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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
19/10/2010 |
Data da última atualização: |
25/07/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
KULCHESKI, F. R.; MARCELINO-GUIMARAES, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; MARGIS, R. |
Afiliação: |
FRANCELI RODRIGUES KULCHESKI, UFRGS; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; ROGÉRIO MARGIS, UFRGS. |
Título: |
The use of microRNAs as reference genes for quantitative polymerase chain reaction in soybean. |
Ano de publicação: |
2010 |
Fonte/Imprenta: |
Analytical Biochemistry, Amsterdam, v. 406, n. 2, p. 185-192, nov. 2010. |
DOI: |
10.1016/j.ab.2010.07.020 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) is a robust and widely applied technique used to investigate gene expression. However, for correct analysis and interpretation of results, the choice of a suitable gene to use as an internal control is a crucial factor. These genes, such as housekeeping genes, should have a constant expression level in different tissues and across different conditions. The advances in genome sequencing have provided high-throughput gene expression analysis and have contributed to the identification of new genes, including microRNAs (miRNAs). The miRNAs are fundamental regulatory genes of eukaryotic genomes, acting on several biological functions. In this study, miRNA expression stability was investigated in different soybean tissues and genotypes as well as after abiotic or biotic stress treatments. The present study represents the first investigation into the suitability of miRNAs as housekeeping genes in plants. The transcript stability of 10 miRNAs was compared to those of six previously reported housekeeping genes for the soybean. In this study, we provide evidence that the expression stabilities of miR156b and miR1520d were the highest across the soybean experiments. Furthermore, these miRNAs genes were more stable than the most commonly protein-coding genes used in soybean gene expression studies involving RT-qPCR. |
Palavras-Chave: |
Reação em cadeia da polimerase. |
Thesagro: |
Gene; RNA; Soja. |
Thesaurus Nal: |
Genes; MicroRNA; Quantitative polymerase chain reaction; Soybeans. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Registros recuperados : 20 | |
5. | | KULCHESKI, F. R.; MARCELINO-GUIMARAES, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; MARGIS, R. The use of microRNAs as reference genes for quantitative polymerase chain reaction in soybean. Analytical Biochemistry, Amsterdam, v. 406, n. 2, p. 185-192, nov. 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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7. | | COSTENARO-DA-SILVA, D.; PASSAIA, G.; HENRIQUES, J. A. P.; MARGIS, R.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F. Identification and expression analysis of genes associated with the early berry development in the seedless grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Sultanine. Plant Science, Limerick, v. 179, n. 5, p. 510-519, nov. 2010. 179 510-519Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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8. | | COSTENARO-DA-SILVA, D.; PASSAIA, G.; HENRIQUES, J. A. P.; MARGIS, R.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F. Identification and expression analysis of genes associated with the early berry development in the seedless grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Sultanine. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 206. Resumo.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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9. | | TURCHETTO ZOLET, A. C.; CRUZ, F.; VENDRAMIN, G. G.; SIMON, M. F.; SALGUEIRO, F.; MARGIS PINHEIRO, M.; MARGIS, R. Large-scale phylogeography of the disjunct Neotropical tree species Schizolobium parahyba (Fabaceae-Caesalpinioideae). Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 65, p. 174-182, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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10. | | BUSS, J. H.; GALLI, V.; LABONDE, J.; MESSIAS, R.; SILVA, S. D. dos A. e; MARGIS, R. Expressão de dgat2 ao longo do desenvolvimento de sementes de tungue (Vernicia fordii). In: SIMPÓSIO ESTADUAL DE AGROENERGIA, 4.; REUNIÃO TÉCNICA DE AGROENERGIA, 4., 2012, AMRIGS: Porto Alegre. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2012. Organizado por Sérgio Delmar dos Anjos e Silva Ivan Rodrigues de Almeida.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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11. | | DIAS, B. F. de O.; SIMÕES-ARAÚJO, J. L.; RUSSO, C. A. M.; MARGIS, R.; ALVES-FERREIRA, M. Unravelling MADS-box gene family in Eucalyptus spp.: A starting point to an understanding of their developmental role in trees. Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 28, n. 3, Suppl., p. 501-510, 2005.Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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12. | | MAGALHÃES JÚNIOR, A. M. de; MARTINS, J. F. da S.; TERRES, A. L.; FAGUNDES, P. R. R.; FRANCO; D. F.; MARGIS, R.; MARGIS, M.; DODE, L. B.; PETERS, J. A. Desenvolvimento de linhagens transgênicas de arroz irrigado( Oryza sativa L.) através da engenharia genética. Pelotas: Embrapa-CPACT, 1999. 4 p. (EMBRAPA- CPACT. Pesquisa em Andamento, 51)Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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13. | | NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; MEYER, L.; BINNECK, E.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; MARGIS, R.; KIDO, E. A.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. A brazilian soybean database. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts book... Ouro Preto: AB3C, 2010. p. 120. X-Meeting 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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14. | | PIROVANI, C. P.; SANTIAGO, A. da S.; SANTOS, L. S. dos; MICHELI, F.; MARGIS, R.; GESTEIRA, A. da S.; ALVIM, F. C.; PEREIRA, G. A. G.; CASCARDO, J. C. de M. Theobroma cacao cystatins impair Moniliophthora perniciosa mycelial growth and are involved in postponing cell death symptoms. Planta, Heidelberg, v. 232, n. 6, p. 1485–1497, 2010. Disponível em: . Acesso em 26 out. 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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15. | | KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERAO, M. P.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. BMC Genomics, v. 12, n. 307, jun. 2011. 17 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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16. | | KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERÃO, M.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 3., 2011, Ilhéus. [Abstracts...]. [Ribeirão Preto]: SBG, 2011. 1 p. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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17. | | WEBER, R. L. M. W.; WIEBKE-STROHM, B.; BREDEMEIER, C.; MARGIS-PINHEIRO, M.; BRITO, G. G. de; RECHENMACHER, C.; BERTAGNOLLI, P. F.; SÁ, M. E. L. de; CAMPOS, M. de A.; AMORIM, R. M. S. de; BENEVENTI, M. A.; MARGIS, R.; GROSSI-DE SA, M. F.; BODANESE-ZANETTINI, M. H. Expression of an osmotin-like protein from Solanum nigrum confers drought tolerance in transgenic soybean. BMC Plant Biology, v. 14:343, 2014. (Open Access).Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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18. | | ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; BARROS, E. G.; GROSSI-DE-SA, M. F.; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; ALMEIDA, J. D.; BENKO-ISEPPON, A. M.; SCHUSTER, I; KIDO, E. A.; LOUREIRO, M. E.; MARGIS, R.; HUNGRIA, M.; MOREIRA, M. A.; BARACAT-PEREIRA, M. C.; FIETTO, L. G.; BODANESE-ZANNETINI, M. H.; ROMANO, E.; ZERBINI, F. M.; LEMOS, E. G. M.; PEREIRA, G. A. G. GENOSOJA: a Brazilian Soybean Genome Consortium. In: THE INTERNATIONAL CONFERENCE ON THE STATUS OF PLANT & ANIMAL GENOME RESEARCH, 17., 2009, San Diego. Final Abstract Guide. [S.l.], 2009. p. 55, P034.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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19. | | ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; BARROS, E. G.; GROSSI DE SA, M. F.; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; ALMEIDA, J. D.; BENKO-ISEPPON, A. M.; SCHUSTER, I; KIDO, E. A.; LOUREIRO, M. E.; MARGIS, R.; HUNGRIA, M.; MOREIRA, M. A.; BARACAT-PEREIRA, M. C.; FIETTO, L. G.; BODANESE-ZANNETINI, M. H.; ROMANO, E.; ZERBINI, F. M.; LEMOS, E. G. M.; PEREIRA, G. A. G. GENOSOJA: a Brazilian soybean genome consortium. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 108, ref. O201. Apresentado também no: In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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20. | | ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; BARROS, E. G. de; SA, M. de F. G. de; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; ALMEIDA, J.; ISEPPON, A. M. B.; SCHUSTER, I.; KIDO, E. A.; LOUREIRO, M. E.; MARGIS, R.; HUNGRIA, M.; MOREIRA, M. A.; BACARAT-PEREIRA, M. C.; FIETTO, L. G.; BODANESE-ZANETTINI, M. H.; ROMANO, E.; ZERBINI, F. M.; LEMOS, E. G. de M.; PEREIRA, G. A. G. GENOSOJA - A brazilian soybean genome consortium. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 108, ref. O201. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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