| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
|
Data corrente: |
26/04/2010 |
|
Data da última atualização: |
29/09/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
MAIA, L. C. da; SOUZA, V. Q. de; KOPP, M. M.; CARVALHO, F. I. F. de F; OLIVEIRA, A. C. |
|
Afiliação: |
LUCIANO CARLOS DA MAIA, UFPel; VELCI QUEIRÓZ DE SOUZA, UFSM; MAURICIO MARINI KOPP, CNPGL; ERNANDO IRAJÁ FÉLIX DE CARVALHO, UFPel; ANTÔNIO COSTA OLIVEIRA, UFPel. |
|
Título: |
Tandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families. |
|
Ano de publicação: |
2009 |
|
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 32, n. 4, p. 822-833, 2009. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Tandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed. |
|
Palavras-Chave: |
Comparative genomics; EST; SSR. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/711664/1/Tandem-repeat-distribution-of-gene-transcripts-in-three-plant-families.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01601naa a2200217 a 4500
001 1711664
005 2022-09-29
008 2009 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091$2DOI
100 1 $aMAIA, L. C. da
245 $aTandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families.$h[electronic resource]
260 $c2009
520 $aTandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed.
653 $aComparative genomics
653 $aEST
653 $aSSR
700 1 $aSOUZA, V. Q. de
700 1 $aKOPP, M. M.
700 1 $aCARVALHO, F. I. F. de F
700 1 $aOLIVEIRA, A. C.
773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 32, n. 4, p. 822-833, 2009.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 98 | |
| 61. |  | KOPP, M. M.; LUZ, V. K. da; MAIA, L. C. da; SOUSA, R. O. de; CARVALHO, F. I. F. de; SOUZA SOBRINHO, F. de; OLIVEIRA, A. C. Tolerância de cultivares de arroz submetidas ao estresse por ácido acético na germinação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 6., 2009, Porto Alegre. Estresses e sustentabilidade: desafios para a lavoura arrozeira: anais. Porto Alegre: Sociedade Sul-brasileira de Arroz Irrigado, 2009. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
|    |
| 62. | | PIASECKI, C.; YANG, Y.; BENEMANN, D. P.; KREMER, F. S.; GALLI, V.; MILLWOOD, R. J.; CECHIN, J.; AGOSTINETTO, D.; MAIA, L. C.; VARGAS, L.; STEWART JR, C. N. Transcriptomic analysis identifies new non-target site glyphosate-resistance genes in Conyza bonariensis. Plants, n. 8, n. 6, 157, June 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
| |
| 64. | | SILVA, E. M.; MAIA, L. C.; MENEZES, K. M. S.; BRAGA, M. B.; MELO, N. F. de; YANO-MELO, A. M. Water availability and formation of propagules of arbuscular mycorrhizal fungi associated with sorghum. Applied Soil Ecology, Amsterdam, v. 94, p. 15-20, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
|  |
| 65. | | OLIVEIRA, A. C. de; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; SILVEIRA, C. F.; BRAGA, E. J. B.; FONSECA, G. de M. da; BENITEZ, L. C.; MAIA, L. C. da; LUZ, V. K. da. Ácido abscísico e o estresse abiótico. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. 30 p. (Embrapa Clima Temperado. Documentos, 307).| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 66. | | PEREIRA, C. M. R.; GOTO, B. T.; SILVA, D. K. A. da; FERREIRA, A. C. de A.; SOUZA, F. A. de; SILVA, G. A. da S.; MAIA, L. C.; OEHL, F. Acaulospora reducta sp. nov. and A. excavata: two glomeromycotan fungi with pitted spores from Brazil. Mycotaxon, Ithaca, v. 130, p. 983-995,Oct./Dec. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 67. | | BRANCO, J. S. C.; BRESOLIN, A. P. S.; MAGALHÃES JUNIOR, A. M.; MARINI, N.; KOPP, M. M.; MAIA, L. C.; MALONE, E.; MISTURA, C.; AHLERT, R. J.; CARVALHO, F. I. de; OLIVEIRA, A. C. de. Análise da coleção ativa de germoplasma de arroz (Oryza sativa L.) da Embrapa Clima Temperado baseada na técnica de marcadores moleculares AFLP. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 5.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 27., 2007, Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2007. v. 1, p. 286-288| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 68. | | OLIVEIRA, A. C. de; MAIA, L. C. da; ALMEIDA, A. M.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; MISTURA, C. C.; BERVALD, C. M. P.; FARIAS, D. R.; AHLERT, R. A.; CRESTANI, M.; VITAL, C.; LOUREIRO, M. E.; BARBIERI, R. L. Assessment of genetic variation in Brazilian rice: Novel traits and novel techniques. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GENOMICS OF PLANT GENETIC RESOURCES, 2., 2010, Bologna, Itália. Final program & abstracts. Bologna: University of Bologna, 2010. p. 205. P5.08| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 69. | | BENITEZ, L. C. B.; VIGHI, I. L.; AULER, P. A.; AMARAL, M. N. do; MORAES, G. P.; RODRIGUES, G. dos S.; MAIA, L. C. da; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BRAGA, E. J. B. Correlation of proline content and gene expression involved in the metabolism of this amino acid under abiotic stress. Acta Physiologiae Plantarum, v. 38, n. 11, p. 267-1-12, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 70. | | OLIVEIRA, V. F. de; VENSKE, E.; STAFEN, C. F.; PANIZ, F. P.; PEDRON, T.; PEREIRA, R. M.