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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
30/08/2018 |
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Data da última atualização: |
11/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DUARTE, D. A. S.; FORTES, M. R. S.; DUARTE, M. de S.; GUIMARÃES, S. E. F.; VERARDO, L. L.; VERONEZE, R.; RIBEIRO, A. M. F.; LOPES, P. S.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. |
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Afiliação: |
Darlene Ana S. Duarte, UFV; Marina Rufino S. Fortes, University of Queensland; Marcio de Souza Duarte, UFV; Simone E. F. Guimarães, UFV; Lucas L. Verardo, UFV; Renata Veroneze, UFV; Andre Mauric F. Ribeiro, UFV; Paulo Sávio Lopes, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Fabyano Fonseca e Silva, UFV. |
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Título: |
Genome-wide association studies, meta-analyses and derived gene network for meat quality and carcass traits in pigs. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal Production Science, v. 58, n. 6, p. 1100-1008, May 2018. |
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DOI: |
dx.doi.org/10.1071/AN16018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A large number of quantitative trait loci (QTL) for meat quality and carcass traits has been reported in pigs over the past 20 years. However, few QTL have been validated and the biological meaning of the genes associated to these QTL has been underexploited. In this context, a meta-analysis was performed to compare the significant markers with meta-QTL previously reported in literature. Genome association studies were performed for 12 traits, from which 144 SNPs were found out to be significant (P < 0.05). They were validated in the meta-analysis and used to build the Association Weight Matrix, a matrix framework employed to investigate co-association of pairwise SNP across phenotypes enabling to derive a gene network. A total of 45 genes were selected from the Association Weight Matrix analysis, from which 25 significant transcription factors were identified and used to construct the networks associated to meat quality and carcass traits. These networks allowed the identification of key transcription factors, such as SOX5 and NKX2–5, gene–gene interactions (e.g. ATP5A1, JPH1, DPT and NEDD4) and pathways related to the regulation of adipose tissue metabolism and skeletal muscle development. Validated SNPs and knowledge of key genes driving these important industry traits might assist future strategies in pig breeding. |
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Palavras-Chave: |
Biological pathways; Post-GWAS; SNP-derived gene networks. |
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Thesagro: |
Melhoramento Genético Animal; Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Pork. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02343naa a2200325 a 4500
001 2094834
005 2019-02-11
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260 $c2018
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650 $aAnimal breeding
650 $aPork
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700 1 $aSILVA, F. F. e
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 171 | |
| 28. |  | ASSIS, G. M. L. de; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S. Adequabilidade do modelo infinitesimal em avaliações genéticas para características governadas por diferentes números de locos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais dos resumos. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2006. 4 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 29. | | CABUCI, J. A.; EUCLYDES, R. F.; TEODORO, R. L.; VERNEQUE, R. da S.; LOPES, P. S.; SILVA, M. de A. Aspectos genéticos e ambientais da curva de lactação de vacas da raça Guzerá. Revista Brasileira de Zootecnia, Vicosa, v. 30, n. 4, p. 1204-1211, 2001.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 30. | | PEIXOTO, J. de O.; FARIA, D. A. de; SILVA, P. V.; FONSECA, I.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Association between leptin genes single nucleotide polymorphisms and carcass traits in pigs Revista Brasileira de Zootecnia, v.38, n.2, p.271-276, 2009 Subprojeto: 16.00.30004-00| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 31. | | CARRARA, E. R.; LOPES, P. S.; VERONEZE, R.; PEREIRA, R. J.; ZADRA, L. E. F.; PEIXOTO, M. G. C. D. Assessment of runs of homozygosity, heterozygosity-rich regions and genomic inbreeding estimates in a subpopulation of Guzerá (Bos indicus) dual-purpose cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 141, n. 2, p. 207-219, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
|  |
| 32. | | LOPES, P. S.; TORRES, R. de A.; SILVA, M. de A. e; FONSECA, J. B.; SOARES, P. R. Analise genetica e economica em caracteristicas produtivas de aves de postura. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 21., 1984, Belo Horizonte, MG. Anais... Belo Horizonte: SBZ, 1984. p.93| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 33. | | MOTA, R. R.; SILVA, F. F.; LOPES, P. S.; TEMPELMAN, R. J.; SOLLERO, B. P.; AGUILAR, I.; CARDOSO, F. F. Analyses of reaction norms reveal new chromosome regions associated with tick resistance in cattle. Animal, v. 12, n. 2, p. 205-214, Feb. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 36. | | ABREU, U. G. P. de; SANTOS, S. A.; LOPES, P. S.; TORRES, R. de A.; SANTOS, H. do N. Avaliação da utilização de cadeia de Markov para modelagem da dinâmica da estrutura de rebanho de bovino de corte em sistema extensivo de produção do Pantanal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 6., São Pedro, SP, 2007. Anais...Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. 16-20| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 38. | | COBUCI, J. A.; EUCLYDES, R. F.; LOPES, P. S.; COSTA, C. N.; TORRES, R. de A.; PEREIRA, C. S. Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in holstein cows using a random regression model. Genetics and Molecular Biology, v. 28, n. 1, p. 75-83, 2005.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 39. | | ASSIS, G. M. L. de; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S. Estimação de componentes de variância sob influência de genes de efeito principal, comparando-se metodologias Baynesiana e clássica sob diferentes cenários. Revista Brasileira de Zootecnia, Piracicaba, v. 36, n. 5, p. 1266-1274, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 40. | | CARNEIRO JUNIOR, J. M.; ASSIS, G. M. L. de; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S. Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias. Revista Brasileira de Zootecnia, Piracicaba, v. 36, n. 5, p. 1539-1548, 2007. Suplemento.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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