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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
11/05/2007 |
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Data da última atualização: |
17/05/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PROITE, K.; LEAL-BERTIOLI, S. C. M.; BERTIOLI, D. J.; MORETZSOHN, M. C.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; GUIMARÃES, P. M. |
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Afiliação: |
KARINA PROITE; SORAYA CRISTINA DE MACEDO LEAL BERTIOLI, EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA; DAVID J. BERTIOLI, UNIVERSIDADE CATÓLICA DE BRASÍLIA; MARCIO DE CARVALHO MORETZSOHN, EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA; FELIPE RODRIGUES DA SILVA, EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA; NATALIA FLORÊNCIO MARTINS, EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA; PATRÍCIA MESSEMBERG GUIMARÃES, EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA. |
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Título: |
ESTs from a wild Arachis species for gene discovery and marker development. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Plant Biology, v. 7, n. 7, online, 2007. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background Due to its origin, peanut has a very narrow genetic background. Wild relatives can be a source of genetic variability for cultivated peanut. In this study, the transcriptome of the wild species Arachis stenosperma accession V10309 was analyzed. Results ESTs were produced from four cDNA libraries of RNAs extracted from leaves and roots of A. stenosperma. Randomly selected cDNA clones were sequenced to generate 8,785 ESTs, of which 6,264 (71.3%) had high quality, with 3,500 clusters: 963 contigs and 2537 singlets. Only 55.9% matched homologous sequences of known genes. ESTs were classified into 23 different categories according to putative protein functions. Numerous sequences related to disease resistance, drought tolerance and human health were identified. Two hundred and six microsatellites were found and markers have been developed for 188 of these. The microsatellite profile was analyzed and compared to other transcribed and genomic sequence data. Conclusion This is, to date, the first report on the analysis of transcriptome of a wild relative of peanut. The ESTs produced in this study are a valuable resource for gene discovery, the characterization of new wild alleles, and for marker development. The ESTs were released in the [GenBank:EH041934 to EH048197]. |
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Palavras-Chave: |
Amendoim silvestre; Arachis stenosperma; ESTs. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/178139/1/ID-28040-1.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| Registros recuperados : 189 | |
| 122. |  | PINHEIRO, M. P. N.; BATISTA, V. G. L.; MARTINS, N. F.; MELO FILHO, P. de A.; SANTOS, R. C. dos; LIMA, L. M. de. Prospecção de genes regulatórios e estruturais expressos em botão floral do algodoeiro (Gossypium hirsutum). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 41| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 123. | | PINHEIRO, M. P. N.; BATISTA, V. G. L.; MARTINS, N. F.; MELO FILHO, P. de A.; SANTOS, R. C. dos; LIMA, L. M. de. Prospecção de genes regulatórios e estruturais expressos em botão floral do algodoeiro (Gossypium hirsutum). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 41| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 126. | | SILVA, S. A.; SANCHES, S. C. C.; RIBEIRO-COSTA, R. M.; SANTOS, A. C.; MARTINS, N. M.; TAVARES, E. J. M.; SILVA-JUNIOR, J. O. C.; VASCONCELOS, F. Preliminary toxicological assessment of the copolymer chondroitin sulfate-co-N-isopropylacrylamideas drugs carrier. Applied Research in Toxicolgy, v. 1, p. 189, 2015. Suppl. 1. Abstracts of Congress of Toxicology in Developing Countries, 9.; Congresso Brasileiro de Toxicologia, 19., 2015, Natal.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 127. | | LIMA, J. D.; MAIGRET, B.; FERNANDEZ, D.; DECLOQUEMENT, J.; PINHO, D.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; RODRIGUES, M. O.; MARTINS, N. F. Searching in silico novel targets for specific coffee rust disease control. Lecture Notes in Computer Science, 11347 LNBI, p. 109-115, 2020. Including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 128. | | ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, M. S.; TEIXEIRA, C. C.; MARTINS, N. F.; CAMPOS, M. A.; GROSSI DE SÁ, M. F. Seqüências de genes de resistência da classe 1 e 2 de Coffea arabica relacionadas ao banco brasileiro de ESTs de café. In: WORKSHOP INTERAÇÃO MOLECULAR PLANTA-PRAGAS, 2., 2007, Brasília, DF. II Workshop Interação Molecular Planta-Praga. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 130-133. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 229).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 129. | | SANTOS, C. M. R.; FERREIRA, C. F.; CASSIANO, L. P.; COELHO, M. C. F.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; SOUZA JUNIOR, M. T. Transcriptome analysis of leaves and roots of Musa balbisiana var. 