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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
21/10/2019 |
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Data da última atualização: |
21/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, K. C. de; GUIMARÃES, P. de S.; BAZIOLI, J. M.; MARTINATI, J. C.; SANTOS, M. M. dos; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. |
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Afiliação: |
Kenia Carvalho de Oliveira, Coffee Center Agronomic Institute - IAC; Paula de Souza Guimarães, Coffee Center Agronomic Institute - IAC; Jaqueline Moraes Bazioli, Coffee Center Agronomic Institute - IAC; Juliana Camargo Martinati, Coffee Center Agronomic Institute - IAC; Mariana Martinis dos Santos, Coffee Center Agronomic Institute - IAC; LILIAN PADILHA, CNPCa; Oliveiro Guerreiro-Filho, Coffee Center Agronomic Institute - IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa. |
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Título: |
Effects of somatic embryogenesis on gene expression of cloned coffee heterozygous hybrids. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Acta Physiologiae Plantarum, v. 41, n. 7, July 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cloning of superior coffee plants by somatic embryogenesis can assist breeding programs on reducing the cost and time for launch of new cultivars. This study aimed to evaluate the efficiency of this methodology for cloning coffee trees with high heterozygosity, and to gather evidence that clonal progenies are faithful copies of mother plants. Selected plants IAC1 and IAC 2 from Coffea arabica breeding populations, resistant to leaf rust and leaf miner, respectively, were cloned via indirect somatic embryogenesis. Expression of selected genes involved in biological processes potentially affected by in vitro cultivation was evaluated by quantitative analysis. Genes encoding proteins associated with maintenance of DNA integrity and control of cell cycle presented predictable expression patterns along the clonal multiplication process. There were differences in the expression pattern of genes linked to in vitro cultivation-related stress, which were observed comparing either IAC 1 and IAC2 genotypes or clones and their corresponding mother plant. Those analyses suggest that the somatic embryogenesis does not lead to major genomic instability and clones are identical copies of mother plants, even with detected differences in the expression of genes that influence the response of in vitro cultivation. |
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Palavras-Chave: |
Differential expression; In vitro cultivation. |
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Thesagro: |
Coffea Arábica. |
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Thesaurus Nal: |
Somaclonal variation. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/203223/1/Effects-of-somatic-embryogenesis-on-gene.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
14/05/2013 |
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Data da última atualização: |
19/03/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
PINHEIRO, V. R.; SILVA, F. F. e; GUIMARÃES, S. E. F.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, P. S.; CRUZ, C. D.; AZEVEDO, C. F. |
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Afiliação: |
MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF. |
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Título: |
Mapeamento de QTL para características de crescimento de suínos por meio de modelos de regressão aleatória. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 2, p. 190-196, fev. 2013. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi avaliar eficiência de modelos de regressão aleatória (MRA) para detectar locus de características quantitativas (QTL) para características de crescimento, em suínos. Utilizou-se uma população divergente F2 Piau x Comercial. A eficiência da metodologia proposta na detecção de QTL foi comparada à da metodologia tradicional de regressão por intervalo de mapeamento. Para tanto, utilizaram-se MRA com efeitos aleatórios poligênicos, de ambiente permanente e de QTL, tendo-se utilizado o enfoque de matriz de covariância ?identical‑by‑descent? associada aos efeitos de QTL. Testou-se a significância dos efeitos de QTL mediante a razão de verossimilhanças, tendo-se considerado o modelo como completo quando houve efeito de QTL, ou nulo, quando não. A comparação entre os modelos foi feita nas posições dos marcadores (seis marcadores microssatélites) e nas intermediárias, entre os marcadores. O MRA detectou QTL significativo na posição 65 cM do cromossomo 7 e, portanto, foi mais eficiente que a metodologia tradicional, que não detectou QTL significativo em nenhum dos fenótipos avaliados. A metodologia proposta possibilitou a detecção de QTL com efeito sobre toda a trajetória de crescimento, dentro da amplitude de idade considerada (do nascimento aos 150 dias). |
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Palavras-Chave: |
Dado longitudinal; Dados longitudinais; Growth curves; Identical-by-descent; Loco de característica quantitativa; Locos de característica quantitativas; Longitudinal data; Seleção assistida por marcador; Seleção assistida por marcadores. |
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Thesagro: |
Curva de Crescimento. |
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Thesaurus NAL: |
Marker-assisted selection; Quantitative trait loci; Sus scrofa. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/99688/1/2013-Resende-MapeamentoQLT.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/82745/1/Mapeamento-de-QTL.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo deste trabalho foi avaliar eficiência de modelos de regressão aleatória (MRA) para detectar locus de características quantitativas (QTL) para características de crescimento, em suínos. Utilizou-se uma população divergente F2 Piau x Comercial. A eficiência da metodologia proposta na detecção de QTL foi comparada à da metodologia tradicional de regressão por intervalo de mapeamento. Para tanto, utilizaram-se MRA com efeitos aleatórios poligênicos, de ambiente permanente e de QTL, tendo-se utilizado o enfoque de matriz de covariância ?identical‑by‑descent? associada aos efeitos de QTL. Testou-se a significância dos efeitos de QTL mediante a razão de verossimilhanças, tendo-se considerado o modelo como completo quando houve efeito de QTL, ou nulo, quando não. A comparação entre os modelos foi feita nas posições dos marcadores (seis marcadores microssatélites) e nas intermediárias, entre os marcadores. O MRA detectou QTL significativo na posição 65 cM do cromossomo 7 e, portanto, foi mais eficiente que a metodologia tradicional, que não detectou QTL significativo em nenhum dos fenótipos avaliados. A metodologia proposta possibilitou a detecção de QTL com efeito sobre toda a trajetória de crescimento, dentro da amplitude de idade considerada (do nascimento aos 150 dias).
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773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 48, n. 2, p. 190-196, fev. 2013.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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