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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
17/12/2015 |
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Data da última atualização: |
05/08/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
KUMA, K. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; ROMERO, C. C. T.; SILVA, S. M. H.; CARVALHO, M. C. C. G.; ABDELNOOR, R. V.; DIAS, W. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. |
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Afiliação: |
UEL; UEL; CNPSo; UEL; UENP; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; WALDIR PEREIRA DIAS, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARÃES, CNPSO. |
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Título: |
A high efficient protocol for soybean root transformation by Agrobacterium rhizogenes and most stable reference genes for RT-qPCR analysis. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Cell Reports, v. 34, n. 11, p. 1987-2000, 2015. |
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ISSN: |
1432-203X |
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DOI: |
10.1007/s00299-015-1845-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Gene functional analyses are essential to the validation of results obtained from in silico and/or geneprospecting studies. Genetic transformation methods that yield tissues of transient expression quickly have been of considerable interest to researchers. Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation methods, which are employed to generate plants with transformed roots, have proven useful for the study of stress caused by root phytopathogens via gene overexpression and/or silencing. While some protocols have been adapted to soybean plants, transformation efficiencies remain limited; thus, few viable plants are available for performing bioassays. Furthermore, mRNA analyses that employ reverse transcription quantitative polymerase chain reactions (RT-qPCR) require the use of reference genes with stable expression levels across different organs, development steps and treatments. In the present study, an A. rhizogenes-mediated soybean root transformation approach was optimized. The method delivers significantly higher transformation efficiency levels and rates of transformed plant recovery, thus enhancing studies of soybean abiotic conditions or interactions between phytopathogens, such as nematodes. A 55 % transformation efficiency was obtained following the addition of an acclimation step that involves hydroponics and different selection processes. The present study also validated the reference genes GmELF1-b and GmELF1-a as the most stable to be used in RT-qPCR analysis in composite plants, mainly under nematode infection. MenosGene functional analyses are essential to the validation of results obtained from in silico and/or geneprospecting studies. Genetic transformation methods that yield tissues of transient expression quickly have been of considerable interest to researchers. Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation methods, which are employed to generate plants with transformed roots, have proven useful for the study of stress caused by root phytopathogens via gene overexpression and/or silencing. While some protocols have been adapted to soybean plants, transformation efficiencies remain limited; thus, few viable plants are available for performing bioassays. Furthermore, mRNA analyses that employ reverse transcription quantitative polymerase chain reactions (RT-qPCR) require the use of reference genes with stable expression levels across different organs, development steps and treatments. In the present study, an A. rhizogenes-mediated soybean root transformation approach was optimized. The method delivers significantly higher transformation efficiency levels and rates of transformed plant recovery, thus enhancing studies of soybean abiotic conditions or interactions between phytopathogens, such as nematodes. A 55 % transformation efficiency was obtained following the addition of an acclimation step that involves hydroponics and different selection processes. The present study also validated the reference genes GmELF1-b and GmELF1-a as the most stable to be used in RT-qPCR analysis i... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Soja. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
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520 $aGene functional analyses are essential to the validation of results obtained from in silico and/or geneprospecting studies. Genetic transformation methods that yield tissues of transient expression quickly have been of considerable interest to researchers. Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation methods, which are employed to generate plants with transformed roots, have proven useful for the study of stress caused by root phytopathogens via gene overexpression and/or silencing. While some protocols have been adapted to soybean plants, transformation efficiencies remain limited; thus, few viable plants are available for performing bioassays. Furthermore, mRNA analyses that employ reverse transcription quantitative polymerase chain reactions (RT-qPCR) require the use of reference genes with stable expression levels across different organs, development steps and treatments. In the present study, an A. rhizogenes-mediated soybean root transformation approach was optimized. The method delivers significantly higher transformation efficiency levels and rates of transformed plant recovery, thus enhancing studies of soybean abiotic conditions or interactions between phytopathogens, such as nematodes. A 55 % transformation efficiency was obtained following the addition of an acclimation step that involves hydroponics and different selection processes. The present study also validated the reference genes GmELF1-b and GmELF1-a as the most stable to be used in RT-qPCR analysis in composite plants, mainly under nematode infection.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 188 | |
