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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
02/12/2015 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SANTOS, V. S.; MARTINS FILHO, S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARAES, S. E. F.; GLORIA, L. S.; SILVA, F. F. |
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Afiliação: |
V. S. SANTOS, Universidade Federal de Viçosa; S. MARTINS FILHO, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; C. F. AZEVEDO, Universidade Federal de Viçosa; P. S. LOPES, Universidade Federal de Viçosa; S. E. F. GUIMARAES, Universidade Federal de Viçosa; L. S. GLORIA, Universidade Federal de Viçosa; F. F. SILVA, Universidade Federal de Viçosa. |
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Título: |
Genomic selection for slaughter age in pigs using the Cox frailty model. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 14, n. 4, p. 12616-12627, 2015. |
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ISBN: |
http://dx.doi.org/10.4238/2015.October.19.5 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this study was to compare genomic selection methodologies using a linear mixed model and the Cox survival model. We used data from an F2 population of pigs, in which the response variable was the time in days from birth to the culling of the animal and the covariates were 238 markers [237 single nucleotide polymorphism (SNP) plus the halothane gene]. The data were corrected for fixed effects, and the accuracy of the method was determined based on the correlation of the ranks of predicted genomic breeding values (GBVs) in both models with the corrected phenotypic values. The analysis was repeated with a subset of SNP markers with largest absolute effects. The results were in agreement with the GBV prediction and the estimation of marker effects for both models for uncensored data and for normality. However, when considering censored data, the Cox model with a normal random effect (S1) was more appropriate. Since there was no agreement between the linear mixed model and the imputed data (L2) for the prediction of genomic values and the estimation of marker effects, the model S1 was considered superior as it took into account the latent variable and the censored data. Marker selection increased correlations between the ranks of predicted GBVs by the linear and Cox frailty models and the corrected phenotypic values, and 120 markers were required to increase the predictive ability for the characteristic analyzed. |
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Palavras-Chave: |
Censured data; Dado censurado; Mixed model; Modelo mixto. |
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Thesagro: |
Polimorfismo. |
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Thesaurus Nal: |
polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/134577/1/2015-M.Deon.GMR-Genomic.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 171 | |
| 81. |  | PEREIRA, R. J.; LOPES, P. S.; VERNEQUE, R. da S.; SANTANA JUNIOR, M. L.; LAGROTTA, M. R.; TORRES, R. de A. Funções de covariância para produção de leite no dia do controle em bovinos Gir Leiteiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 45, n. 11, p. 1303-1311, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 82. | | MOTA, R. R.; LOPES, P. S.; TEMPELMAN, R. J.; SILVA, F. F.; AGUILAR, I.; GULIAS GOMES, C. C.; CARDOSO, F. F. Genome-enabled prediction for tick resistance in Hereford and Braford beef cattle via reaction norm models. Journal of Animal Science, v. 94, n. 5, p. 1834-1843, May 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 83. | | SILVA, A. A.; SILVA, F. F.; SILVA, D. A.; SILVA, H. T.; COSTA, C. N.; LOPES, P. S.; VERONEZE, R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J. Genotype imputation strategies for Portuguese Holstein cattle using different SNP panels. Czech Journal of Animal Science, v. 64, n. 9, p. 377-386, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 84. | | SANTOS, V. S.; MARTINS FILHO, S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; SILVA, F. F. Genomic prediction for additive and dominance effects of censored traits in pigs. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4, gmr15048764, Oct. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 85. | | SILVA, A. A.; SILVA, D. A.; LOPES, P. S.; SILVA, H. T.; VERONEZE, R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J.; COSTA, C. N. Genomic predictions including unknown parent groups for milk traits in Portuguese Holstein cattle. In: ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN FEDERATION OF ANIMAL SCIENCE, 73., 2022, Porto. Book of abstracts... Rome: European Federation of Animal Science, 2022. p. 135.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 86. | | SANTOS, V. S.; MARTINS FILHO, S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARAES, S. E. F.; GLORIA, L. S.; SILVA, F. F. Genomic selection for slaughter age in pigs using the Cox frailty model. