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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
24/07/2018 |
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Data da última atualização: |
05/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DIAS, K. O. das G.; GEZAN, S. A.; GUIMARÃES, C. T.; NAZARIAN, A.; SILVA, L. da C. e; PARENTONI, S. N.; GUIMARAES, P. E. de O.; ANONI, C. de O.; PÁDUA, J. M. V.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; RIBEIRO, C. A. G.; MAGALHAES, J. V. de; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, J. C. de; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M. |
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Afiliação: |
Kaio Olímpio das Graças Dias, Universidade Federal de Lavras; Salvador Alejandro Gezan, School of Forest Resources & Conservation, University of Florida, Gainesville.; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; Alireza Nazarian, School of Forest Resources & Conservation, University of Florida, Gainesville.; Luciano da Costa e Silva, JMP Division, SAS Institute Inc., Cary.; SIDNEY NETTO PARENTONI, CNPMS; PAULO EVARISTO DE O GUIMARAES, CNPMS; Carina de Oliveira Anoni, Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”; José Maria Villela Pádua, Universidade Federal de Lavras; MARCOS DE OLIVEIRA PINTO, CNPMS; ROBERTO WILLIANS NODA, CNPMS; Carlos Alexandre Gomes Ribeiro, Universidade Federal de Viçosa; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; Antonio Augusto Franco Garcia, Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”; João Cândido de Souza, Universidade Federal de Lavras; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS. |
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Título: |
Improving accuracies of genomic predictions for drought tolerance in maize by joint modeling of additive and dominance effects in multi-environment trials. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Heredity, London, v. 121, n. 1, p. 24-37, 2018. |
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DOI: |
10.1038/s41437-018-0053-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Breeding for drought tolerance is a challenging task that requires costly, extensive, and precise phenotyping. Genomic selection (GS) can be used to maximize selection efficiency and the genetic gains in maize (Zea mays L.) breeding programs for drought tolerance. Here, we evaluated the accuracy of genomic selection (GS) using additive (A) and additive + dominance (AD) models to predict the performance of untested maize single-cross hybrids for drought tolerance in multienvironment trials. Phenotypic data of five drought tolerance traits were measured in 308 hybrids along eight trials under water-stressed (WS) and well-watered (WW) conditions over two years and two locations in Brazil. Hybrids? genotypes were inferred based on their parents? genotypes (inbred lines) using single-nucleotide polymorphism markers obtained via genotyping-by-sequencing. GS analyses were performed using genomic best linear unbiased prediction by fitting a factor analytic (FA) multiplicative mixed model. Two cross-validation (CV) schemes were tested: CV1 and CV2. The FA framework allowed for investigating the stability of additive and dominance effects across environments, as well as the additive-by-environment and the dominance-by-environment interactions, with interesting applications for parental and hybrid selection. Results showed differences in the predictive accuracy between A and AD models, using both CV1 and CV2, for the five traits in both water conditions. For grain yield (GY) under WS and using CV1, the AD model doubled the predictive accuracy in comparison to the A model. Through CV2, GS models benefit from borrowing information of correlated trials, resulting in an increase of 40% and 9% in the predictive accuracy of GY under WS for A and AD models, respectively. These results highlight the importance of multi-environment trial analyses using GS models that incorporate additive and dominance effects for genomic predictions of GY under drought in maize single-cross hybrids. MenosBreeding for drought tolerance is a challenging task that requires costly, extensive, and precise phenotyping. Genomic selection (GS) can be used to maximize selection efficiency and the genetic gains in maize (Zea mays L.) breeding programs for drought tolerance. Here, we evaluated the accuracy of genomic selection (GS) using additive (A) and additive + dominance (AD) models to predict the performance of untested maize single-cross hybrids for drought tolerance in multienvironment trials. Phenotypic data of five drought tolerance traits were measured in 308 hybrids along eight trials under water-stressed (WS) and well-watered (WW) conditions over two years and two locations in Brazil. Hybrids? genotypes were inferred based on their parents? genotypes (inbred lines) using single-nucleotide polymorphism markers obtained via genotyping-by-sequencing. GS analyses were performed using genomic best linear unbiased prediction by fitting a factor analytic (FA) multiplicative mixed model. Two cross-validation (CV) schemes were tested: CV1 and CV2. The FA framework allowed for investigating the stability of additive and dominance effects across environments, as well as the additive-by-environment and the dominance-by-environment interactions, with interesting applications for parental and hybrid selection. Results showed differences in the predictive accuracy between A and AD models, using both CV1 and CV2, for the five traits in both water conditions. For grain yield (GY) under WS a... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Milho; Resistência a Seca. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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| Registros recuperados : 174 | |
