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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
18/06/2012 |
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Data da última atualização: |
03/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GUIMARÃES-DIAS, F.; NEVES-BORGES, A. C.; VIANA, A. A. B.; MESQUITA, R. O.; ROMANO, E.; GROSSI-DE-SÁ, M. de F.; NEPOMUCENO, A. L.; LOUREIRO, M. E.; ALVES-FERREIRA, M. |
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Afiliação: |
FÁBIA GUIMARÃES DIAS, UFRJ; ANNA CRISTINA NEVES-BORGES, UNIRIO; ANTONIO AMERICO BARBOSA VIANA, CENARGEN; ROSILENE OLIVEIRA MESQUITA, UFV; EDUARDO ROMANO DE CAMPOS PINTO, CENARGEN; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, CENARGEN; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; MARCELO EHLERS LOUREIRO, UFV; MÁRCIO ALVES-FERREIRA, UFRJ. |
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Título: |
Expression analysis in response to drought stress in soybean: shedding light on the regulation of metabolic pathway genes. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 222-232, May 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Metabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes that showed strong induction under drought stress were selected and used as bait to identify orthologs in the soybean genome. This allowed us to select 354 genes of putative soybean orthologs of 79 Arabidopsis genes belonging to 38 distinct metabolic pathways. The expression pattern of the selected genes was verified in the subtractive libraries available in the GENOSOJA project. Subsequently, 13 genes from different metabolic pathways were selected for validation by qPCR experiments. The expression of six genes was validated in plants undergoing drought stress in both pot-based and hydroponic cultivation systems. The results suggest that the metabolic response to drought stress is conserved in Arabidopsis and soybean plants. MenosMetabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes that showed strong induction under drought stress were selected and used as bait to identify orthologs in the soybean genome. This allowed us to select 354 genes of putative soybean orthologs of 79 Arabidopsis genes belonging to 38 distinct metabolic pathways. The expression pattern of the selected genes was verified in the subtractive libraries available in the GENOSOJA project. Subsequently, 13 genes from different metabolic pathways were selected for validation by qPCR experiments. The expression of six genes was validated in plants undergoing drought stress in both pot-based and hydroponic cultivation systems. The results suggest that the metabolic response to drought stress is conserved in Arabidopsis and soybean plan... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; QPCR. |
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Thesagro: |
Gene; Genoma; Resistência a seca; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Biochemical pathways; Bioinformatics; Drought tolerance; Genes; Genome; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61069/1/gmb.expression.anal.v35n1s.222-232.2012.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
04/05/2001 |
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Data da última atualização: |
27/06/2011 |
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Autoria: |
SAMPAIO, P. de T. B.; RESENDE, M. D. V. de; ARAÚJO, A. J. de. |
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Afiliação: |
Resende pesquisador da Embrapa Florestas. |
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Título: |
Estimativas de parâmetros genéticos e métodos de seleção para o melhoramento genético de Pinus caribaea var. hondurensis. |
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Ano de publicação: |
2000 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v. 35, n. 11 p. 2243-2253, nov. 2000. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Este trabalho teve por objetivo estudar a variabilidade genetica por meio de testes de prog3nies e determinar o ganho genetico por meio de selecao individual, combinada e índice multiefeito, em Pinus caribaea var. hondurensis. Foram instalados dois testes de progenie em Tibagi, PR, em setembro de 1988. Dados de crescimento e de formas da arvore foram obtidos aos cinco anos de idade. A produtividade volumetrica media obtida foi de 0,091 m3 por arvore. Para estabelecer um pomar de sementes por mudas, a selecao (no bloco) de 190 arvores (95 por procedencia) com os maiores diâmetros na altura do peito (DAP) permite aumentos na produtividade volumetrica de 0,104 m3, 0,106 m3 e 0,106 m3 por arvore, na selecao individual, combinada e indice multiefeito, respectivamente. Em pomar de sementes clonal, a selecao (no experimento) de 30 arvores (15 por procedencia) com o maior ganho genetico em DAP, pode atingir incrementos na produtividade volumetrica de 0,112 m3, 0,113 m3 e 0,114 m3, por arvore, na selecao individual, combinada e índice multiefeito, respectivamente. |
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Palavras-Chave: |
Ganho genético; Melhoramento genetico; Valor genético. |
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Thesagro: |
Índice de Seleção; Melhoramento Genético Vegetal; Pinus Caribaea; Seleção; Variação Genética. |
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Thesaurus NAL: |
Breeding methods; Breeding value; Genetic variation; Selection index. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPF/35588/1/pab99_121.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/AI-SEDE/18866/1/pab99_121.pdf
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Marc: |
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520 $aEste trabalho teve por objetivo estudar a variabilidade genetica por meio de testes de prog3nies e determinar o ganho genetico por meio de selecao individual, combinada e índice multiefeito, em Pinus caribaea var. hondurensis. Foram instalados dois testes de progenie em Tibagi, PR, em setembro de 1988. Dados de crescimento e de formas da arvore foram obtidos aos cinco anos de idade. A produtividade volumetrica media obtida foi de 0,091 m3 por arvore. Para estabelecer um pomar de sementes por mudas, a selecao (no bloco) de 190 arvores (95 por procedencia) com os maiores diâmetros na altura do peito (DAP) permite aumentos na produtividade volumetrica de 0,104 m3, 0,106 m3 e 0,106 m3 por arvore, na selecao individual, combinada e indice multiefeito, respectivamente. Em pomar de sementes clonal, a selecao (no experimento) de 30 arvores (15 por procedencia) com o maior ganho genetico em DAP, pode atingir incrementos na produtividade volumetrica de 0,112 m3, 0,113 m3 e 0,114 m3, por arvore, na selecao individual, combinada e índice multiefeito, respectivamente.
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773 $tPesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia$gv. 35, n. 11 p. 2243-2253, nov. 2000.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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