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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
26/04/2010 |
Data da última atualização: |
29/09/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MAIA, L. C. da; SOUZA, V. Q. de; KOPP, M. M.; CARVALHO, F. I. F. de F; OLIVEIRA, A. C. |
Afiliação: |
LUCIANO CARLOS DA MAIA, UFPel; VELCI QUEIRÓZ DE SOUZA, UFSM; MAURICIO MARINI KOPP, CNPGL; ERNANDO IRAJÁ FÉLIX DE CARVALHO, UFPel; ANTÔNIO COSTA OLIVEIRA, UFPel. |
Título: |
Tandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families. |
Ano de publicação: |
2009 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 32, n. 4, p. 822-833, 2009. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Tandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed. |
Palavras-Chave: |
Comparative genomics; EST; SSR. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/711664/1/Tandem-repeat-distribution-of-gene-transcripts-in-three-plant-families.pdf
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Marc: |
LEADER 01601naa a2200217 a 4500 001 1711664 005 2022-09-29 008 2009 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091$2DOI 100 1 $aMAIA, L. C. da 245 $aTandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families.$h[electronic resource] 260 $c2009 520 $aTandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed. 653 $aComparative genomics 653 $aEST 653 $aSSR 700 1 $aSOUZA, V. Q. de 700 1 $aKOPP, M. M. 700 1 $aCARVALHO, F. I. F. de F 700 1 $aOLIVEIRA, A. C. 773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 32, n. 4, p. 822-833, 2009.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Registros recuperados : 98 | |
41. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MELO, A. M. Y.; FREITAS, N. O.; SILVA, F. S. B.; MELO, N. F. de; SILVA FILHO, A. V.; MAIA, L. C. Aplicação de ácido húmico em mudas enxertadas e micorrizada de uva sem semente (IAC 766/Crimson Seedless), em dois solos do Vale do Submédio São Francisco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 30., 2005, Recife. Anais... Recife: SBCS: Embrapa Solos - UEP Recife: UFRPE, 2005. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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55. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SOUZA, F. A. de; SILVA, I. R. da; BARRETO, M. B. B. de B.; OEHL, F.; GOTO, B. T.; MAIA, L. C. Racocetra crispa (Glomeromycotina) delimited by integrative evidence based on morphology, long continuous nuclear rDNA sequencing and phylogeny. Mycological Progress, v. 17, p. 999-1011, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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58. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | CAMPOS, M. A. da S.; SILVA, F. S. B.; MELO, A. M. Y.; MELO, N. F. de; PEDROSA, E. M. R.; MAIA, L. C. Responses of guava plants to inoculation with arbuscular mycorrhizal fungi in soil infested with Meloidogyne enterolobii. Plant Pathology Journal, v. 29, n. 3, p. 242-248, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
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Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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