galha de raiz (Meloidogyne incognita). In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 58.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 176. | | MACHADO, A. K.; KING, R.; LEE, W. S.; SPARKS, C.; BROWN, N.; KANYUKA, K.; URBAN, M.; WEST, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; TIBOLA, C. S.; LIMA, M. I. P. M.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N.; ARAGÃO, F.; NICOLLI, C. P.; DEL PONTE, E. M.; TESSMANN, D. J.; FERNANDES, J. M. C.; HAMMOND-KOSACK, K. E. Exploring NGS, HIGS and si-RNA technologies for the control of Fusarium ear blight in wheat. In: BRITISH MYCOLOGICAL SOCIETY AND BRITISH SOCIETY FOR PLANT PATHOLOGY JOINT PRESIDENTIAL MEETING, 2017, Nottingham. Fungal exploitation and fungal control. Nottingham: University of Nottingham: British Society for Plant Pathology: British Mycological Society, 2017. p. 67-68.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 177. | | SOUZA JÚNIOR, M. T.; SANTOS, C. M. R.; MARTINS, N. F.; SILVA, F. R. da; TOGAWA, R. C.; CASSIANO, L. P.; ALMEIDA, E. R. P. de; COELHO, M. C. F.; CAETANO, A. R.; CIAMPI, A. Y.; MOTA, M.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G. DataMusa: banco de dados de genômica de Musa spp. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. 24 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 107).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 178. | | BARBOSA, A. E. A. de D.; FRAGOSO, R. da R.; SOUZA, D. dos S. de L.; FREIRE, E.; OLIVEIRA NETO, O. B. de; VIANA, A. A. B.; TOGAWA, R. C.; GUIMARÃES, L. M.; MARTINS, N. F.; CIA, E.; FERNANDEZ, D.; LIMA, L. M. de; SILVA, M. C. M. da; ROCHA, T. L.; SA, M. F. G. de. Differentially expressed genes in cotton plant genotypes infected with Meloidogyne incognita. Plant Science, v. 177, p. 492-497, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 179. | | BARBOSA, A. E. A. de D.; FRAGOSO, R. da R.; SOUZA, D. dos S. de L.; FREIRE, E.; OLIVEIRA NETO, O. B. de; VIANA, A. A. B.; TOGAWA, R. C.; GUIMARÃES, L. M.; MARTINS, N. F.; CIA, E.; FERNANDEZ, D.; LIMA, L. M. de; SILVA, M. C. M. da; ROCHA, T. L.; SA, M. F. G. de. Differentially expressed genes in cotton plant genotypes infected with Meloidogyne incognita. Plant Science, v. 177, p. 492-497, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 180. | | SOUZA JÚNIOR, M. T.; SANTOS, C. M. R.; MARTINS, N. F.; SILVA, F. R. da; TOGAWA, R. C.; CASSIANO, L. P.; ALMEIDA, E. R. P. de; COELHO, M. C. F.; CAETANO, A. R.; CIAMPI, A. Y.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G. Transcriptoma de Musa acuminata no dataMusa. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. 25p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 109)| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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