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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
02/12/2015 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SANTOS, V. S.; MARTINS FILHO, S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARAES, S. E. F.; GLORIA, L. S.; SILVA, F. F. |
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Afiliação: |
V. S. SANTOS, Universidade Federal de Viçosa; S. MARTINS FILHO, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; C. F. AZEVEDO, Universidade Federal de Viçosa; P. S. LOPES, Universidade Federal de Viçosa; S. E. F. GUIMARAES, Universidade Federal de Viçosa; L. S. GLORIA, Universidade Federal de Viçosa; F. F. SILVA, Universidade Federal de Viçosa. |
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Título: |
Genomic selection for slaughter age in pigs using the Cox frailty model. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 14, n. 4, p. 12616-12627, 2015. |
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ISBN: |
http://dx.doi.org/10.4238/2015.October.19.5 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this study was to compare genomic selection methodologies using a linear mixed model and the Cox survival model. We used data from an F2 population of pigs, in which the response variable was the time in days from birth to the culling of the animal and the covariates were 238 markers [237 single nucleotide polymorphism (SNP) plus the halothane gene]. The data were corrected for fixed effects, and the accuracy of the method was determined based on the correlation of the ranks of predicted genomic breeding values (GBVs) in both models with the corrected phenotypic values. The analysis was repeated with a subset of SNP markers with largest absolute effects. The results were in agreement with the GBV prediction and the estimation of marker effects for both models for uncensored data and for normality. However, when considering censored data, the Cox model with a normal random effect (S1) was more appropriate. Since there was no agreement between the linear mixed model and the imputed data (L2) for the prediction of genomic values and the estimation of marker effects, the model S1 was considered superior as it took into account the latent variable and the censored data. Marker selection increased correlations between the ranks of predicted GBVs by the linear and Cox frailty models and the corrected phenotypic values, and 120 markers were required to increase the predictive ability for the characteristic analyzed. |
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Palavras-Chave: |
Censured data; Dado censurado; Mixed model; Modelo mixto. |
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Thesagro: |
Polimorfismo. |
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Thesaurus Nal: |
polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/134577/1/2015-M.Deon.GMR-Genomic.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 171 | |
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| 9. | | ROSSI, R. M.; MARTINS, E. N.; LOPES, P. S.; SILVA, F. F. e. Análise bayesiana univariada e bivariada para a conversão alimentar de suínos da raça Piau. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 10, p. 754-761, out. 2014. Título em inglês: Univariate and bivariate Bayesian analysis for feed conversion of the Piau swine breed.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 12. | | MOTA, R. R.; TEMPELMAN, R. J.; CARDOSO, F. F.; AGUILAR, I. G.; LOPES, P. S. Genomic wide-selection for tick resistance in Hereford and Braford cattle via reaction norm model. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver, British Columbia, Canada. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 15. | | FERNANDES, L. A.; RAMOS, S. J.; VALADARES, S. V.; LOPES, P. S. N.; FAQUIN, V. Fertilidade do solo, nutrição mineral e produtividade da bananeira irrigada por dez anos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v.43, n. 11, p. 1575-1581, nov. 2008 Título em inglês: Soil fertility, plant mineral nutrition and productivity of irrigated banana for a ten-year period.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 18. | | ARAÚJO, A. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; COLUMBIANO, V. S.; TEIXEIRA, M. R.; LOPES, P. S. Descrição de cinco loci de microsatélite em uma população de caprinos da raça Alpina e sua utilização em testes de confirmação de paternidade em casos onde o genótipo materno é ou não informado. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Otimizando a produção animal: anais. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2003. 5 f. 1 CD ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 20. | | TORAL, F. L. B.; TORRES JÚNIOR, R. A. A.; LOPES, P. S.; SILVA, L. O. C. Efeito da idade ao parto e composição genética da vaca sobre o peso à desmama de bezerros dos grupos genéticos formadores da Raça Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 2., 2006, Campo Grande, MS. Anais [da]... 2. ed. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2006. 1 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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