'Pisang Klutuk Wulung'. Tree and Forestry Science and Biotechnology, v. 4, special issue 1, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 130. | | SANTOS, C. M. R.; FERREIRA, C. F.; CASSIANO, L. P.; COELHO, M. C. F.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; SOUZA JUNIOR, M. T. Transcriptome analysis of leaves and roots of Musa balbisiana var. 'Pisang Klutuk Wulung'. Tree and Forestry Science and Biotechnology, v. 4, special issue 1, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 131. | | SANTOS, C. M. R.; MARTINS, N. F.; ARAÚJO, M. M. M. de; SILVA, F. R. da; TOGAWA, R. C.; SOUZA JUNIOR, M. T. Screening of the DATA Musa database for orthologs of genes known to be related to biotic and abiotic stresses to identify and characterise candidate genes. Acta Horticulturae, Leuven, n. 828, p. 341-351, 2009. Edição de Proceedings of the International Symposium on Recent Advances in Banana Crop Protection for Sustainable Production and Improved Livelihoods , White River, South Africa, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 132. | | LEITE, R. C.; PELLEGRIN, A. O.; MARTINS, N. E.; SILVA, N.; GOMES, L. I.; COSTA, G. M.; REINATO, A. P. R.; GUIMARAES, P. H. S.; LAGE, A. P. Tricomonose bovina: diagnostico realizados na Escola de Veterinaria da UFMG no periodo de 1979 a 1995. Revista Brasileira de Reproducao Animal, v.21, n.2, p.166-168, 1997. Anais do 12 Congresso Brasileiro de Reproducao Animal.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 133. | | PELLEGRIN, A. O.; MARTINS, N. E.; LAGE, A. P.; COSTA, G. M. da; GOMES, L. I.; REINATO, A. P. R.; LEITE, R. C. Tricomonose bovina no Estado de Minas Gerais: ocorrencia e tratamento. Revista Brasileira de Medicina Veterinaria, Rio de Janeiro, v.20, n.6, p.244-248, nov./dez., 1998.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 134. | | CASTRO, C. S. P. de; FRAZÃO, H. da S.; COUTINHO, M. V.; MARTINS, N. F.; SANTANA, E. de F.; AMARAL, Z. P. de S.; LIMA, L. H. C.; DIAS, J. M. C. de. Os 20 passos para a implantação do sistema da qualidade na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. In: ENQUALAB - CONGRESSO E FEIRA DA QUALIDADE EM METROLOGIA, 2008, São Paulo, SP. [Anais...]. São Paulo: Rede Metrológica do Estado de São Paulo, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 135. | | CASTRO, C. S. P. de; FRAZÃO, H. da S.; COUTINHO, M. V.; MARTINS, N. F.; SANTANA, E. de F.; AMARAL, Z. P. de S.; LIMA, L. H. C.; DIAS, J. M. C. de S. Os 20 passos para a implantação do Sistema da Qualidade na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 5 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Circular Técnica, 81).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 136. | | RABELO, F. R.; CARAZZOLLE, M. F.; MARTINS, N. F.; CAMPOS, M. A.; SILVA, M. S.; SILVA, A. C.; SOUZA, A. A. de; AMARAL, A. M. do; REIS, A. M. dos. Análise in silico de aquaporinas potencialmente envolvidas com o estresse hídrico nas interações café- e citros-Xylella fastidiosa. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 137. | | BARBOSA, A. E. A. D.; LIMA, L. M.; FRAGOSO, R. R.; GUIMARÃES, L. M.; SOUZA, D. S. L.; OLIVEIRA NETO, O. B.; PAES, N.; CARNEIRO, R.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; GROSSI-DE-SÁ, M. F. Análise de ESTs de raízes de genótipos de algodão contrastantes com resistência e susceptibilidade ao nematóide Meloidogyne incognita. In: WORKSHOP INTERAÇÃO MOLECULAR PLANTA-PRAGA, 2., 2007, Brasília. Anais... Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 140-143.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 138. | | BARBOSA, A. E. A. D.; LIMA, L. M. de; FRAGOSO, R. da R.; GUIMARÃES, L. M.; SOUZA, D. S. L.; OLIVEIRA NETO, O. B.; PAES, N. CARNEIRO, R.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; SA, M. F. G. de. Análise de ESTs de raízes de genótipos de algodão contrastantes com resistência e susceptibilidade ao nematóide Meloidogyne incognita. In: WORKSHOP INTERAÇÃO MOLECULAR PLANTA-PRAGAS, 2., 2007, Brasília, DF. II Workshop Interação Molecular Planta-Praga. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 140-143. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 229).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 139. | | SANTOS, C. M.; MARTINS, N. F.; HORBERG, H. M.; ALMEIDA, E. R. de; COELHO, M. C.; ROGAWA, R. C.; SILVA, F. R. da; MILLER, R. N.; SOUZA JUNIOR, M. T. Analysis of expressed sequence tags from Musa acuminata ssp. burmannicoides, var. Calcutta 4 (AA) leaves submitted to temperature stresses. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 110, n. 8, p. 1517-1522, May 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 140. | | MILLER, R. N. G.; BERTIOLI, D. J.; BAURENS, F. C.; SANTOS, C. M. R.; ALVES, P. C.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J. Analysis of non-TIR NBS-LRR resistance gene analogs in Musa acuminata Colla: isolation, RFLP marker development, and physical mapping. BMC Plant Biology, v.8, p.15, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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