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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
24/03/2011 |
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Data da última atualização: |
14/10/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
STOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. |
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Afiliação: |
RENATA STOLF-MOREIRA, UNESP Jaboticabal; ELIANA GERTRUDES DE MACEDO LEMOS, UNESP Jaboticabal; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; MAGDA APARECIDA BENEVENTI, UFRGS; AMANDA ALVES PAIVA ROLLA, UEL; SELMA DOS SANTOS PEREIRA, UEL; MARIA CRISTINA NEVES DE OLIVEIRA, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSO. |
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Título: |
Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The objective of this work was to validate, by quantitative PCR in real time (RT-qPCR), genes to be used as reference in studies of gene expression in soybean in drought-stressed trials. Four genes commonly used in soybean were evaluated: GmB-actin, GmGAPDH, GmLectin and GmRNAr18S. Total RNA was extracted from six samples: three from roots in a hydroponic system with different drought intensities (0, 25, 50, 75 and 100 minutes of water stress), and three from leaves of plants grown in sand with different soil moistures (15, 5 and 2.5% gravimetric humidity). The raw cycle threshold (Ct) data were analyzed, and the efficiency of each primer was calculated for an overall analysis of the Ct range among the different samples. The GeNorm application was used to evaluate the best reference gene, according to its stability. The GmGAPDH was the least stable gene, with the highest mean values of expression stability (M), and the most stable genes, with the lowest M values, were the GmB-actin and GmRNAr18S, when both root and leaves samples were tested. These genes can be used in RT-qPCR as reference gene for expression analysis. |
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Palavras-Chave: |
Déficit hídrico; Estabilidade de expressão; Expressão gênica; Expression stability; RT-qPCR. |
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Thesagro: |
Biotecnologia; Deficiência hídrica; Glycine Max; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Agricultural biotechnology; Gene expression; Plant-water relations; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
--
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/31023/1/46n01a08.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/168638/1/Identification-of-reference-genes-for-expression.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| 155. | | COSTA, R. P. S.; DE CARVALHO, K.; RINCÃO, M. P.; NOMURA, R. B. G.; AVELINO, B. B.; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; DE CARVALHO, M. C. C. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Validation of a system for functional gene analysis in P. pachyrhizi by ectopic application of dsRNA. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 156. | | MELLO, F. E. de; LOPES-CAITAR, V. S.; PRUDENTE, H.; XAVIER-VALENCIO, S. A.; SÖREN, F.; ANDREAS, M.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; VERREET, J.-A.; BALBI-PEÑA, M. I.; GODOY, C. V. Sensitivity of Cercospora spp. from soybean to quinone outside inhibitors and methyl benzimidazole carbamate fungicides in Brazil. Tropical Plant Pathology, v. 46, p. 69-80, 2021. Artigo de acesso aberto.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 157. | | HISHINUMA-SILVA, S. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; NOMURA, R. B. G.; SERCERO, B. C.; SILVA, A. G. da; CARVALHO, M. C. da C. G. de; LOPES, I. de O. N.; DIAS, W. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. The soybean gene GmHsp22.4 is involved in the resistance response to Meloidogyne javanica in Arabidopsis thaliana. BMC plant biology, v. 20, p. 535, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 158. | | SILVA, S. M. H.; LOPES-CAITAR, V. S.; NOMURA, R. B. G.; SERCERO, B. C.; SILVA, A. G.; LOPES, I. de O. N.; DIAS, W. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Small heat-shock protein (GmHsp22.4) is involved tolerance to Meloidogyne javanica infection in Arabidopsis thaliana ( Pequena proteína de choque térmico (GmHsp22.4) envolvida na tolerância à infecção por Meloidogyne javanica em Arabidopsis thaliana) In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2019, Recife. Anais... Brasília, DF: SBF, 2019. p. 159.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 159. | | STOLF-MOREIRA, R.; MEDRI, M. E.; NEUMAIER, N.; LEMOS, N. G.; PIMENTA, J. A.; TOBITA, S.; BROGIN, R. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; OLIVEIRA, M. C. N.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. Soybean physiology and gene expression during drought. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 9, n. 4, p. 1946-1956, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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