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de; BATISTA, B. L.; PEGORARO, C. Genome-wide association of iron content in rice grains grown in Southern Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 58, e03203, 2023. Título em português: Associação genômica ampla para teor de ferro em grãos de arroz na região Sul do Brasil.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 71. | | PEDROLO, A. M.; PELEGRIN, A. J. de; STAFEN, C. F.; CORTÉS, D. C. L.; SILVEIRA, T.; PEGORARO, C.; DA MAIA, L. C.; ANTONIO COSTA DE OLIVEIRA; TOMM, G. O.; FIALHO, G. S. Influência da temperatura na germinação de Brassica napus L. var. oleífera. In: ENCONTRO LATINO AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 20.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 16.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 10.; ENCONTRO DE INICIAÇÃO À DOCÊNCIA, 6., 2016, São José dos Campos. Educação e ciência para a cidadania global: [anais]. São José dos Campos: Universidade do Vale do Paraíba, 2016. 7 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
| |
| 72. | | BARETTA, D.; NARDINO, M.; CARVALHO, I. R.; PELEGRINI, A. J. de; FERRARI, M.; OLIVEIRA, V. F. de; SZARESKI, V. J.; OLIVEIRA, A. C. de; BARROS, W. S.; SOUZA, V. Q. de; MAIA, L. C. da. Heterosis and genetic distance in intervarietal corn hybrids. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 54, e00265, 2019. Título em português: Heterose e distância genética em híbridos intervarietais de milho.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 73. | | LUZ, V. K. da; SILVEIRA, S. F. da S.; FONSECA, G. M. da; GROLI, E. L.; FIGUEIREDO, R. G.; BARETTA, D.; KOPP, M. M.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de. Identification of variability for agronomically important traits in rice mutant families. Bragantia, v. 75, n. 1, p. 41-50, jan./mar. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 74. | | ALMEIDA, H. C. F. de; WOLTER, D. D.; GROLI, E. L.; ZIMMER, C. M.; BARETTA, D.; LUZ, V. K. da; FONSECA, G. de M. da; KOPP, M. M.; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de. Indução de mutação em genótipos de arroz submetidos a estresse por baixas temperaturas no estádio germinativo. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 21.; MOSTRA CIENTÍFICA, 4., 2012, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPelotas, 2012. 1 CD-ROM. CIC UFPelotas.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 75. | | GETZ, B.; SILVA, R. M. da; LUZ, V. K. da; SOUSA, R. O. de; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BARBOSA NETO, J. F.; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de. Identification of rice mutant families with chilling tolerance. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 59, e03408, 2024. Título em português: Identificação de famílias mutantes de arroz com tolerância ao frio.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 76. | | LUCHE, H. de S.; SILVA, J. A. G. da; NORNBERG, R.; SILVEIRA, S. F. S. da; BARETTA, D.; GROLI, E. L.; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de. Desempenho per se e parâmetros genéticos de linhagens de trigo com expressão do caráter "stay-green". Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 2, p. 167-173, fev. 2013. Título em inglês: Per se performance and genetic parameters of wheat lines expressing the ?stay?green? character.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 77. | | AGUIAR, G. A.; STRECK, E.; SEVERO, A. C. de M.; OLIVEIRA, A. C. de; MAIA, L. C. da; MORAES, O. P. de; NEVES, P.; FAGUNDES, P. R. R.; MAGALHÃES JUNIOR, A. M. de. Desempenho agronômico de linhagens de arroz irrigado em ensaio de VCU no RS - safra 2011/12. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 8., 2013, Santa Maria. Avaliando cenários para a produção sustentável de arroz: anais. Santa Maria: UFSM; Porto Alegre: Sosbai, 2013. v.1. p. 233-236.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 78. | | SILVA, J. A. G. da; CARVALHO, F. I. F. de; HARTWIG, I.; CAETANO, V. da R.; BERTAN, I.; MAIA, L. C. da; SCHIMIDT, D. A. M.; FINATTO, T.; VALÉRIO, I. P. Distância morfológica entre genótipos de trigo com ausência e presença do caráter "stay-green". Ciência Rural, Santa Maria, v. 37, n. 5, p.1261-1267, set/out, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
| |
| 79. | | SANTOS, O. P. dos; CARVALHO, I. R.; NRDINO, M.; OLIVOTO, T.; PELEGRIN, A. J. de; SZARESKI, V. J.; FERRARI, M.; NUNES, A. C. P.; DEMARI, G. H.; LAUTENCHLEGER, F.; SOUZA, V. Q. de; MAIA, L. C. da. Methods of adaptability and stability applied to eucalyptus breeding. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 1, p. 53-62, jan. 2018. Título em português: Métodos de adaptabilidade e estabilidade aplicados ao melhoramento de eucalipto.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 80. | | FACCHINELLO, P. H. K.; CARVALHO, I. R.; STRECK, E. A.; AGUIAR, G. A.; GOVEIA, J.; FEIJÓ, M.; PEREIRA, R. R.; FAGUNDES, P. R. R.; LORO, M. V.; MAIA, L. C. DA; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de. Genetic cause and effect interrelationships for grain quality attributes of irrigated rice. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e03252, 2023. Título em português: Inter-relações genéticas de causa e efeito para atributos de qualidade de grãos de arroz irrigado.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| Registros recuperados : 98 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