| 101. |  | GIROTTO, L.; SOLDERA, M. C. A.; HONNA, P. T.; KANAMORI, N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Transformação da cultivar de soja BR 16 via Agrobacterium tumefaciens, com a construção 35S: AREB1. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 15, res. 7.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 102. | | GIROTTO, L.; SOLDERA, M. C. A.; HONNA, P. T.; KANAMORI, N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Transformação da cultivar de soja BR 16 via Agrobacterium tumefaciens, com a construção 35S:AREB1. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 103. | | LIU, J.; BRAUN, E.; QIU, W.; SHI, Y. F.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; NAVARRE, D. R.; HILL, J. H.; WHITHAM, S. A. Positive and negative roles for soybean MPK6 in regulating defense responses. Molecular Plant-Microbe Interactions, p. 1-36, Apr. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 104. | | RINCÃO, M. P.; CATELLI, L. L.; MARIN, S. R. R.; SOARES, R. M.; ARIAS, C. A. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Validação de marcadores moleculares microssatélites ligados ao gene Rps1-k de resistência à podridão radicular de fitóftora em soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 17, res. 11.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 105. | | RINCÃO, M. P.; CATELLI, L. L.; MARIN, S. R. R.; SOARES, R. M.; ARIAS, C. A. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Validação de marcadores moleculares microssatélites ligados ao gene Rps1-k de resistência à podridão radicular de fitóftora em soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. 4 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 106. | | POLIZEL-PODANOSQUI, A. M.; CARVALHO, M. C. C. G. de; ROCHA, C. S.; DARBEN, L. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; AOYAOGI, L. N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Temporal gene expression analysis of effector candidates of Phakopsora pachyrhizi across the infection cycle. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, 16., 2014, Rhodes. [Abstracts...]. Atenas: International Society of Molecular Plant-Microbe Interactions, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 107. | | TROVATI, B.; FERREIRA, N.; SANTOS, E. A. dos; CASTANHO, F. M.; KUWAHARA, M. K.; MEYER, M. C.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Variabilidade patôgenica de Phakopsora pachyrhizi nas principais regiões produtoras de soja no brasil nas safras 2018-2021. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno, editores técnicos. resumo 94. p. 113.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 108. | | SANTOS, J. V. M. dos; FERREIRA, E. G. C.; PASSIANOTTO, A. L. L.; BRUMER, B. B.; SANTOS, A. B. dos; SOARES, R. M.; TORKAMANEH, D.; ARIAS, C. A. A.; BELZILE, F.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Association mapping of a locus that confers southern stem canker resistance in soybean and SNP marker development. BMC Genomics, v. 20, n. 798, 2019. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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| 109. | | SILVA, A. G.; HISHINUMA-SILVA, S. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; NOMURA, R. G.; DIAS, W. P.; LOPES, I. de O. N.; CARVALHO, M. C. C. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Análise funcional do gene At4g10250 em resposta à infecção por Meloidogyne javanica em Arabidopsis thaliana. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 13., 2018, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2018. p. 46-52.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 110. | | SANTOS, J. V. M.; JOSHI, T.; KHAN, S. M.; LIU, Y.; WANG, J.; VUONG, T. D.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; OLIVEIRA, M. F. de; VALLIYODAN, B.; XU, D.; NGUYEN, H. T.; ABDELNOOR, R. V. Copy-number variations reveal divergence among brazilian soybean cultivars. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 7.; MERCOSOJA, 2015, Florianópolis. Tecnologia e mercado global: perspectivas para soja: anais. Londrina: Embrapa Soja, 2015. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 111. | | FERREIRA, E. G. C.; JANUARIO, N. C. G.; BROWSER, N. D.; GUERRA, W. D.; CAMPOS, H. D.; UTIAMADA, C. M.; SEIXAS, C. D. S.; SOARES, R. M.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Caracterização de isolados do complexo Diaporthe/Phomopsis obtidos de locais com suspeita de cancro-da-haste. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 8., 2018, Goiânia. Inovação, tecnologias digitais e sustentabilidade da soja: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 584-586.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 114. | | BIANCO, L. F.; CARVALHO, J. F. C.; TERASSI, F. S.; SEINO, Y. W.; TREVIZAN, F. H.; ONOFRE, E.; NEUMAIER, N.; OLIVEIRA, M. C. N. de; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; FARIAS, J. R. B.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Crescimento de soja geneticamente modificada com os genes AtDREB1A e AtDREB2A sob déficit hídrico. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 7., 2012, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2012. p. 108-114. (Embrapa Soja. Documentos, 333). Editado por Paula Gerón Saiz de Mello. Disponível em: .| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 115. | | CHICOWSKI, A. S.; SILVA, D. C. G. da; SANTOS, A. B. dos; SANTOS, J. V. M. dos; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; ARIAS, C. A. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Desenvolvimento de ensaios KASP para seleção genotípica da resistência a Phakopsora pachyrhizi em soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 11., 2016, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2016. p. 111-121. (Embrapa Soja. Documentos, 373).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 116. | | PARMEZAN, T. R.; RINCÃO, M. P.; SABINO, F. C.; BRITO JUNIOR, S. L. B.; BIRKETT, M.; PICKETT, J.; HOFFMANN-CAMPO, C. B.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Expression profile of genes involved in terpenoid biosynthesis under Phakopsora pachryrhizi infection. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2015, Iguassu Falls. Abstract... Abstract: 620.pdf.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 117. | | DARBEN, L. M.; YOKOYAMA, A.; PARMEZAN, T. R.; KUWAHARA, M. K.; CARVALHO, M. C. C. G. de; GONELA, A.; SOARES, R. M.; ALMEIDA, A. M. R.; GODOY, C. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Evaluation of virulence of Phakopsora pachyrhizi monourediniais isolates collected in Brazil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MOFO BRANCO, 2014, Londrina. Desafios futuros: anais. Londrina: SBF, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 118. | | FREITAS-VANZO, A. T. de; SILVA, C. de C. da; NOVAES, T. G. de; WALZ, D. M.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; KUWAHARA, M. K.; MOLINA, R. de O.; LEITE JUNIOR, R. P. Evaluation of disease severity caused by Bean golden mosaic virus in different bean cultivars. Canadian Journal of Plant Pathology, v. 43, N. 1, p. 172-178, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 119. | | SANTOS, J. V. M. dos; VALLIYODAN, B.; JOSHI, T.; KHAN, S. M.; LIU, YANG.; WANG, J.; VUONG, T. D.; OLIVEIRA, M. F. de; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; XU, D.; NGUYEN, H. T.; ABDELNOOR, R. V. Evaluation of genetic variation among Brazilian soybean cultivars through genome resequencing. BMC Genomics, v. 17, n. 110, 18 p., Feb. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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