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 14, n. 4, p. 12616-12627, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 87. | | SILVA, D. A.; LOPES, P. S.; COSTA, C. N.; SILVA, A. A.; SILVA, H. T.; SILVA, F. F.; VERONEZE, R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J. Genotype by environment interaction for Holstein cattle populations using autoregressive and within- and across-countrymulti-trait reaction norms test-day models. Animal, v. 15, 100084, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 88. | | CAMPÊLO, J. E. G.; LOPES, P. S.; TORRES, R. de A.; EUCLYDES, R. F.; SILVA, L. O. C.; ARAÚJO, C. V. de; PEREIRA, C. S. Efeitos maternos na avaliação genética de reprodutores da raça Tabapuã. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba. Anais... Piracicaba: FEALQ, 2001. p. 517-518. CNPGC. SBZ.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 89. | | JUNQUEIRA, V. S.; LOPES, P. S.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; LOURENÇO, D. A. L.; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F. Impact of embryo transfer phenotypic records on large-scale beef cattle genetic evaluations. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 47, e20170033, 2018. 4 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 90. | | CAMPÊLO, J. E. G.; LOPES, P. S.; TORRES, R. de A.; SILVA, L. O. C.; EUCLYDES, R. F.; ARAÚJO, C. V. de; PEREIRA, C. S. Heterogeneidade de variância na avaliação genética de bovinos da raça Tabapuã em análises com efeitos maternos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba. Anais... Piracicaba: FEALQ, 2001. p. 565-566. CNPGC. SBZ.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 91. | | CAMPÊLO, J. E. G.; LOPES, P. S.; TORRES, R. de A.; EUCLYDES, R. F.; SILVA, L. O. C.; ARAÚJO, C. V. de; PEREIRA, C. S. Heterogeneidade de variância na avaliação genética de bovinos da raça Tabapuã. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba. Anais... Piracicaba: FEALQ, 2001. p. 520-521. CNPGC. SBZ.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 92. | | TORAL, F. L. B.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; LOPES, P. S.; CARDOSO, F. F.; SILVA, L. O. C. da. Heteroskedasticity for weaning weight of Charolais-Zebu crossbred calves. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 41, n. 5, p. 1163-1172, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 93. | | SILVA, A. A.; SILVA, D. A.; SILVA, F. F.; COSTA, C. N.; SILVA, H. T.; LOPES, P. S.; VERONEZE, R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J. GWAS and gene networks for milk-related traits from test-day multiple lactations in Portuguese Holstein cattle. Journal of Applied Genetics, v. 61, p. 465-476, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 94. | | BRITO, L. C.; CASELLAS, J.; VARONA, L; LOPES, P. S.; VENTURA, H. T.; PEIXOTO, M. G. C. D.; LÁZARO, S. F.; SILVA, F. F. Genetic evaluation of age at first calving for Guzerá beef cattle using linear, threshold, and survival Bayesian models. Journal of Animal Science, v. 96, n. 7, p. 2517-2524, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 95. | | MOTA, R. R.; MARQUES, L. F. A.; LOPES, P. S.; SILVA, L. P. da; RESENDE, M. D. V. de; TORRES, R. A. Genetic evaluation using multi-trait and random regression models in Simmental beef cattle. Genetics and Molecular Research, v. 12, n. 3, p. 2465-2480, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 96. | | CANAZA-CAYO, A. W.; COBUCI, J. A.; LOPES, P. S.; TORRES, R. de A.; MARTINS, M. F.; DALTRO, D. dos S.; SILVA, M. V. G. B. Genetic trend estimates for milk yield production and fertility traits of the Girolando cattle in Brazil. Livestock Science, v. 190, p. 113-122, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 97. | | BRITO, L. C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; CARRARA, E. R.; SILVA, F. F. e; VENTURA, H. T.; BRUNELI, F. A. T.; LOPES, P. S. Genetic parameters for milk, growth, and reproductive traits in Guzerá cattle under tropical conditions. Tropical Animal Health and Production, v. 52, p. 2251-2257, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 98. | | CANAZA-CAYO, A. W.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; TORRES, R. de A.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A.; COBUCI, J. A. Genetic Parameters for Milk Yield and Lactation Persistency Using Random Regression Models in Girolando Cattle. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, v. 28, n. 10, p. 1407-1418, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 99. | | SILVA, D. A. da; SILVA, F. F. e; VENTURA, H. T.; JUNQUEIRA, V. S.; SILVA, A. A. da; MOTA, R. R.; LOPES, P. S. Contemporary groups in the genetic evaluation of Nellore cattle using Bayesian inference. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 52, n. 8, p. 643-651, fev. 2017. Título em português: Grupos de contemporâneos na avaliação genética de gado Nelore por inferência bayesiana.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 100. | | PEIXOTO, M. G. C. D.; CANDA, R. A.; BRUNELI, F. A. T.; SANTOS, G. G. dos; VENTURA, H. T.; LOPES, P. S. Correlation between PTA for milk and beef traits of Guzerá animals from dual-purpose herds in Brazil. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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