| 161. |  | SILVA, K. J. da; PASTINA, M. M.; GUIMARÃES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; PIMENTEL, L. D.; SCHAFFERT, R. E.; PINTO, M. de O.; SOUZA, V. F. de; BERNARDINO, K. da C.; SILVA, M. J. da; BORÉM, A.; MENEZES, C. B. de. Genetic diversity and heterotic grouping of sorghum lines using SNP markers. Scientia Agricola, v. 78, n. 6, e20200039, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 162. | | BERNARDINO, K. C.; PASTINA, M. M.; MENEZES, C. B. de; SOUSA, S. M. de; MACIEL, L. S.; CARVALHO JÚNIOR, G.; GUIMARÃES, C. T.; BARROS, B. de A.; SILVA, L. da C. e; CARNEIRO, P. C. S.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; MAGALHAES, J. V. de. The genetic architecture of phosphorus efficiency in sorghum involves pleiotropic QTL for root morphology and grain yield under low phosphorus availability in the soil. BMC Plant Biology, v. 19, n. 87, p. 1-15, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 163. | | MAGALHAES, J. V. de; LIU, J.; GUIMARAES, C. T.; LANA, U. G. de P.; ALVES, V. M. C.; WANG, Y-H.; SCHAFFERT, R. E.; HOEKENGA, O. A.; PINEROS, M. A.; SHAFF, J. E.; KLEIN, P. E.; CARNEIRO, N. P.; COELHO, C. M.; TRICK, H. N.; KOCHIAN, L. V. A gene in the multidrug and toxic compound extrusion (MATE) family confers aluminum tolerance in sorghum. Nature Genetics, New York, v. 39, n. 9, p. 1156-1161, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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| 164. | | MELO, J. O.; MARTINS, L. G. C.; BARROS, B. de A.; PIMENTA, M. R.; LANA, U. G. de P.; DUARTE, C. E. M.; PASTINA, M. M.; GUIMARÃES, C. T.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; FONTES, E. P. B.; MAGALHAES, J. V. de. Repeat variants for the SbMATE transporter protect sorghum roots from aluminum toxicity by transcriptional interplay in cis and trans. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Washington, v. 116, n. 1, p. 313-318, 2019. Publicado online em 13 dez. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 165. | | JARDIM, J. N.; GUIMARAES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; SOUZA, I. R. P. de; LANA, U. G. de P.; CASELA, C. R.; COSTA, R. V. da; GUIMARAES, P. E. de O.; PARENTONI, S. N.; GUIMARAES, L. J. M.; PACHECO, C. A. P.; SILVA, A. R. da; OLIVEIRA, E. de. Mapeamento de QTLs visando a implementação de seleção assistida para resistência a doenças foliares em milho. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 1., 2008, Brasília, DF. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 166. | | SOUZA, V. F. de; PEREIRA, G. da S.; PASTINA, M. M.; PARRELLA, R. A. da C.; SIMEONE, M. L. F.; BARROS, B. de A.; NODA, R. W.; SILVA, L. da C. e; MAGALHAES, J. V. de; SCHAFFERT, R. E.; GARCIA, A. A. F.; DAMASCENO, C. M. B. QTL mapping for bioenergy traits in sweet sorghum recombinant inbred lines. G3: Genes, Genomes, Genetics, v. 11, 112021, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 167. | | PARENTONI, S. N.; SOUZA JUNIOR, C. L. de; ALVES, V. M. C.; GUIMARAES, C.; COELHO, A. M.; PACHECO, C. A. P.; GUIMARAES, P. E. O.; MEIRELLES, W. F.; GUIMARAES, L. J. M.; SILVA, A. R. da; VASCONCELOS, M. J.; MAGALHAES, J. V. de; OLIVEIRA, A. C.; SCHAFFERT, R. E. Eficiência de aquisição e utilização interna de fósforo em milho tropical: importância relativa e critérios de seleção. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 168. | | PARENTONI, S. N.; SOUZA JUNIOR, C. L. de; ALVES, V. M. C.; GAMA, E. E. G. e; COELHO, A. M.; OLIVEIRA, A. C. de; GUIMARAES, P. E. de O.; GUIMARAES, C. T.; VASCONCELOS, M. J. V. de; PACHECO, C. A. P.; MEIRELLES, W. F.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, L. J. M.; SILVA, A. R. da; MENDES, F. F.; SCHAFFERT, R. E. Inheritance and breeding strategies for phosphorus efficiency in tropical maize (Zea mays L.). Maydica, Bergamo, v. 55, n. 1, p. 1-15, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 169. | | BARROS, B. de A.; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P.; MAGALHAES, P. C.; ALVES, M. de C.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T.; MENEZES, C. B. de; TARDIN, F. D.; SCHAFFERT, R. E. Identification of candidate genes associated with drought tolerance in sorghum. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 4., 2013, Bento Gonçalves. Resumos... Bento Gonçalves: Sociedade Brasileira de Genética, 2013. p. 30.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 170. | | DIAS, K. O. das G.; GEZAN, S. A.; GUIMARÃES, C. T.; NAZARIAN, A.; SILVA, L. da C. e; PARENTONI, S. N.; GUIMARAES, P. E. de O.; ANONI, C. de O.; PÁDUA, J. M. V.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; RIBEIRO, C. A. G.; MAGALHAES, J. V. de; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, J. C. de; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M. Improving accuracies of genomic predictions for drought tolerance in maize by joint modeling of additive and dominance effects in multi-environment trials. Heredity, London, v. 121, n. 1, p. 24-37, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 174. | | GAMA, E. E. G. e; SANTOS, F. G. dos; DURAES, F. O. M.; GOMIDE, R. L.; ALBUQUERQUE, P. E. P. de; BASTOS, E. A.; CARDOSO, M. J.; MORGADO, L. B.; ANDRADE, C. de L. T. de; MAGALHAES, J. V. de; MAGALHAES, C. T.; TARDIN, F. D.; GUIMARAES, L. J. M.; SILVA, A. R. da; MAGALHAES, P. C.; CARNEIRO, N. P.; PARENTONI, S. N.; SCHAFFERT, R. E. Drought tolerance phenotyping in maize and sorghum: preliminary, intermediate and advanced evaluations. In: WORKSHOP SUPPORTING EMERGENCE OR REFERENCE DROUGHT TOLERANCE PHENOTYPING CENTERS - DROUGHT PHENOTYPING NETWORK, 2008, Sete Lagoas. Proceedings... Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. p. 92-120.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Semiárido. |
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